Please use this identifier to cite or link to this item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/68924
Type
DissertationCopyright
Open access
Sustainable Development Goals
09 Indústria, inovação e infraestrutura14 Vida na água
15 Vida terrestre
Collections
Metadata
Show full item record
TAXONOMIA INTEGRATIVA DE DIDYMOZOIDAE MONTICELLI, 1888 (DIGENEA: HEMIUROIDEA) PARASITOS DE PEIXES DA TRIBO THUNNINI (SCOMBRIFORMES) OCORRENTES AO LARGO DA COSTA DO ESTADO DO RIO DE JANEIRO
Meneses, Yuri Costa de | Date Issued:
2024
Alternative title
Integrative taxonomy of Didymozoidae Monticelli, 1888 (Digenea: Hemiuroidea) parasites of fishes of the Thunnini tribe (Scombriformes) occurring along the coast of the State of Rio de JaneiroAuthor
Advisor
Co-advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade e Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
Membros da tribo Thunnini, conhecidos como atuns e afins, representam um importante recurso pesqueiro e estão entre as espécies mais explotadas do Atlântico Sul Ocidental. Estes peixes caracterizam-se por apresentar um sistema de termorregulação eficiente, o que lhes possibilita realizar migrações interoceânicas. Sua nutrição é muito variada e se dá por meio da ingestão de diferentes presas, como peixes, crustáceos e anelídeos. Estes são hospedeiros intermediários e paratênicos de diferentes helmintos, sobretudo os trematódeos da família Didymozoidae Monticelli, 1888, que apresentam grande especificidade aos tuníneos. O objetivo do presente trabalho foi estudar a diversidade de Didymozoidae parasitos de peixes da tribo Thunnini utilizando abordagens morfológicas e moleculares. Foram obtidos 24 espécimes de tuníneos em mercados que comercializam pescado fresco no estado do Rio de Janeiro, sendo quatro de Auxis thazard (Lacepède, 1800), nove de Thunnus albacares (Bonnaterre, 1788) e 11 de Thunnus atlanticus (Lesson, 1831). Os atuns foram necropsiados e os Didymozoidae foram tirados de suas cápsulas e processados para análise morfológica. Exemplares de cada espécie de Didymozoidae foram individualizados e processados por meio de técnicas de biologia molecular, como extração, quantificação e amplificação do DNA por PCR com o alvo genético 28S rDNA. Análises filogenéticas foram conduzidas com um dataset do 28S rDNA incluindo as sequências geradas e sequências depositadas no GenBank, utilizando os métodos de Neighbor-Joining, Máxima Verossimilhança e Inferência Bayesiana e os modelos de substituição nucleotídica Kimura 2-parâmetros com distribuição gama e General Time Reversible com distribuição gama, respectivamente. Neste trabalho, 18 dos 24 exemplares de tuníneos (75%) encontravam-se parasitados por pelo menos uma espécie de Didymozoidae. No total, foram encontradas sete espécies nas três diferentes espécies de Thunnini estudadas: Annulocystis auxis Yamaguti, 1970, Didymocystis lamotheargumedoi Kohn & Justo, 2008, Didymocystis sp., Didymosulcus orbitalis (Yamaguti, 1970) Pozdnyakov, 1990, Didymosulcus palati (Yamaguti, 1970) Pozdnyakov, 1990, Coeliotrema thynni Yamaguti, 1938 e Koellikeroides intestinalis Yamaguti, 1970. As análises filogenéticas conduzidas no presente estudo evidenciaram que as sequências de D. palati, D. orbitalis e D. lamotheargumedoi foram agrupadas em um grande clado formado por sequências de Didymocystis e Didymosulcus, enquanto as sequências de K. intestinalis, C. thynni e A. auxis foram agrupadas em clados específicos de subfamílias. Apesar da falta de depósito de sequências de referências para a família e a aplicação de um marcador ribossomal conservado, foi possível observar clados formados por espécies específicas para Annulocystis. No presente estudo, sequências nucleotídicas inéditas para sete espécies de Didymozoidae foram geradas, contribuindo para o conhecimento da diversidade deste grupo de parasitos que acometem atuns e afins na costa brasileira.
Abstract
Members of the Thunnini tribe, known as tunas and tuna-like species, represent an important fishing resource and they are amid the most exploited species in the Southwestern Atlantic Ocean. These fishes are characterised by having an efficient thermoregulation system, which enables them to undertake interoceanic migrations. Their nutrition is quite variable, and it occurs through ingestion of different prey, such as fishes, crustaceans, and annelids, which are intermediate and paratenic hosts of different helminth species, especially members of the family Didymozoidae Monticelli, 1888, that present high specificity to tuna species. The present work aimed at studying the diversity of Didymozoidae parasites of fishes of the Thunnini tribe using morphological and molecular approaches. 24 tuna specimens were obtained from fish markets that commercialise fresh fish in the State of Rio de Janeiro, being fourof Auxis thazard (Lacepède, 1800), nine of Thunnus albacares (Bonnaterre, 1788), and 11 of Thunnus atlanticus (Lesson, 1831). Tunas were necropsied, specimens of Didymozoidae were taken out of theirs capsules and were processed for morphological analysis. Some specimens of each Didymozoidae species were individualised and processed through molecular biology techniques, such as DNA extraction, quantification and amplification of DNA by PCR with the genetic target 28S rDNA. Phylogenetic analyses were conducted with a dataset of 28S rDNA including sequences generated and sequences deposited in Genbank through the methods of Neighbor-Joining, Maximum Likelihood, and Bayesian Inference by utilising the nucleotide substitution models Kimura 2-parameter with gamma distribution and General Time Reversible with gamma distribution, respectively. In this survey, 18 out of 24 specimens of tunas (75%) were parasitised by at least one species of Didymozoidae. In total, seven species were found in the three different species of Thunnini studied: Annulocystis auxis Yamaguti, 1970, Didymocystis lamotheargumedoi Kohn & Justo, 2008, Didymocystis sp., Didymosulcus orbitalis (Yamaguti, 1970) Pozdnyakov, 1990, Didymosulcus palati (Yamaguti, 1970) Pozdnyakov, 1990, Coeliotrema thynni Yamaguti, 1938, and Koellikerioides intestinalis Yamaguti, 1970. Phylogenetic analyses conducted in the present study highlights that sequences of D. palati, D. orbitalis, and D. lamotheargumedoi were yielded in a great clade formed by clades of sequences of Didymocystis and Didymosulcus, whereas sequences of K. intestinalis, C. thynni, and A. auxis were yielded in specific subfamilies clades. Even though the lack of referenced sequences deposited for the family and the application of a conservative ribosomal target, it was possible to observe clades formed by species-specific of Annulocystis. In the present study, new nucleotide sequences were generated for seven Didymozoidae species, contributing to the knowledge of these group of parasites that affect tunas in the Brazilian coast.
Share