| Author | Vinhaes, Caian L. | |
| Author | Fukutani, Eduardo R. | |
| Author | Santana, Gabriel C. | |
| Author | Arriaga, Marı´a B. | |
| Author | Duarte, Beatriz Barreto | |
| Author | Pereira, Mariana Araújo | |
| Author | Bezerril, Mateus Maggitti | |
| Author | Andrade, Alice M.S. | |
| Author | Figueiredo, Marina C. | |
| Author | Milne, Ginger L. | |
| Author | Rolla, Valeria C. | |
| Author | Kristki, Afrânio L. | |
| Author | Santos, Marcelo Cordeiro | |
| Author | Sterling, Timothy R. | |
| Author | Andrade, Bruno B. | |
| Author | Queiroz, Artur T.L. | |
| Access date | 2024-05-15T19:18:05Z | |
| Available date | 2024-05-15T19:18:05Z | |
| Document date | 2024 | |
| Citation | VINHAES, Caian L. et al. An integrative multi-omics approach to characterize interactions between tuberculosis and diabetes mellitus. iScience, v. 27, n. 3, p. 1-14, 2024. | en_US |
| ISSN | 2589-0042 | en_US |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/64082 | |
| Sponsorship | Ministério da Saúde, Brasil; Secretaria de Ciência e Tecnologia (SCTIE); Departamento de Ciência e Tecnologia (DECIT).
National Institute of Allergy and Infectious Diseases.
National Institutes of Health (NIH) .
Fundação Civil de Pesquisa e Desenvolvimento (CRDF).
Programa Intramural de Pesquisa da Fundação Oswaldo Cruz..
Programa Intramural de Pesquisa da Fundação José Silveira.
Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq).
Consejo Nacional de Ciencia, Tecnologı´a e Innovación Tecnológica (CONCYTEC).
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES). | en_US |
| Language | eng | en_US |
| Publisher | Cell Press | en_US |
| Rights | open access | en_US |
| Subject in Portuguese | Bioinformática | en_US |
| Subject in Portuguese | Ciências biológicas | en_US |
| Subject in Portuguese | Ciências da saúde | en_US |
| Subject in Portuguese | Medicina interna | en_US |
| Subject in Portuguese | Informática médica | en_US |
| Subject in Portuguese | Especialidade médica | en_US |
| Subject in Portuguese | Medicamento | en_US |
| Subject in Portuguese | Ciências naturais | en_US |
| Title | An integrative multi-omics approach to characterize interactions between tuberculosis and diabetes mellitus | en_US |
| Type | Article | en_US |
| DOI | 10.1016/j.isci.2024.109135 | |
| Abstract | Tuberculosis-diabetes mellitus (TB-DM) is linked to a distinct inflammatory profile, which can be assessed using multi-omics analyses. Here, a machine learning algorithm was applied to multi-platform data, including cytokines and gene expression in peripheral blood and eicosanoids in urine, in a Brazilian multi-center TB cohort. There were four clinical groups: TB-DM(n = 24), TB only(n = 28), DM(HbA1c ≥ 6.5%) only(n = 11), and a control group of close TB contacts who did not have TB or DM(n = 13). After cross-validation, baseline expression or abundance of MMP-28, LTE-4, 11-dTxB2, PGDM, FBXO6, SECTM1, and LINCO2009 differentiated the four patient groups. A distinct multi-omic-derived, dimensionally reduced, signature was associated with TB, regardless of glycemic status. SECTM1 and FBXO6 mRNA levels were positively correlated with sputum acid-fast bacilli grade in TB-DM. Values of the biomarkers decreased during the course of anti-TB therapy. Our study identified several markers associated with the pathophysiology of TB-DM that could be evaluated in future mechanistic investigations. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Pesquisa Clínica e Translacional. Salvador, BA, Brasil / Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brazil / Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública (EBMSP). Programa de Pós-graduação em Medicina e Saúde Humana. Salvador, BA, Brasil / Hospital Português da Bahia. Departamento de Infectologia. Salvador, BA, Brasil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brazil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para Saúde. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Pesquisa Clínica e Translacional. Salvador, BA, Brasil / Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brazil / Universidade Salvador. Curso de Medicina. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN, USA. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Pesquisa Clínica e Translacional. Salvador, BA, Brasil / Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brasil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil / Universidade Salvador. Curso de Medicina. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Programa Acadêmico de Tuberculose. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Pesquisa Clínica e Translacional. Salvador, BA, Brasil / Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brazil / Universidade Salvador. Curso de Medicina. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Faculdade de Medicina. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brazil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Pesquisa Clínica e Translacional. Salvador, BA, Brasil / Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brazil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN, USA. | en_US |
| Affilliation | Division of Clinical Pharmacology. Department of Medicine. Vanderbilt University School of Medicine. Nashville, TN, USA. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Programa Acadêmico de Tuberculose. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Medicina Tropical Doutor Heitor Vieira Dourado. Manaus, AM, Brasil / Universidade do Estado do Amazonas. Programa de Pós-graduação em Medicina Tropical. Manaus, AM, Brasil / Universidade Nilton Lins. Manaus, AM, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN, USA. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Pesquisa Clínica e Translacional. Salvador, BA, Brasil / Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brasil / Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública (EBMSP). Programa de Pós-graduação em Medicina e Saúde Humana. Salvador, BA, Brasil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil / Universidade Salvador. Curso de Medicina. Salvador, BA, Brasil / Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN, USA / Universidade Federal da Bahia. Faculdade de Medicina. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brasil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para Saúde. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
| Subject | Bioinformatics | en_US |
| Subject | Biological sciences | en_US |
| Subject | Health sciences | en_US |
| Subject | Internal medicine | en_US |
| Subject | Medical informatics | en_US |
| Subject | Medical specialty | en_US |
| Subject | Medicine | en_US |
| Subject | Natural sciences | en_US |
| DeCS | Biologia computacional | en_US |
| DeCS | Ciências da saúde | en_US |
| DeCS | Medicina interna | en_US |
| DeCS | Informática médica | en_US |
| DeCS | Medicina | en_US |
| xmlui.metadata.dc.subject.ods | 03 Saúde e Bem-Estar | |
