Survey of genome organization and gene content of Corynebacterium pseudotuberculosis

Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento Biologia Geral. Laboratório de Genética Celular e Molecular Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento Biologia Geral. Laboratório de Genética Celular e Molecular Belo Horizonte, MG, Brazil.
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Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Laboratório de Biodados. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Laboratório de Imunologia e Bioquímica Celular de Parasitas. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Laboratório de Imunologia de Doenças Infecciosas. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pequisas René Rachou. Laboratório de Parasitologia Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pequisas René Rachou. Laboratório de Parasitologia Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pequisas René Rachou. Laboratório de Parasitologia Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal da Bahia. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Biointeração. Salvador, BA, Brazi.l
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento Biologia Geral. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brazil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Geral. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brazil.

Abstract

Corynebacterium pseudotuberculosis is an intracellular pathogen that causes Caseous lymphadenitis (CLA) disease in sheep and goats. The widespread occurrence and the economic importance of this pathogen have prompted investigation of its pathogenesis. We used a genomic library of C. Pseudotuberculosis to generate 1440 genomic survey sequences (GSSs); these were analyzedin silico with bioinformatics tools, using public databases for comparative analyses. We employed non-redundant unique sequences as a query for BLAST searches against the genome, the translated genome and the proteome of four other Coryne bacteriumspecies that have been completely sequenced. We were able to characterize approximately 8% of the genome of C. pseudotuberculosis, including previously undescribed functional group genes, based on the COG database; the GSSs classification into categories gave 13%

Keywords

Corynebacterium genus
Corynebacterium pseudotuberculosis
Genome survey sequence (GSS)
Microbial genome sequencing
Comparative genomic

Publisher

Elsevier GmbH

Citation

D’Afonseca, Vivian et al. Survey of genome organization and gene content of Corynebacterium pseudotuberculosis. Microbiological Research, v. 165, n. 4, p. 312-320, 2010.

DOI

10.1016/j.micres.2009.05.009

ISSN

0944-5013

Please use this identifier to cite or link to this item: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/6888

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