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PSEUDOALTEROMONAS SIMPLEX SP. NOV. ISOLATED FROM THE SKIN OF BANDTAIL PUFFER FISH (SPHOEROIDES SPENGLERI)
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Affilliation
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
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Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
A novel bacterial isolate A520ᵀ (A520ᵀ = CBAS 737ᵀ = CAIM 1944ᵀ) was obtained from the skin of bandtail puffer fish Sphoeroides spengleri (Tetraodontidae Family), collected in Arraial do Cabo (Rio de Janeiro, Brazil). A520ᵀ is Gram-stain-negative, flagellated and aerobic bacteria. Optimum growth occurs at 25–30 °C in the presence of 3% NaCl. The genome sequence of the novel isolate consisted of 4.5 Mb (4082 coding genes and G+C content of 41.1%). The closest phylogenetic neighbor was Pseudoalteromonas shioyasakiensis JCM 18891ᵀ (97.9% 16S rRNA sequence similarity, 94.8% Average Amino Acid Identity, 93% Average Nucleotide Identity and 51.8% similarity in Genome-to-Genome-Distance). Several in silico phenotypic features are useful to differentiate A520ᵀ from its closest phylogenetic neighbors, including trehalose, D-mannose, cellobiose, pyrrolidonyl-beta-naphthylamide, starch hydrolysis, D-xylose, lactose, tartrate utilization, sucrose, citrate, glycerol, mucate and acetate utilization, malonate, glucose oxidizer, gas from glucose, nitrite to gas, L-rhamnose, ornithine decarboxylase, lysine decarboxylase and yellow pigment. The genome of the novel species contains 3 gene clusters (~ 66.81 Kbp in total) coding for different types of bioactive compounds that could indicate ecological roles pertaining to the bandtail puffer fish host. Based on genome-based taxonomic approach, strain A520ᵀ (A520ᵀ = CBAS 737ᵀ = CAIM 1944ᵀ) is proposed as a new species, Pseudoalteromonas simplex sp. nov.
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