| Author | Cardoso, Sabrina Fernandes | |
| Author | Yoshikawa, Andre Akira Gonzaga | |
| Author | Pinheiro, Iara Carolini | |
| Author | Granella, Lucilene Wildner | |
| Author | Lima, Dinair Couto | |
| Author | Neves, Maycon Sebastião Alberto Santos | |
| Author | Mansur, Daniel Santos | |
| Author | Pitaluga, André Nóbrega | |
| Author | Pitaluga, Luísa Damazio Rona | |
| Access date | 2024-10-08T16:55:20Z | |
| Available date | 2024-10-08T16:55:20Z | |
| Document date | 2024 | |
| Citation | CARDOSO, Sabrina Fernandes et al. Development and validation of RT-LAMP for detecting yellow fever virus in non-human primates samples from Brazil. Nature, v. 14, n. 22520, p. 1-10, 28 Sept. 2024. | |
| ISSN | 0028-0836 | |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/66408 | |
| Description | Produção científica do Laboratório de Biologia Molecular de Parasitos e Vetores. | pt_BR |
| Description | Produção científica do Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. | pt_BR |
| Sponsorship | The study was funded by IOC—FIOCRUZ, National Council for Scientific and Technological Development MCTI/CNPq/CAPES/FAPs no 16/2014, Wellcome Trust, 207486/Z/17/Z. | |
| Language | eng | en_US |
| Publisher | Nature Research | |
| Rights | open access | |
| Title | Development and validation of RT-LAMP for detecting yellow fever virus in non-human primates samples from Brazil | en_US |
| Type | Article | |
| DOI | 10.1038/s41598-024-74020-4 | |
| Abstract | Monitoring yellow fever in non-human primates (NHPs) is an early warning system for sylvatic yellow fever outbreaks, aiding in preventing human cases. However, current diagnostic tests for this disease, primarily relying on RT-qPCR, are complex and costly. Therefore, there is a critical need for simpler and more cost-effective methods to detect yellow fever virus (YFV) infection in NHPs, enabling early identification of viral circulation. In this study, an RT-LAMP assay for detecting YFV in NHP samples was developed and validated. Two sets of RT-LAMP primers targeting the YFV NS5 and E genes were designed and tested together with a third primer set to the NS1 locus using NHP tissue samples from Southern Brazil. The results were visualized by colorimetry and compared to the RT-qPCR test. Standardization and validation of the RT-LAMP assay demonstrated 100% sensitivity and specificity compared to RT-qPCR, with a detection limit of 12 PFU/mL. Additionally, the cross-reactivity test with other flaviviruses confirmed a specificity of 100%. Our newly developed RT-LAMP diagnostic test for YFV in NHP samples will significantly contribute to yellow fever monitoring efforts, providing a simpler and more accessible method for viral early detection. This advancement holds promise for enhancing surveillance and ultimately preventing the spread of yellow fever. | en_US |
| Affilliation | Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular, Embriologia e Genética. Florianópolis, SC, Brasil / Governo de Santa Catarina. Secretaria da Saúde. Diretoria de Vigilância Epidemiológica. Florianópolis, SC, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular, Embriologia e Genética. Florianópolis, SC, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular, Embriologia e Genética. Florianópolis, SC, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. Florianópolis, SC, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia. Florianópolis, SC, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Parasitos e Vetores. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular, Embriologia e Genética. Florianópolis, SC, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Entomologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Subject | Diagnosis | en_US |
| Subject | Yellow fever virus | en_US |
| Subject | Yellow fever | en_US |
| Subject | RT-LAMP | en_US |
| e-ISSN | 1476-4687 | |
| xmlui.metadata.dc.subject.ods | 03 Saúde e Bem-Estar | |
| xmlui.metadata.dc.subject.ods | 15 Vida terrestre | |
