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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/66999
VÍRUS COMO INDICADORES DA QUALIDADE DA ÁGUA EM ECOSSISTEMAS COSTEIROS DA ZONA OESTE DO RIO DE JANEIRO: UTILIZAÇÃO DE METODOLOGIAS MOLECULARES E AVALIAÇÃO DE IMPACTO ANTROPOGÊNICO EM ÁGUAS RECREACIONAIS
Patógenos Entéricos
Diversidade Genética Viral
Propidio Monoazida-qPCR
Emissários Marinhos
Vírus
Poluentes da Água
Efeitos Antropogênicos
Emissário Submarino
Ecossistema
Macena, Lorena da Graça Pedrosa de | Date Issued:
2022
Advisor
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
Este estudo teve como objetivo avaliar a disseminação de agentes microbiológicos em diferentes ecossistemas aquáticos da região litorânea da Baixada de Jacarepaguá que dispõe de um emissário marinho como solução sanitária para destinação do esgoto doméstico urbano no período de 2016 a 2020. Inicialmente, o impacto antrópico nas águas interiores do Sistema Lagunar foi analisado utilizando ferramentas moleculares de quantificação e caracterização de indicadores bacteriológicos (FIB) e virais (FIV) de contaminação urino-fecal humana, assim como a metodologia de TaqMan Array Card (TAC) capaz de identificar simultaneamente 35 patógenos em uma única análise. Mastadenovirus humanos (HAdV) e JC poliomavírus humano (JCPyV ou HPyV2), utilizados como FIV, foram detectados em concentrações de 102 a 106 cópias do genoma/L (CG/L), assim como outros 17 patógenos entéricos, incluindo vírus (4), bactérias (8), protozoários (4) e helmintos (1). O sequenciamento parcial dos genomas virais caracterizou nessas águas salobras as espécies de HAdV-A, -C, -D e -F e JCPyV tipo 3 (Af2), sendo esta última prevalente em populações mestiças como a brasileira. Posteriormente, o monitoramento de águas residuárias foi realizado para investigar a disseminação, concentração e diversidade genética destes FIV nos esgotos domésticos e hospitalares da região. HAdV e JCPyV foram detectados em 95% das amostras em concentrações de 10 3 a 108 CG/L, sendo caracterizadas 35 genótipos virais, dos quais quatro identificados pela primeira vez no Brasil (HAdV-D17, HAdV-D22, JCPyV-7 e JCPyV-8). Visando quantificar partículas de HAdV com capsídeos íntegros e potencialmente infecciosos foi estabelecido um protocolo com o uso de um corante intercalante de ácidos nucleicos (PMAxx) associado a qPCR aplicável a diferentes matrizes aquáticas, incluindo de forma inédita, águas salobras e marinhas. O protocolo utilizando pré-tratamento a concentração de 50uM de PMAxx (intercalante de genoma) revelou uma redução média de 2 log entre amostras não tratadas e tratadas. Paralelamente a estes estudos, um monitoramento microbiológico na zona costeira e o entorno do emissário marinho (zona offshore) na praia da Barra da Tijuca foi realizado, a fim de se avaliar a balneabilidade e rastrear as origens de contaminação fecal neste ecossistema costeiro. No período de fevereiro de 2019 a janeiro de 2020, 134 amostras de águas superficiais e ao longo da coluna d’agua foram coletadas e processadas para avaliação de parâmetros físico-químicos, bacteriológicos e virológicos. Foram detectadas partículas de HAdV com capsídeos íntegros em 10% das amostras consideradas próprias para banho, com concentrações de 10 a 60 CG/L. Foi evidenciado que as águas da zona costeira, utilizadas para práticas recreacionais, apresentaram concentrações de até 3log de HAdV íntegros a mais que a zona offshore, sendo identificados inclusive HAdV-A12, -D, -F40 e -F41 potencialmente infecciosos. O emissário marinho foi eficaz em distanciar, diluir e permitir que fatores ambientais reduzissem a contaminação microbiológica. As águas oriundas dos Canais da Joatinga e Sernambetiba foram as principais fontes de contaminação fecal na Praia da Barra da Tijuca. Este trabalho, pioneiro na América Latina na avaliação de vírus como contaminantes ambientais em torno de um emissário marinho, aponta a necessidade da inclusão de parâmetros como a detecção de HAdV íntegro como FIV complementares aos bacterianos para monitoramento ambiental
Abstract
This study aimed to evaluate the dissemination of microbiological agents in different aquatic ecosystems of the coastal region of Baixada de Jacarepaguá, which has a marine outfall as a sanitary solution for the destination of urban domestic sewage in the period from 2016 to 2020. Initially, the anthropic impact on the inland waters of the Lagoon System was analyzed using molecular tools for quantification and characterization of bacteriological (FIB) and viral (FIV) indicators of human fecal-urine contamination, as well as the TaqMan Array Card (TAC) methodology capable of to simultaneously identify 35 pathogens in a single analysis. Human mastadenovirus (HAdV) and human JC polyomavirus (JCPyV or HPyV2), used as FIV, were detected at concentrations of 102 to 106 genome copies/L (GC/L), as were 17 other enteric pathogens, including viruses (4), bacteria (8), protozoa (4) and helminths (1). The partial sequencing of viral genomes characterized the species of HAdV-A, -C, -D and -F and JCPyV type 3 (Af2) in these brackish waters, the latter being prevalent in crossbred populations such as Brazil. Subsequently, wastewater monitoring was carried out to investigate the dissemination, concentration and genetic diversity of these FIV in domestic and hospital sewage in the region. HAdV and JCPyV were detected in 95% of samples at concentrations from 103 to 108 GC/L, with 35 viral genotypes being characterized, four of which were identified for the first time in Brazil (HAdV-D17, HAdV-D22, JCPyV-7 and JCPyV- 8). Aiming to quantify HAdV particles with intact and potentially infectious capsids, a protocol was established using a nucleic acid intercalating dye (PMAxx) associated with qPCR applicable to different aquatic matrices, including, for the first time, brackish and marine waters. Protocol using pretreatment at 50uM concentration of PMAxx (genome intercalator) revealed an average reduction of 2 log between untreated and treated samples. In parallel with these studies, a microbiological monitoring in the coastal zone and the surroundings of the marine outfall (offshore zone) on the Barra da Tijuca Beach was carried out, in order to assess the bathing suitability and trace the origins of fecal contamination in this coastal ecosystem. From February 2019 to January 2020, 134 samples of surface water and along the water column were collected and processed to evaluate physical-chemical, bacteriological and virological parameters. HAdV particles with intact capsids were detected in 10% of samples considered suitable for bathing, with concentrations from 10 to 60 GC/L. Coastal zone waters, used for recreational practices, presented concentrations of up to 3 log of intact HAdV more than the offshore zone, being identified even potentially infectious HAdVA12, -D, -F40 and -F41. Marine outfall was effective in distancing, diluting and allowing environmental factors to reduce microbiological contamination. The waters from the Joatinga and Sernambetiba Channels were the main sources of fecal contamination in Barra da Tijuca Beach. This work, a pioneer in Latin America in the evaluation of viruses as environmental contaminants around a marine outfall, points to the need to include parameters such as the detection of intact HAdV as FIV complementary to bacterial ones for environmental monitoring
Keywords in Portuguese
Indicador Viral de Contaminação FecalPatógenos Entéricos
Diversidade Genética Viral
Propidio Monoazida-qPCR
Emissários Marinhos
DeCS
Qualidade da ÁguaVírus
Poluentes da Água
Efeitos Antropogênicos
Emissário Submarino
Ecossistema
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