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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/63669
PADRONIZAÇÃO DA ESPECTROMETRIA DE MASSA MALDI TOF MS PARA A IDENTIFICAÇÃO RÁPIDA DE FUNGOS LEVEDURIFORMES A PARTIR DE HEMOCULTURAS POSITIVAS
Diagnóstico
MALDI-TOF MS
Fungos Leveduriformes
Hemocultura
Fungos
Leveduras
Diagnóstico
Espectrometria de Massas
Castro, Gabriela Souza de | Date Issued:
2021
Author
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
As infecções de corrente sanguínea causadas por fungos são de difícil diagnóstico e estão associadas à elevada morbidade e mortalidade constituindo um grave problema de saúde pública. A hemocultura é o padrão de referência para o diagnóstico. A espectrometria de massa por ionização e dessorção a laser assistida por matriz-tempo de voo (MALDI TOF - MS) é uma técnica promissora na identificação de microrganismos diretamente do caldo de hemocultura a partir da detecção de positividade, sendo possível conhecer o patógeno infeccioso em aproximadamente uma hora. O estudo teve como objetivo avaliar a aplicabilidade do protocolo de diagnóstico rápido por MALDI TOF-MS em infecções de corrente sanguínea por fungos leveduriformes. Um total de 232 hemoculturas foram avaliadas através de uma análise retrospectiva de banco de dados, oriundas de 95 pacientes ambulatoriais e hospitalares da Rede D’Or São Luiz entre os anos de 2012 e 2018. Alíquotas das hemoculturas foram submetidas à técnica do protocolo rápido, consistindo em processos de centrifugação e lavagem de sedimento, e em concomitância subcultivadas em meios de cultura. Para determinação da identificação, os espectros testes foram comparados às cepas de referência, gerando diferentes pontuações de escore. C. parapsilosis foi a espécie predominante no estudo. 38,7% dos isolados foram identificados com pontuações de escore ≥ 1.7 pelo protocolo rápido e 100 por cento pelo subcultivo O valor da mediana do escore foi de 1.6 para o protocolo rápido e 2.0 para o subcultivo. C. tropicalis obteve a maior proporção de acerto no protocolo rápido. No ano de 2016 foram observadas as maiores pontuações de escore para o protocolo rápido, com cerca de 70 por cento. Em conclusão, a análise retrospectiva da aplicação do protocolo rápido demonstrou a identificação direta do patógeno clínico em 38,7% dos casos de fungemia, sendo estes notificados em 40 minutos após a positividade da hemocultura. A vantagem da identificação precoce evidenciou a otimização do diagnóstico clínico em pelo menos 24 horas
Abstract
Bloodstream infections caused by fungi are difficult to diagnose and are associated with high morbidity and mortality, constituting a serious public health problem. Blood culture is the reference standard for diagnosis. Matrix-assisted time-of-flight laser desorption and ionization mass spectrometry (MALDI TOF - MS) is a promising technique in the identification of microorganisms directly from the blood culture broth from the detection of positivity, making it possible to know the infectious pathogen in approximately one hour. The study aimed to assess the applicability of the rapid diagnosis protocol by MALDI TOF-MS in bloodstream infections caused by yeast fungi. A total of 232 blood cultures were evaluated through a retrospective database analysis, from 95 outpatients and hospitals of Rede D'Or São Luiz between the years 2012 and 2018. Blood culture aliquots were submitted to the rapid protocol technique, consisting of centrifugation and sediment washing processes, and concomitance subcultured in culture media To determine the identification, the test spectra were compared to the reference strains, generating different score values. C. parapsilosis was the predominant species in the study. 38.7% of the isolates were identified with a score ≥ 1.7 by the rapid protocol and 100 percent by subculture. The median value of the score was 1.6 for the rapid protocol and 2.0 for the subculture. C. tropicalis obtained the highest proportion of correct answers in the rapid protocol. In 2016, the highest score values for the rapid protocol were observed, with about 70 percent. In conclusion, the retrospective analysis of the application of the rapid protocol demonstrated direct identification of the clinical pathogen in 38.7% of fungemia cases, which were notified within 40 minutes of positive blood culture. The advantage of early identification showed the optimization of clinical diagnosis in at least 24 hours
Keywords in Portuguese
Infecções de Corrente SanguíneaDiagnóstico
MALDI-TOF MS
Fungos Leveduriformes
DeCS
Espectrometria de Massas por Ionização e Dessorção a Laser Assistida por MatrizHemocultura
Fungos
Leveduras
Diagnóstico
Espectrometria de Massas
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