Filogenômica e disseminação do HTLV-1A no Brasil

Abstract

O vírus linfotrópico de células T humanas (HTLV-1) é o retrovírus reconhecido como causador da Leucemia/Linfoma de Células T do Adulto (ATL) e da Paraparesia Espástica Tropical e Mielopatia associada ao HTLV (HAM/ TSP). Estima-se que existam cerca de 10–20 milhões de pessoas infectadas no mundo, com áreas endêmicas na América do Sul, Japão, Caribe e África. No Brasil está presente em todas as regiões com prevalências variáveis de acordo com o grupo e região geográfica analisados. Existem duas principais hipóteses sobre a origem do HTLV-1 das Américas: Através das migrações pré-históricas de populações humanas infectadas através do estreito de Bering há aproximadamente 15.000 anos atrás e introduções recentes, a partir da África através do tráfico de escravos entre os séculos XVI–XIX. Buscando entender a origem do HTLV-1 no Brasil, realizamos análises filogenéticas usando genomas completos e LTRs de HTLV-1 da África (Angola, Cabo Verde e Moçambique) e América do Sul (Argentina e Brasil). As analises mostraram que ocorreram múltiplas introduções de HTLV-1aA a partir da África no Brasil e que ocorreu pelo menos uma introdução do HTLV-1aA a partir da Ásia para o Brasil. A datação molecular baseada em genomas estimou que a introdução no Brasil a partir da Ásia teria ocorrido há 11.856 anos atrás. Contudo, não foi possível estimar este tempo em relação as linhagens da África por limitação amostral. As análises filogenéticas, de distância genética e de recombinação caracterizaram um novo subgrupo de HTLV-1a presente na América do Sul que denominamos HTLV-1aG. Seu ancestral comum mais recente (tMRCA) foi datado em 2.882 anos atrás, indicando ser um dos mais recentes subgrupos de HTLV-1a cosmopolita. Com o sequenciamento do primeiro genoma completo de HTLV-1aD foi estimado o tMRCA em 4.963 anos atrás deste subgrupo.