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Sustainable Development Goals
03 Saúde e Bem-Estar09 Indústria, inovação e infraestrutura
15 Vida terrestre
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Metadata
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GENOMIC AND PHENOTYPIC CHARACTERIZATION OF THE OROPOUCHE VIRUS STRAIN IMPLICATED IN THE 2022-24 LARGE-SCALE OUTBREAK IN BRAZIL
Author
Azevedo, Elisa de Almeida Neves
Silva, Alexandre Freitas da
Silva, Verônica Gomes da
Machado, Laís Ceschini
Lima, Gustavo Barbosa de
Ishigami, Bruno Issao Matos
Silva, Keilla Maria Paz e
Costa, Mayara Matias de Oliveira Marques da
Falcão, Diego Arruda
Vasconcelos, Andreza Pâmela
Curvêlo, Clintiano da Silva
Naveca, Felipe Gomes
Bezerra, Matheus Filgueira
Campos, Túlio de Lima
Santos, Bartolomeu Acioli dos
Paiva, Marcelo Henrique Santos
Morais, Clarice Neuenschwander Lins de
Wallau, Gabriel da Luz
Silva, Alexandre Freitas da
Silva, Verônica Gomes da
Machado, Laís Ceschini
Lima, Gustavo Barbosa de
Ishigami, Bruno Issao Matos
Silva, Keilla Maria Paz e
Costa, Mayara Matias de Oliveira Marques da
Falcão, Diego Arruda
Vasconcelos, Andreza Pâmela
Curvêlo, Clintiano da Silva
Naveca, Felipe Gomes
Bezerra, Matheus Filgueira
Campos, Túlio de Lima
Santos, Bartolomeu Acioli dos
Paiva, Marcelo Henrique Santos
Morais, Clarice Neuenschwander Lins de
Wallau, Gabriel da Luz
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Recife, PE, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Governo de Pernambuco. Secretaria Executiva de Vigilância em Saúde e Atenção Primária. Recife, PE, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Recife, PE, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Recife, PE, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Recife, PE, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Núcleo de Vigilância de Vírus Emergentes, Reemergentes ou Negligenciados. Manaus, AM, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Microbiologia. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil / Universidade Federal de Pernambuco. Centro Acadêmico do Agreste. Núcleo de Ciências da Vida. Caruaru, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil / National Reference Center for Tropical Infectious Diseases. WHO Collaborating Center for Arbovirus and Hemorrhagic Fever Reference and Research. Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine. Department of Arbovirology and Entomology. Hamburg, Germany.
Laboratório Central de Saúde Pública. Recife, PE, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Governo de Pernambuco. Secretaria Executiva de Vigilância em Saúde e Atenção Primária. Recife, PE, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Recife, PE, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Recife, PE, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Recife, PE, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Núcleo de Vigilância de Vírus Emergentes, Reemergentes ou Negligenciados. Manaus, AM, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Microbiologia. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil / Universidade Federal de Pernambuco. Centro Acadêmico do Agreste. Núcleo de Ciências da Vida. Caruaru, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Virologia e Terapia Experimental. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia. Recife, PE, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil / National Reference Center for Tropical Infectious Diseases. WHO Collaborating Center for Arbovirus and Hemorrhagic Fever Reference and Research. Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine. Department of Arbovirology and Entomology. Hamburg, Germany.
Abstract
The Orthobunyavirus oropoucheense species encompasses a group of arthropod-borne zoonotic viruses transmitted by biting midges to animals including humans. Several large-scale human outbreaks caused by the prototype member of this species, Oropouche virus (OROV) have been documented since the 1970s and were primarily confined to the Amazon basin. However, since 2022, more widespread OROV outbreaks have been unfolding in Brazil and across South America, with cases exported to Cuba, Italy, Spain, USA and Germany. In Brazil, the virus has reached and established communitary transmission in all geographic areas of the country. We isolated, characterized the cytopathic effect and recovered the full genome of two OROV isolates from the 2022–24 outbreak detected in patients from the Pernambuco state. Phylogenetic data supports a direct introduction from the Amazonas state, the epicenter of the epidemics in the country. As case counts accumulate in the state mounting evidence is supporting the establishiment of sustained transmission chains. Continued studies are critical to understand the transmission cycle in this region, including the most important vectors and reservoirs, to appropriately deploy control measures.
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