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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/68872
ENTEROVIRUS D68 SUBGENOTYPE B3 CIRCULATION IN CHILDREN WITH ACUTE RESPIRATORY ILLNESS IN THE STATE OF ALAGOAS, BRAZIL.
Author
Lima, Alex Ranieri Jerônimo
Santos, Hazerral de Oliveira
Pereira, James Siqueira
Leite, Anderson Brandão
Nascimento, Jean Phellipe Marques do
Souza, Juliana Vanessa Cavalcante
Lima, Marlon Breno Zampieri
Araujo, Mykaella Andrade de
Giovanetti, Marta
Kallas, Esper Georges
Sampaio, Sandra Coccuzzo
Elias, Maria Carolina
Slavov, Svetoslav Nanev
Santos, Hazerral de Oliveira
Pereira, James Siqueira
Leite, Anderson Brandão
Nascimento, Jean Phellipe Marques do
Souza, Juliana Vanessa Cavalcante
Lima, Marlon Breno Zampieri
Araujo, Mykaella Andrade de
Giovanetti, Marta
Kallas, Esper Georges
Sampaio, Sandra Coccuzzo
Elias, Maria Carolina
Slavov, Svetoslav Nanev
Affilliation
Centro de Vigilância Viral e Avaliação Sorológica do Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil. / Universidade de São Paulo. Programa de Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática. São Paulo, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo.Programa de Interunidades de Pos-Graduação em Bioinformática. São Paulo, SP, Brasil.
Centro de Vigilância Viral e Avaliação Sorológica do Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil. / Universidade de São Paulo. Programa de Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática. São Paulo, SP, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Maceió, AL, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Maceió, AL, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Maceió, AL, Brasil.
Células-tronco e terapia celular. Programa de Pós-Graduação em Oncologia Clínica. Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Maceió, AL, Brasil.
Sciences and Technologies for Sustainable Development and One Health. Università Campus Bio-Medico di Roma. Roma, Italy. / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Rene Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Centro de Vigilância Viral e Avaliação Sorológica do Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Centro de Vigilância Viral e Avaliação Sorológica do Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Centro de Vigilância Viral e Avaliação Sorológica do Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Centro de Vigilância Viral e Avaliação Sorológica do Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo.Programa de Interunidades de Pos-Graduação em Bioinformática. São Paulo, SP, Brasil.
Centro de Vigilância Viral e Avaliação Sorológica do Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil. / Universidade de São Paulo. Programa de Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática. São Paulo, SP, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Maceió, AL, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Maceió, AL, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Maceió, AL, Brasil.
Células-tronco e terapia celular. Programa de Pós-Graduação em Oncologia Clínica. Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública. Maceió, AL, Brasil.
Sciences and Technologies for Sustainable Development and One Health. Università Campus Bio-Medico di Roma. Roma, Italy. / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Rene Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Centro de Vigilância Viral e Avaliação Sorológica do Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Centro de Vigilância Viral e Avaliação Sorológica do Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Centro de Vigilância Viral e Avaliação Sorológica do Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Centro de Vigilância Viral e Avaliação Sorológica do Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Abstract
Enterovirus D68 (EV-D68) is a leading cause of acute respiratory disease outbreaks, especially among children. EV-D68 infections can rapidly progress to severe clinical complications and potentially fatal outcomes. In Brazil, no diagnostic or genomic surveillance of this virus is currently performed. Between July and September 2023, cases of acute EV-D68 infection were identified among pediatric patients in several municipalities within the State of Alagoas, Northeast Brazil. Infections were confirmed by RT-qPCR using nasopharyngeal samples, and the complete EV-D68 genomes were sequenced and analyzed through phylogenetic inference. EV-D68 RNA was identified in four children aged 1–9 years from four geographically distinct municipalities in Alagoas. All infections were associated with lower respiratory tract symptoms, including dyspnea and wheezing; however, no fatalities were reported. Complete genomic sequencing revealed that the samples belonged to genotype B, subgenotype B3. This is the first study to report complete genomic data on EV-D68 infections from Brazil and South America. Enhanced genomic surveillance and focused EV-D68 diagnosis are critical to better understanding and managing the regional and national dissemination of this virus.
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