Please use this identifier to cite or link to this item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/68153
INFLUENCE OF POLYMORPHIC VARIATIONS OF IFNL, HLA, AND IL-6 GENES IN SEVERE CASES OF COVID-19
Author
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil.
Faculdades Integradas Aparício Carvalho. Porto Velho, RO, Brasil.
Faculdades Integradas Aparício Carvalho. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil.
Faculdades Integradas Aparício Carvalho. Porto Velho, RO, Brasil.
Faculdades Integradas Aparício Carvalho. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil / Centro de Pesquisa em Medicina Tropical. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Universidade Federal de Rondônia. Programa de Pós-Graduação em Biologia Experimental. Porto Velho, RO, Brasil.
Abstract
The administration of vaccination doses to the global population has led to a decrease in the incidence of COVID-19. However, the clinical picture developed
by infected individuals remains extremely concerning due to the great variability in the severity of cases even in vaccinated individuals. The clinical progression
of the pathology is characterized by various influential factors such as sex, age group, comorbidities, and the genetics of the individual. The immune response to
viral infections can be strongly influenced by the genetics of individuals; nucleotide variations called single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in structures involved
in the innate and adaptive immune response such as interferon (IFN)-λ, human leukocyte antigen (HLA), and interleukin (IL)-6 are frequently associated with
pathological progression. In this study, we conducted a review of the main SNPs of these structures that are associated with severity in COVID-19. Searches
were conducted on some platforms of the National Center for Biotechnology and Information (NCBI), and 102 studies were selected for full reading according to
the inclusion criteria. IFNs showed a strong association with antiviral function, specifically, IFN-λ3 (IL-28B) demonstrated genetic variants commonly related
to clinical progression in various pathologies. For COVID-19, rs12979860 and rs1298275 presented frequently described unfavorable genotypes for pathological
conditions of hepatitis C and hepatocellular carcinoma. The high genetic variability of HLA was reported in the studies as a crucial factor relevant to the late immune response, mainly due to its ability to recognize antigens, with the HLA-B*46:01 SNP being associated with susceptibility to COVID-19. For IL-6, rs1554606 showed a strong relationship with the clinical progression of COVID-19. In addition, rs2069837 was identified with possible host protection relationships when linked to this infection.
Share