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ThesisCopyright
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Sustainable Development Goals
03 Saúde e Bem-Estar10 Redução das desigualdades
11 Cidades e comunidades sustentáveis
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INCIDÊNCIA E TRANSMISSÃO DOMICILIAR DE SARS-COV-2 EM UMA COORTE DE FAMÍLIAS RESIDENTES NA REGIÃO METROPOLITANA DO RIO DE JANEIRO
Variantes do SARS-CoV-2
Vacina COVID-19
Estudo de Coorte
Transmissão domiciliar
Imunidade
Silva, Michele Fernanda Borges da | Date Issued:
2024
Alternative title
Incidence and transmission of SARS-COV-2 in a household cohort of residents in the metropolitan region of Rio de JaneiroAdvisor
Co-advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
As taxas de incidência de infecções por SARS-CoV-2 e a soroprevalência de anticorpos têm promovido a compreensão da pandemia e a avaliação de medidas implementadas ao longo do tempo. Apesar das vacinas reduzirem drasticamente as taxas de infecção grave, com o surgimento das novas variantes a prevenção da infecção se tornou outro fator crítico no controle da disseminação viral. De maio de 2020 a junho de 2023, conduzimos um estudo de coorte de famílias para entender a história natural da infecção por SARS-CoV-2 no Rio de Janeiro, Brasil. Este estudo teve como objetivos estimar a incidência da infecção por SARS-CoV-2, descrever o perfil imunológico, investigar a imunidade induzida pela infecção, pela vacina e a probabilidade de contrair a infecção em uma coorte de famílias em diferentes períodos epidêmicos. As famílias foram acompanhadas com coleta sistemática de amostras do trato respiratório e do sangue. Foram monitorados sintomas e status vacinal. Foi calculada a densidade de incidência definida como o número de novos casos de SARS-CoV-2 por 1.000 pessoas-semana de exposição. Para cálculo da soroprevalência, definimos participante soropositivo como aquele com pelo menos um teste sorológico positivo (Ac anti-nucleocapsídeo ou Ac anti-spike) por período avaliado. Para análise da transmissão domiciliar modelamos o número de contatos infectados como uma variável aleatória da distribuição binomial. A variável aleatória binomial foi definida por dois parâmetros: o número de indivíduos no cluster e a probabilidade de transmissão dentro do cluster. A probabilidade de transmissão dentro do cluster foi definida por uma função de ligação logit que consistiu em um intercepto, efeitos fixos e efeitos aleatórios. Foram recrutados 669 indivíduos, totalizando 272 clusters domiciliares e 288 casos índices identificados. A densidade de incidência da infecção por SARS-CoV-2 variou de 4 (Delta) a 56 (B.1.1.33) por 1.000 pessoassemana, sendo a mais alta na onda B.1.1.33 em todas as faixas etárias. A soroprevalência variou entre 37% no período pré-VoC e 99% no período de circulação da variante Ômicron. A transmissão domiciliar ocorreu em 45,6% dos clusters pesquisados. Durante o período pré-VoC, entre os fatores investigados, nenhum foi associado à transmissão. No período Gama/Delta, infecções prévias reduziram a probabilidade de transmissão (OR=0,088; IC 95% 0,023-0,341), enquanto no período Ômicron, ter um profissional de saúde no domicílio (OR=0,486; IC 95% 0,256-0,921) e imunidade híbrida (OR=0,095; IC 95% 0,010-0,924) diminuíram a probabilidade de transmissão. Nossos resultados fornecem forte suporte para o efeito protetor da vacinação regular contra a transmissão domiciliar em uma coorte de famílias expostas a variantes sucessivas do SARS-CoV-2.
Abstract
SARS-CoV-2 infection incidence rates and antibody seroprevalence have contributed to understanding the pandemic and assessing impact measures over time. Although vaccines rapidly reduce severe infection rates, with the emergence of new variants, infection prevention has become another critical factor in controlling viral spread. From May 2020 to June 2023, we conducted a family cohort study to understand the natural history of SARS-CoV-2 infection in Rio de Janeiro, Brazil. This study aimed to estimate the incidence of SARS-CoV-2 infection, describe the immunological profile, investigate immunity induced by infection, by vaccine and the probability of acquiring the infection in a cohort of families across different epidemiological periods. Families were followed with systematic collection of respiratory tract and blood samples. Symptoms and vaccination status were monitored. Incidence density, defined as the number of new SARS-CoV-2 cases per 1,000 person-weeks of exposure, was calculated. To calculate seroprevalence, we defined a seropositive participant as one with at least one positive serological test (anti-nucleocapsid Ab or anti-spike Ab) per evaluated period. To analyze household transmission, we modeled the number of infected contacts as a quantum variable of the binomial distribution. The binary variable was defined by two parameters: the number of individuals in the cluster and the probability of transmission within the cluster. The probability of transmission within the cluster was defined by a logical link function consisting of an intercept, fixed effects, and random effects. A total of 669 individuals were enrolled, totaling 272 household clusters and 288 index cases identified. The incidence density of SARS-CoV-2 infection ranged from 4 (Delta) to 56 (B.1.1.33) per 1,000 person-weeks, being highest in the B.1.1.33 wave in all age groups. Seroprevalence ranged from 37% in the pre-VoC period to 99% during the period of circulation of the Omicron variant. Household transmission occurred in 45.6% of the clusters surveyed. During the pre-VoC period, none of the investigated factors were associated with transmission. In the Gamma/Delta period, previous infections reduced the probability of transmission (OR=0.088; 95% CI 0.023-0.341), while in the Omicron period, having a healthcare worker in the household (OR=0.486; 95% CI 0.256-0.921) and hybrid immunity (OR=0.095; 95% CI 0.010-0.924) decreased the probability of transmission. Our results provide strong support for the protective effect of regular vaccination against household transmission in a cohort of families exposed to successive SARS-CoV-2 variants.
Keywords in Portuguese
COVID-19Variantes do SARS-CoV-2
Vacina COVID-19
Estudo de Coorte
Transmissão domiciliar
Imunidade
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