Please use this identifier to cite or link to this item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/67305
Type
DissertationCopyright
Open access
Embargo date
2024-11-17
Collections
Metadata
Show full item record
PERFIL DE PROTEÍNAS E METABÓLITOS DO TECIDO DE PACIENTES COM ADENOCARCINOMA GÁSTRICO
Cavalcante, Sofia Angiole | Date Issued:
2020
Author
Advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas & Maria Deane. Manaus, AM, Brasil.
Abstract in Portuguese
O câncer gástrico é uma das principais causas de morte associada a câncer ao redor do mundo. A alta mortalidade desta doença se mantém através do frequente diagnóstico em estágios avançados e das poucas opções de tratamento curativo nessas circunstâncias. Deste modo, esclarecer os mecanismos moleculares da progressão tumoral gástrica é essencial para a concepção de métodos diagnósticos e terapias a fim de mitigar o impacto humano desta. Nesse contexto, abordagens em larga escala, como proteômica e metabolômica, podem auxiliar a expandir o entendimento sobre esta doença de modo mais abrangente. Assim, o objetivo deste trabalho foi caracterizar o perfil de proteínas e metabólitos presentes no tecido de pacientes com câncer gástrico que possam estar associados ao processo de progressão neoplásica. Para isto, comparou-se o tecido de indivíduos ‘saudáveis’ com os de pacientes com adenocarcinoma gástrico, em diferentes estágios da doença, por técnicas de biologia molecular, metabolômica e proteômica. Primeiramente, investigou-se a presença de H. pylori e EBV nas amostras por PCR.
Posteriormente, foi realizada uma análise metabolômica, utilizando a espectrometria de massas por infusão direta, com abordagem global (untargeted) e análise multivariada dos dados. E, por fim, foi realizada uma análise proteômica através da abordagem shotgun, sendo a quantificação relativa mediante a extração do cromatograma de íons extraídos (XIC). A partir dos resultados obtidos, constatou-se uma alta prevalência dos patógenos avaliados na população doente estudada, sugerindo a infecção destes como fatores de risco relevantes para a incidência da doença na população local. Na metabolômica, observou-se um perfil característico de metástases, bem como foram sugeridos exemplos de fosfatidilcolinas, possivelmente associadas ao caráter neoplásico de tecidos gástricos. Já na proteômica, identificou-se um perfil proteico distinto entre as condições avaliadas e uma distribuição da abundância de proteínas em diferentes estágios da doença. Como exemplo tem-se a abundância da imunoglobulina gama 4 (IgG4) que aumenta em tecidos conforme a progressão da doença. Ressalta-se ainda que os tecidos de margem de ressecção dos pacientes tanto em estágio inicial quanto avançado, apresentam proteínas associadas a carcinogênese, como tripsina-2 e laminina beta-2, e um perfil metabólico similar ao de tecidos de tumor, apontando para um processo de transformação neoplásica nas margens de ressecção. Portanto, foi possível inferir aspectos pertinentes às etapas iniciais da transformação cancerosa no tecido gástrico, bem como de progressão da doença. De forma que, se espera que tais dados possam auxiliar na elaboração de futuras pesquisas voltadas para o desenvolvimento de tecnologias terapêuticas e/ou prognósticas.
Abstract
Gastric cancer is one of the leading causes of death cancer-related in the world. Its high mortality rate is maintained due to frequent diagnosis at advanced stages and lack of curative treatment options, on these conditions. Thus, unravel the molecular mechanisms driving gastric cancer progression to support the concept of new diagnostic methods and therapies is essential to mitigate the human impact of this disease. In this context, large scale analysis approaches, as proteomics and metabolomics, can be used to expand our knowledge in a comprehensive manner. Based on this, the objective of this work was to characterize the profile of proteins and metabolites on the tissue of gastric cancer patients that may be associated with cancer progression. For this, we compared the tissues of cancer-free individuals with the tumor, the resection margins and metastasis tissues of patients with gastric adenocarcinoma, at different disease stages, by molecular, metabolomic and proteomic techniques. First, we investigated the presence of H. pylori and EBV in the samples by PCR. Then, we performed a metabolomic analysis using direct infusion mass spectrometry with an untargeted approach, and multivariate analysis of data. Lastly, we performed a shotgun proteomic analysis with the relative quantitation by extracted ion chromatograms (XIC). Our results showed a high prevalence of H. pylori and EBV among cancer patients, suggesting its presence as a relevant risk factor for gastric cancer in the population studied. In metabolomics, we observed a distinct profile of metabolites in metastasis tissues, as well as suggested species of phosphatidylcholines possibly associated with the neoplastic transformations in gastric tissues. In the proteomics analysis, we found a distinct protein profile for each type of conditions evaluated and the distribution of proteins abundance in different disease stages. As example, the immunoglobulin gamma 4 (IgG4) abundance increased by following cancer progression to metastasis. Moreover, the resection margins of patients at early and advanced stages presented proteins related to carcinogenesis, as trypsin-2 and laminin beta-2, also a metabolic profile similar to tumor tissues, suggesting a possible neoplastic transformation in margin tissues. In conclusion, our results provided important information about initial steps of gastric cancer transformation, as well progression features of the disease. Therefore, we expected this data may assist in future research aimed at the development of therapies or prognostic technologies for this type of cancer.
Share