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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/66948
POTENTIAL INTERACTION BETWEEN PRESENILIN AND METACASPASE ON THE MECHANISM OF PROGRAMED CELL DEATH IN LEISHMANIA INFANTUM.
Author
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Inovação em Doenças de Populações Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
Proteases têm sido consideradas alvos promissores para agentes antiparasitários, essas enzimas ocorrem em todos os organismos, de procariotos a eucariotos e vírus. O objetivo do presente estudo foi fornecer, por meio de técnicas de bioinformática, potenciais alvos promissores relacionados ao mecanismo de apoptose, a fim de desenvolver uma vacina e novos fármacos antiparasitários. Para a identificação das regiões hidrofóbicas, foi utilizada a metodologia de Kyte e Doolittle. As nove regiões hidrofóbicas identificadas na presenilina, com base nas propriedades físico-químicas, sugeriram a ocorrência de regiões transmembrana que foram confirmadas como hélices espalhadas na membrana por THMM. Na estrutura da metacaspase de L. chagasi, além da ocorrência de quatro regiões hidrofóbicas, as análises de THMM previram apenas uma hélice, localizada na porção N-terminal. As análises de hidrofilicidade através do B-EpiPred Server, indicaram a ocorrência de vários resíduos localizados em regiões externas, mostrando que ambas as moléculas possuem números significativos de fragmentos com alta propensão antigênica. A predição de epítopos na estrutura terciária foi obtida pelo servidor ITASSER. No presente trabalho estamos sugerindo a potencial disponibilidade de um peptídeo híbrido originado da presenilina e metacaspase da Leishmania para o desenvolvimento de novos fármacos ou vacina.
Abstract
Proteases have been considered as promising targets for anti-parasitic agents, these enzymes occur in all organisms from prokaryotes to eukaryotes to viruses. The aim of the present study was to provide, through bioinformatics techniques, potential promising targets related to the apoptosis mechanism, in order to develop a vaccine and new anti-parasitic drugs. For the identifying of the hydrophobic regions, the Kyte and Doolittle methodology was utilized. The nine hydrophobic regions identified in the presenilin, based on the physicochemical properties, suggested the occurrence of transmembrane regions that were confirmed as helices scattered in the membrane by THMM. In the metacaspase structure of L. chagasi, besides the occurrence of four hydrophobic regions, the THMM analyses predicted just one helix, placed in the N-terminal portion. The analyzes of hydrophilicity through B-EpiPred Server, indicated the occurrence of several residues localized in external regions, showing that both molecules have significant numbers of fragments with high antigenic propensity. The prediction of epitopes on the tertiary structure was obtained by the ITASSER server. In the present paper we are suggesting potential availability of a hybrid peptide originated from the presenilin and metacaspase of the Leishmania for the developing of new drugs or vaccine.
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