Please use this identifier to cite or link to this item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/67117
Type
ArticleCopyright
Open access
Sustainable Development Goals
03 Saúde e Bem-Estar06 Água potável e saneamento
09 Indústria, inovação e infraestrutura
Collections
Metadata
Show full item record
EVALUATION OF ANTIMICROBIAL RESISTANCE PATTERNS OF PSEUDOMONAS AERUGINOSA STRAINS ISOLATED AMONG COVID-19 PATIENTS IN BRAZIL TYPED BY FOURIER-TRANSFORM INFRARED SPECTROSCOPY
Author
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Laboratório de Microbiologia de Alimentos e Saneantes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Força Área Brasileira. Diretoria de Saúde da Aeronáutica. Hospital da Força Aérea do Galeão. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Seção de Indicadores Analíticos e Sistemas de Dados. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Foodmicrobe.com Ltd. Adams Hill. Keyworth. Nottingham, UK.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Laboratório de Microbiologia de Alimentos e Saneantes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Força Área Brasileira. Diretoria de Saúde da Aeronáutica. Hospital da Força Aérea do Galeão. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisas Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Seção de Indicadores Analíticos e Sistemas de Dados. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Foodmicrobe.com Ltd. Adams Hill. Keyworth. Nottingham, UK.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Laboratório de Microbiologia de Alimentos e Saneantes. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
This study aimed to characterize Pseudomonas aeruginosa strains isolated from hospitalized patients during the COVID-19 pandemic. This was achieved using phenotypic and molecular techniques, including their antimicrobial resistance profile and biofilm formation. Eighteen strains were isolated from a hospital in Rio de Janeiro, Brazil, and identified by VITEK®2, MALDI-TOF/MS (VITEK MS® and MALDI Biotyper®), and 16S rRNA sequencing. Fourier-transform infrared (FTIR) spectroscopy, antimicrobial susceptibility testing, and biofilm formation and disinfectant tolerance tests were applied to evaluate the virulence characteristics of the strains. VITEK®2 (≥99%), VITEK MS® (≥82.7%), and MALDI Biotyper® (score ≥ 2.01) accurately identified the P. aeruginosa strains, but 16S rRNA sequencing did not differentiate the species P. aeruginosa from P. paraeruginosa. FTIR typing identified three different clusters, but no correlation between the phenotypical or antimicrobial susceptibility testing patterns was found. Most strains exhibited resistance to various antimicrobials. The exceptions were sensitivity to amikacin and norfloxacin, and consequently, these could be considered potential treatment options. Most strains (n = 15, 83.3%) produced biofilms on polystyrene. Sodium hypochlorite treatment (0.5%/15 min) was shown to be the most effective disinfectant for biofilm elimination. P. aeruginosa biofilm formation and tolerance to disinfectants demonstrate the need for effective cleaning protocols to eliminate contamination by this organism in the hospital environment and medical equipment.
Share