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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/63822
CARACTERIZAÇÃO DA MICROBIOTA DE ARTRÓPODES VETORES ASSOCIADA A COMPETÊNCIA VETORIAL
Mota, Tiago Feitosa | Date Issued:
2023
Alternative title
Characterization of arthropod vectors' microbiota associated with vector competenceAuthor
Advisor
Co-advisor
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.
Abstract in Portuguese
INTRODUÇÃO: Doenças transmitidas por vetores impactam a saúde em todo o mundo colocando em risco em torno de 80% da população mundial. Dentre os vetores artrópodes responsáveis pela transmissão dessas doenças destacam-se mosquitos e carrapatos, onde algumas espécies possuem competência vetorial (CV) de transmitirem um patógeno, vetores mono competentes (VMC), ou diversos patógenos, vetores pluri competentes (VPC). Além disso, em algumas infecções virais em artrópodes há diferenças na susceptibilidade em diferentes espécies de um determinado grupo de artrópodes. Tais diferenças na CV podem estar associadas à microbiota do artrópode que participa na modulação da resposta imune ou homeostase metabólica do hospedeiro. O estudo da microbiota permite detectar algumas espécies ou gêneros de bactéria que estão associadas a um perfil de susceptibilidade ou refratariedade. Essas bactérias são importantes para o estudo de novos métodos de controle biológico que visam modular a microbiota diminuindo ou bloqueando a infecção de um patógeno no artrópode. OBJETIVO: Assim, o objetivo do presente trabalho foi de identificar biomarcadores bacterianos em mosquitos e carrapatos associados à CV. MÉTODO: Para classificar as espécies de carrapato quanto a um perfil VMC ou VPC, foi realizada uma revisão de literatura sobre estudos de CV de espécies de carrapato com dados de sequenciamento de 16S rRNA bacteriano. Após a classificação, os dados de microbioma de carrapatos foram selecionados, processados e analisados em conjunto comparando a microbiota de carrapatos VMC e VPC. No caso de mosquitos, foram selecionados dados de 16S rRNA bacteriano de espécies refratárias ou suscetíveis ao vírus Zika (ZIKV). Assim, amostras de espécies de mosquito refratárias e suscetíveis foram selecionadas, processadas e analisadas em conjunto comparando os perfis de susceptibilidade ao ZIKV. Em ambos os trabalhos a composição bacteriana, diversidades alfa e beta, análise diferencial de abundância, análise funcional e redes de co-ocorrência foram avaliadas a fim de caracterizar a microbiota. RESULTADOS: Bactérias dos gêneros Rickettsia, Staphylococcus e Corynebacterium foram associadas à carrapatos VPC. A diversidade alfa foi maior em carrapatos VPC e houve diferenças estatisticamente significantes na diversidade beta. Vias metabólicas associadas ao controle do estresse oxidativo, dTDP-L-rhamnose e resistência a β-Lactam foram mais abundantes neste grupo. Além disso, a comunidade bacteriana se mostrou menos complexa e conectada em carrapatos VPC. Em relação aos mosquitos suscetíveis ou refratários ao ZIKV, Pseudomonas, Serratia, Halomonas e Wolbachia associadas a um perfil de susceptibilidade. Não houve diferenças estatisticamente significantes na diversidade microbiana entre os mosquitos suscetíveis ou refratários. Por outro lado, os mosquitos suscetíveis ao ZIKV se mostraram com um metabolismo mais enriquecido com redes de co-ocorrência menos densas e conectadas. CONCLUSÃO: O presente trabalho caracterizou a microbiota de vetores artrópodes associada à sua CV identificando alguns gêneros de bactéria que podem ser investigadas em futuros trabalhos a fim de reduzir a CV de artrópodes. Além disso, identificou algumas vias metabólicas que podem estar relacionadas a uma maior susceptibilidade para um ou mais patógenos
Abstract
INTRODUCTION: Vector-borne diseases impact public health around the world, putting around 80% of the world's population at risk. Among the arthropod vectors responsible for the transmission of these diseases, mosquitoes and ticks stand out, where some species have vector competence (VC) to transmit one pathogen, mono-competent vectors (MCV), or several pathogens, pluri-competent vectors (PCV). Furthermore, in some viral infections in arthropods there are differences in susceptibility in different species of a given group of arthropods. Such differences in VC may be associated with the arthropod’s microbiota that participates in modulating the host's immune response or metabolic homeostasis. The study of the microbiota makes it possible to detect some bacterial species or genera that are associated with a susceptibility or refractoriness profile. These bacteria are important for the study of new biological control methods that aim to modulate the microbiota by reducing or blocking the infection of a pathogen in the arthropod. OBJECTIVE: Thus, the objective of the present work was to identify bacterial biomarkers in mosquitoes and ticks associated with VC. METHOD: To classify tick species according to a MCV or PCV profile, a literature review on VC studies of tick species with bacterial 16S rRNA sequencing data was performed. After classification, tick microbiome data were selected, processed and analyzed together by comparing MCV and PCV tick microbiota. In the case of mosquitoes, bacterial 16S rRNA data from species refractory or susceptible to the Zika virus (ZIKV) were selected. Thus, samples of refractory and susceptible mosquito species were selected, processed and analyzed together comparing susceptibility profiles to ZIKV. In both studies, bacterial composition, alpha and beta diversities, differential abundance analysis, functional analysis and co-occurrence networks were evaluated in order to characterize the microbiota. RESULTS: Bacteria from the genera Rickettsia, Staphylococcus and Corynebacterium were associated with PCV ticks. Alpha diversity was higher in PCV ticks and there were statistically significant differences in beta diversity. Metabolic pathways associated with the control of oxidative stress, dTDP-L-rhamnose and resistance to β-Lactam were more abundant in this group. Furthermore, the bacterial community was less complex and connected in PCV ticks. In relation to ZIKV susceptible or refractory mosquitoes, Pseudomonas, Serratia, Halomonas and Wolbachia were associated with a susceptibility profile. There were no statistically significant differences in microbial diversity between susceptible or refractory mosquitoes. On the other hand, ZIKV susceptible mosquitoes showed a more enriched metabolism with less dense and connected co-occurrence networks. CONCLUSION: The present work characterized the microbiota of arthropod vectors associated with their VC, identifying some bacterial genera that can be investigated in future work in order to reduce the VC of arthropods. Furthermore, it identified some metabolic pathways that may be related to greater susceptibility to one or more pathogens
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