| Autor | Ribeiro, André Vinicius Costa | |
| Autor | Mannarino, Camille Ferreira | |
| Autor | Novo, Shênia Patrícia Corrêa | |
| Autor | Prado, Tatiana | |
| Autor | Lermontov, André | |
| Autor | Paula, Bruna Barbosa de | |
| Autor | Fumian, Túlio Machado | |
| Autor | Miagostovich, Marize Pereira | |
| Data de acesso | 2025-02-03T14:58:17Z | |
| Data de disponibilização | 2025-02-03T14:58:17Z | |
| Data do publicação | 2024 | |
| Citação | RIBEIRO, André Vinicius Costa et al. Assessment of crAssphage as a biological variable for SARS-CoV-2 data normalization in wastewater surveillance. Journal of Applied Microbiology, v. 135, n. 7, p. 1-11, 16 July 2024. | |
| ISSN | 1364-5072 | |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/68374 | |
| Descrição | Produção científica do Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. | pt_BR |
| Descrição | Produção científica do Laboratório de Vírus Respiratórios, Exantemáticos, Enterovírus e Emergências Virais. | pt_BR |
| Fomento | This work was supported by Fundação de Amparo à Pesquisa do Rio de Janeiro (Faperj-E-26/211.311/2021), Conselho de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq 305 737/2023-6), and Instituto Oswaldo Cruz (PAEF3). This research study is under the scope of the Oswaldo Cruz Foundation's (FIOCRUZ) activities as a PAHO/WHO of Public and Environmental Health Collaborating Centre. Marize Pereira Miagostovich received funding. | |
| Idioma | eng | en_US |
| Editor | Oxford University Press | |
| Editor | Applied Microbiology International | |
| Direito Autoral | restricted access | |
| Título | Assessment of crAssphage as a biological variable for SARS-CoV-2 data normalization in wastewater surveillance | en_US |
| Tipo do documento | Article | |
| DOI | 10.1093/jambio/lxae177 | |
| Resumo em Inglês | Aims: This study aimed to assess the use of cross-assembled phage (crAssphage) as an endogenous control employing a multivariate normalization analysis and its application as a severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) data normalizer. Methods and Results: A total of 188 twelve-hour composite raw sewage samples were obtained from eight wastewater treatment plants (WWTP) during a 1-year monitoring period. Employing the N1 and N2 target regions, SARS-CoV-2 RNA was detected in 94% (177) and 90% (170) of the samples, respectively, with a global median of 5 log₁₀ genomic copies per liter (GC l‾¹). CrAssphage was detected in 100% of the samples, ranging from 8.29 to 10.43 log₁₀ GC l‾¹, with a median of 9.46 ± 0.40 log₁₀ GC l‾¹, presenting both spatial and temporal variabilities. Conclusions: Although SARS-CoV-2 data normalization employing crAssphage revealed a correlation with clinical cases occurring during the study period, crAssphage normalization by the flow per capita per day of each WWTP increased this correlation, corroborating the importance of normalizing wastewater surveillance data in disease trend monitoring. | en_US |
| Afiliação | Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Departamento de Saneamento e Saúde Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Afiliação | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Afiliação | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Afiliação | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios, Exantemáticos, Enterovírus e Emergências Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Afiliação | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Tecnologia. Escola de Química. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Afiliação | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Afiliação | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Afiliação | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia Comparada e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Palavras-chave em inglês | SARS-CoV-2 | en_US |
| Palavras-chave em inglês | crAssphage | en_US |
| Palavras-chave em inglês | Normalization | en_US |
| Palavras-chave em inglês | Viral biomarker | en_US |
| Palavras-chave em inglês | Wastewater surveillance | en_US |
| Palavras-chave em inglês | Stool samples | en_US |
| e-ISSN | 1365-2672 | |
| xmlui.metadata.dc.subject.ods | 03 Saúde e Bem-Estar | |
| xmlui.metadata.dc.subject.ods | 06 Água potável e saneamento | |
