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03 Saúde e Bem-Estar
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AN INTEGRATIVE MULTI-OMICS APPROACH TO CHARACTERIZE INTERACTIONS BETWEEN TUBERCULOSIS AND DIABETES MELLITUS
Vinhaes, Caian L. et al. | Date Issued: 2024
Author
Vinhaes, Caian L.
Fukutani, Eduardo R.
Santana, Gabriel C.
Arriaga, Marı´a B.
Duarte, Beatriz Barreto
Pereira, Mariana Araújo
Bezerril, Mateus Maggitti
Andrade, Alice M.S.
Figueiredo, Marina C.
Milne, Ginger L.
Rolla, Valeria C.
Kristki, Afrânio L.
Santos, Marcelo Cordeiro
Sterling, Timothy R.
Andrade, Bruno B.
Queiroz, Artur T.L.
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Pesquisa Clínica e Translacional. Salvador, BA, Brasil / Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brazil / Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública (EBMSP). Programa de Pós-graduação em Medicina e Saúde Humana. Salvador, BA, Brasil / Hospital Português da Bahia. Departamento de Infectologia. Salvador, BA, Brasil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil.
Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brazil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para Saúde. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Pesquisa Clínica e Translacional. Salvador, BA, Brasil / Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brazil / Universidade Salvador. Curso de Medicina. Salvador, BA, Brasil.
Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN, USA.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Pesquisa Clínica e Translacional. Salvador, BA, Brasil / Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brasil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil / Universidade Salvador. Curso de Medicina. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Programa Acadêmico de Tuberculose. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Pesquisa Clínica e Translacional. Salvador, BA, Brasil / Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brazil / Universidade Salvador. Curso de Medicina. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Faculdade de Medicina. Salvador, BA, Brasil.
Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brazil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Pesquisa Clínica e Translacional. Salvador, BA, Brasil / Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brazil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil.
Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN, USA.
Division of Clinical Pharmacology. Department of Medicine. Vanderbilt University School of Medicine. Nashville, TN, USA.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Faculdade de Medicina. Programa Acadêmico de Tuberculose. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Medicina Tropical Doutor Heitor Vieira Dourado. Manaus, AM, Brasil / Universidade do Estado do Amazonas. Programa de Pós-graduação em Medicina Tropical. Manaus, AM, Brasil / Universidade Nilton Lins. Manaus, AM, Brasil.
Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN, USA.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Pesquisa Clínica e Translacional. Salvador, BA, Brasil / Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brasil / Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública (EBMSP). Programa de Pós-graduação em Medicina e Saúde Humana. Salvador, BA, Brasil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil / Universidade Salvador. Curso de Medicina. Salvador, BA, Brasil / Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN, USA / Universidade Federal da Bahia. Faculdade de Medicina. Salvador, BA, Brasil.
Multinational Organization Network Sponsoring Translational and Epidemiological Research (MONSTER) Initiative. Salvador, BA, Brasil / Instituto de Pesquisa Clínica e Translacional, Faculdade de Tecnologia e Ciências. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para Saúde. Salvador, BA, Brasil.
Abstract
Tuberculosis-diabetes mellitus (TB-DM) is linked to a distinct inflammatory profile, which can be assessed using multi-omics analyses. Here, a machine learning algorithm was applied to multi-platform data, including cytokines and gene expression in peripheral blood and eicosanoids in urine, in a Brazilian multi-center TB cohort. There were four clinical groups: TB-DM(n = 24), TB only(n = 28), DM(HbA1c ≥ 6.5%) only(n = 11), and a control group of close TB contacts who did not have TB or DM(n = 13). After cross-validation, baseline expression or abundance of MMP-28, LTE-4, 11-dTxB2, PGDM, FBXO6, SECTM1, and LINCO2009 differentiated the four patient groups. A distinct multi-omic-derived, dimensionally reduced, signature was associated with TB, regardless of glycemic status. SECTM1 and FBXO6 mRNA levels were positively correlated with sputum acid-fast bacilli grade in TB-DM. Values of the biomarkers decreased during the course of anti-TB therapy. Our study identified several markers associated with the pathophysiology of TB-DM that could be evaluated in future mechanistic investigations.
Keywords in Portuguese
Bioinformática
Ciências biológicas
Ciências da saúde
Medicina interna
Informática médica
Especialidade médica
Medicamento
Ciências naturais
 
Keywords
Bioinformatics
Biological sciences
Health sciences
Internal medicine
Medical informatics
Medical specialty
Medicine
Natural sciences
 
DeCS
Biologia computacional
Ciências da saúde
Medicina interna
Informática médica
Medicina
 
Publisher
Cell Press
Citation
VINHAES, Caian L. et al. An integrative multi-omics approach to characterize interactions between tuberculosis and diabetes mellitus. iScience, v. 27, n. 3, p. 1-14, 2024.
DOI
10.1016/j.isci.2024.109135
ISSN
2589-0042