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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/69051
NECROMYS LASIURUS (LUND, 1841) (CRICETIDAE: SIGMODONTINAE) EM ÁREAS ABERTAS DE MATA ATLÂNTICA DO ESTADO DO RIO DE JANEIRO: CIENCIOMETRIA E ESTRUTURAÇÃO POPULACIONAL
Santos, Fernando de Oliveira | Date Issued:
2024
Alternative title
Necromys lasiurus (Lund, 1841) (Cricetidae: Sigmodontinae) in open areas of Atlantic Forest in Rio de Janeiro State: scientiometry and population structuringAuthor
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Co-advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade e Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
O gênero Necromys inclui oito espécies amplamente distribuídas em mosaicos de áreas abertas da América do Sul. Apesar de sua ampla distribuição, existe uma limitada cobertura geográfica dos estudos sobre este gênero e um baixo número amostral de espécimes em revisões taxonômicas, indicando que há lacunas no conhecimento. Compreender este gênero é importante para o monitoramento de zoonoses visto que algumas espécies são reservatórios principais de agentes zoonóticos. Uma dessas espécies é Necromys lasiurus, roedor típico do bioma Cerrado, e que vem sendo registrado em áreas abertas do bioma Mata Atlântica no estado do Rio de Janeiro. No Cerrado, N. lasiurus é reconhecido como reservatório do orthohantavírus genótipo Araraquara (ARAV), que é o agente etiológico da Síndrome Pulmonar por Hantavírus. Sendo assim, a presença de N. lasiurus possui implicações no monitoramento de zoonoses no estado do Rio de Janeiro, sendo importante elucidar a origem dessas populações e suas conexões com populações de outros biomas ao qual são reconhecidos por serem reservatórios da ARAV. Visando compreender e preencher essas lacunas no conhecimento, a tese tem por objetivo avaliar os processos de ocupação de áreas abertas de Mata Atlântica do estado do Rio de Janeiro pelo roedor N. lasiurus e o conhecimento atual sobre o gênero. Para tal, foi realizado um estudo cienciométrico utilizando a plataforma Web of Science e o pacote do R Bibliometrix, e um estudo filogenético e filogeográfico com 23 sequências do gene mitocondrial citocromo B oriundos do banco de dados do Laboratório de Biologia e Parasitologia de Pequenos Mamíferos Silvestres Reservatórios e Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-UFRJ, sequencias essas coletadas entre o período de 2019 a 2023, e sequencias depositadas no Genbank do mesmo gene. Quanto aos dados cienciométricos, foi observado que ainda há lacunas no conhecimento sobre o gênero, como em temas sobre a eco-epidemiologia de agentes zoonóticos e a biologia evolutiva do grupo, onde os autores se isolam em grupos de pesquisa dificultando o surgimento de trabalhos multidisciplinares. Quanto aos resultados sobre as populações de N. lasiurus no bioma Mata Atlântica do Estado do Rio de Janeiro, pôde-se observar que o processo de ocupação do grupo amostral da Mata Atlântica do estado do Rio de Janeiro se deu inicialmente através de populações relictuais de outras localidades do próprio bioma Mata Atlântica e do Cerrado, mantendo o fluxo gênico entre essas populações atualmente, o qual o fator antrópico pode estar auxiliando nessa manutenção. Por possuir fluxo gênico com populações reconhecidas com reservatório de ARAV, existe o potencial de introdução do ARAV no estado do Rio de Janeiro, por indivíduos que se dispersaram do bioma Cerrado. Os dados obtidos nessa tese podem auxiliar no direcionamento na temática de novos estudos sobre o gênero, avança no conhecimento sobre a história evolutiva de N. lasiurus, e podem auxiliar na vigilância das orthohantaviroses no estado do Rio de Janeiro.
Abstract
The genus Necromys includes eight species that are widely distributed in patches of open areas in South America. Despite its wide distribution, there is limited geographic coverage of studies on this genus and a low sample number of specimens in taxonomic reviews, indicating that there are gaps in knowledge. Understanding this genus is important for monitoring zoonoses as some species are main reservoirs of zoonotic agents. One of these species is Necromys lasiurus, a rodent typical of the Cerrado biome, which has been recorded in open areas of the Atlantic Forest biome in the state of Rio de Janeiro (AF-RJ). In the Cerrado biome, N. lasiurus is recognized as a reservoir of the Araraquara genotype orthohantavirus (ARAV), which is the etiological agent of Hantavirus Pulmonary Syndrome. Therefore, the presence of N. lasiurus has implications for the monitoring of zoonoses in RJ, and it is important to elucidate the origin of these populations and their connections with populations from other biomes which are known to be ARAV reservoirs. Aiming to understand and fill these gaps in knowledge, the thesis aims to evaluate the processes of occupation of open areas of AF-RJ by the rodent N. lasiurus and current knowledge about the genus. A scientometric study was carried out using the Web of Science platform and the R Bibliometrix package, and a phylogenetic and phytogeographic study with 23 sequences of the mitochondrial cytochrome B gene from the LABPMR and NUPEM databases, sequences collected between the period 2019 to 2023, and sequences deposited in Genbank. Scientometric results shows there are still gaps in knowledge about the genus, such as topics on the eco-epidemiology of zoonotic agents and the evolutionary biology of the group, where authors isolate themselves in research groups, making it difficult for multidisciplinary works to emerge. Regarding the results on the populations of N. lasiurus in the AF-RJ, it was observed that the process of occupation of the sample group of the AF-RJ initially occurred through relictual populations of other locations in the Atlantic Forest and Cerrado biomes, maintaining the gene flow between these populations currently, which the anthropic factor may be helping in this maintenance. Because it has gene flow with populations recognized as a reservoir of ARAV, there is the potential for the introduction of ARAV in RJ through individuals that have dispersed from the Cerrado biome. The results obtained in this thesis can help guide new studies on the genus, advance knowledge about the evolutionary history of N. lasiurus, and can aid information on the surveillance of orthohantaviruses in RJ.
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