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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/65899
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Sustainable Development Goals
03 Saúde e Bem-Estar10 Redução das desigualdades
16 Paz, Justiça e Instituições Eficazes
Collections
Metadata
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INSIGHTS INTO SARS-COV-2 SURVEILLANCE AMONG PRISON POPULATIONS IN MATO GROSSO DO SUL, BRAZIL, IN 2022
Author
Silva, Liliane Ferreira da
Alcantara, Luiz Carlos Júnior
Fonseca, Vagner de Souza
Frías Suárez, Diego Gervasio
Umaki, Marina Castilhos Souza
Lichs, Gislene Garcia de Castro
Esposito, Ana Olívia Pascoto
Santos Junior, Joilson Xavier dos
Fritsch, Hegger Machado
Lima, Maurício Teixeira
Oliveira, Carla Santos de
Arruda, Larissa Domingues Castilho de
Maziero, Lívia de Mello Almeida
Barretos, Ellen Caroline Rodrigues
Oshiro, Paulo Eduardo Tsuha
Mendes, Evellyn Fernanda Gimenes
Cardoso, Lucélia de Freitas
Lemos, Everton Ferreira
Lourenço, José
Melo, Carlos Frederico Campelo de Albuquerque e
Said, Rodrigo Fabiano do Carmo
Rosewell, Alexander
Demarchi, Luiz Henrique Ferraz
Croda, Julio Henrique Rosa
Giovanetti, Marta
Gonçalves, Crhistinne Cavalheiro Maymone
Alcantara, Luiz Carlos Júnior
Fonseca, Vagner de Souza
Frías Suárez, Diego Gervasio
Umaki, Marina Castilhos Souza
Lichs, Gislene Garcia de Castro
Esposito, Ana Olívia Pascoto
Santos Junior, Joilson Xavier dos
Fritsch, Hegger Machado
Lima, Maurício Teixeira
Oliveira, Carla Santos de
Arruda, Larissa Domingues Castilho de
Maziero, Lívia de Mello Almeida
Barretos, Ellen Caroline Rodrigues
Oshiro, Paulo Eduardo Tsuha
Mendes, Evellyn Fernanda Gimenes
Cardoso, Lucélia de Freitas
Lemos, Everton Ferreira
Lourenço, José
Melo, Carlos Frederico Campelo de Albuquerque e
Said, Rodrigo Fabiano do Carmo
Rosewell, Alexander
Demarchi, Luiz Henrique Ferraz
Croda, Julio Henrique Rosa
Giovanetti, Marta
Gonçalves, Crhistinne Cavalheiro Maymone
Affilliation
Governo de Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brasil / Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Faculdade de Medicina. Campo Grande, MS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil / Climate Amplified Diseases and Epidemics. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Climate Amplified Diseases and Epidemics. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade do Estado da Bahia. Departamento de Ciências Exatas e da Terra. Salvador, BA, Brasil / Stellenbosch University. School of Data Science and Computational Thinking. Centre for Epidemic Response and Innovation. Stellenbosch, South Africa.
Universidade do Estado da Bahia. Departamento de Ciências Exatas e da Terra. Salvador, BA, Brasil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria Estadual de Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Campo Grande, MS, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria Estadual de Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Campo Grande, MS, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria Estadual de Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Campo Grande, MS, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil/Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. School of Medicine. Campo Grande, MS, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil/Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. School of Medicine. Campo Grande, MS, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil
Universidade Estadual do Mato Grosso do Sul. School of Medicine. Campo Grande, MS, Brazil.
Faculdade de Medicina. Universidade Católica Portuguesa. Biomedical Research Center, Lisbon, Portugal/Climate Amplified Diseases and Epidemics. Lisbon, Portugal.
Coordenação de Vigilância, Preparação e Resposta à Emergências e Desastres. Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brazil.
Coordenação de Vigilância, Preparação e Resposta à Emergências e Desastres. Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brazil.
Coordenação de Vigilância, Preparação e Resposta à Emergências e Desastres. Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria Estadual de Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Campo Grande, MS, Brazil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Faculdade de Medicina. Campo Grande, MS, Brazil/Department of Epidemiology of Microbial Diseases. Yale University School of Public Health. New Haven, CT, United States of America/Fundação Oswaldo Cruz, Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brazil/ Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brazil.
Department of Sciences and Technologies for Sustainable Development and One Health. Universita Campus Bio-Medico di Roma. Selcetta, Italy/Oswaldo Cruz Foundation. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil/Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. School of Medicine. Campo Grande, MS, Brazil/Mato Grosso do Sul. Secretaria Estadual de Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Campo Grande, MS, Brazil/Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Faculdade de Medicina. Campo Grande, MS, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil / Climate Amplified Diseases and Epidemics. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Climate Amplified Diseases and Epidemics. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade do Estado da Bahia. Departamento de Ciências Exatas e da Terra. Salvador, BA, Brasil / Stellenbosch University. School of Data Science and Computational Thinking. Centre for Epidemic Response and Innovation. Stellenbosch, South Africa.
Universidade do Estado da Bahia. Departamento de Ciências Exatas e da Terra. Salvador, BA, Brasil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria Estadual de Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Campo Grande, MS, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria Estadual de Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Campo Grande, MS, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria Estadual de Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Campo Grande, MS, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil/Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. School of Medicine. Campo Grande, MS, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil/Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. School of Medicine. Campo Grande, MS, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil
Universidade Estadual do Mato Grosso do Sul. School of Medicine. Campo Grande, MS, Brazil.
Faculdade de Medicina. Universidade Católica Portuguesa. Biomedical Research Center, Lisbon, Portugal/Climate Amplified Diseases and Epidemics. Lisbon, Portugal.
Coordenação de Vigilância, Preparação e Resposta à Emergências e Desastres. Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brazil.
Coordenação de Vigilância, Preparação e Resposta à Emergências e Desastres. Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brazil.
Coordenação de Vigilância, Preparação e Resposta à Emergências e Desastres. Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria Estadual de Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Campo Grande, MS, Brazil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Faculdade de Medicina. Campo Grande, MS, Brazil/Department of Epidemiology of Microbial Diseases. Yale University School of Public Health. New Haven, CT, United States of America/Fundação Oswaldo Cruz, Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brazil/ Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brazil.
Department of Sciences and Technologies for Sustainable Development and One Health. Universita Campus Bio-Medico di Roma. Selcetta, Italy/Oswaldo Cruz Foundation. Rio de Janeiro, RJ, Brazil.
Mato Grosso do Sul. Secretaria de Estado de Saúde. Campo Grande, MS, Brazil/Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. School of Medicine. Campo Grande, MS, Brazil/Mato Grosso do Sul. Secretaria Estadual de Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Campo Grande, MS, Brazil/Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Faculdade de Medicina. Campo Grande, MS, Brazil.
Abstract
This study examines the epidemiological and genomic characteristics, along with the transmission dynamics, of SARS-CoV-2 within prison units I and II in Campo Grande, Mato Grosso do Sul, Brazil. Conducted between May and October 2022, it reveals how the virus spreads in the confined settings of prisons, emphasizing the roles of overcrowded cells, frequent transfers, and limited healthcare access. The research involved 1927 participants (83.93% of the total prison population) and utilized nasopharyngeal swabs and RT-qPCR testing for detection. Contact tracing monitored exposure within cells. Out of 2108 samples, 66 positive cases were identified (3.13%), mostly asymptomatic (77.27%), with the majority aged 21-29 and varying vaccination statuses. Next-generation sequencing generated 28 whole genome sequences, identifying the Omicron variant (subtypes BA.2 and BA.5) with 99% average coverage. Additionally, the study seeks to determine the relationship between immunization levels and the incidence of SARS-CoV-2 cases within this enclosed population. The findings underscore the necessity of comprehensive control strategies in prisons, including rigorous screening, isolation protocols, vaccination, epidemiological monitoring, and genomic surveillance to mitigate disease transmission and protect both the incarcerated population and the broader community.
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