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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/69244
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ThesisCopyright
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2025-06-27
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PLATAFORMAS SIG BASEADAS NA WEB PARA DETECÇÃO DE AGLOMERADOS ESPACIAIS E TEMPORAIS DE CASOS DE DOENÇAS: REVISÃO DO ESTADO DA ARTE E APLICAÇÃO PARA A ANÁLISE DE MICROCEFALIA CONGÊNITA NO BRASIL
Microcefalia congênita
Aglomerados espaço-temporais
Sistemas de informação geográfica
Visualização de dados
Web
Internet
Congenital microcephaly
Spatiotemporal clusters
Geographic information systems
Data visualization
Web
Internet
Microcefalia
Hotspot de Doença
Sistemas de Informação Geográfica
Visualização de Dados
Redes de Comunicação de Computadores
Epidemiologia
Castillo, Maira Alejandra Moreno | Date Issued:
2024
Advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Comunicação e Informação Científica e Tecnológica em Saúde. Programa de Pós-Graduação em Informação e Comunicação em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
Após a epidemia do vírus Zika (ZIKV) em 2015-2016, a prevalência de microcefalia congênita no Brasil vem diminuindo, embora os números continuam a ser maiores quando comparados com as prevalências do período pré-epidemia, destacando a necessidade de abordagens mais abrangentes para a investigação e vigilância desta e outras anomalias de nascimento. Nas últimas décadas, plataformas SIG baseadas na Web (SIG-Web) têm sido amplamente utilizadas para a comunicação de dados epidemiológicos georreferenciados, facilitando o monitoramento de situações de saúde através da Internet. No entanto, a integração de recursos de análise estatística espacial em plataformas SIG-Web ainda é limitada. Consequentemente, a maioria dos SIG-Web dedicados à vigilância em saúde raramente produzem informações derivadas de análises espaço-temporais avançados, como a detecção de aglomerados de doenças. Objetivo: Esta tese visou (1) revisar e caracterizar as plataformas SIG-Web desenvolvidas globalmente para apoiar a vigilância em saúde; (2) propor um protótipo de plataforma SIG-Web para detectar e visualizar aglomerados espaciais e espaço-temporais de anomalias congênitas e (3), demonstrar a utilidade do protótipo mediante a análise de aglomerados de casos de microcefalia congênita no Brasil. Metodologia: Para identificar as plataformas SIG-Web desenvolvidas para vigilância em saúde em todo o mundo, realizou-se uma revisão sistematizada da literatura. Utilizando as URLs extraídas das publicações revisadas, todas as plataformas SIG-Web (15 em total) foram acessadas e posteriormente analisadas mediante exploração direta, conforme seis critérios de avaliação especialmente desenvolvidos para a revisão. Posteriormente, abordando algumas das lacunas identificadas na revisão de plataformas SIG-Web, foi desenvolvido o protótipo de SIG-Web denominado WebMApScan. O R e o OpenCPU foram empregados para incorporar no sistema os algoritmos de varredura espacial e espaçotemporal do software SatScan™, enquanto a interface de usuário do protótipo foi desenvolvida em HTML e JavaScript. Finalmente, mediante a implementação do WebMApScan, foi demonstrada a utilidade do protótipo proposto por meio de uma análise de aglomerados de casos de microcefalia congênita notificados no Brasil, entre os anos 2010 e 2021. Resultados: A revisão de plataformas SIG-Web revelou fragilidades operacionais e funcionais importantes, particularmente no que diz respeito à integração de ferramentas analíticas avançadas para detectar aglomerados de doenças. Adicionalmente, constatou-se a baixa disponibilidade de arquiteturas SIG-Web de código aberto que possam ser reproduzidas e reutilizadas com relativa facilidade. Graças a sua integração com o SatScan™ e a sua inovadora arquitetura modular e de código aberto baseada em pacotes R, o WebMAppScan preencheu importantes lacunas de desenvolvimento e implementação das plataformas SIG-Web para vigilância em saúde. Por fim, a implementação do WebMAppScan permitiu a identificação de aglomerados históricos estatisticamente significativos de casos de microcefalia congênita no Brasil, durante e posterior a epidemia de ZIKV, bem como potenciais zonas geográficas de risco, sublinhando o potencial desse protótipo como uma importante ferramenta na investigação e vigilância desta e outras condições de saúde. Conclusão: Esta tese não apenas identificou importantes lacunas no que diz respeito ao desenvolvimento de plataformas SIG-Web para apoiar atividades de vigilância em saúde, mas também apresenta uma solução viável com potenciais aplicações no campo da vigilância sanitária.
Abstract
Following the Zika virus (ZIKV) epidemic in 2015-2016, the prevalence of congenital microcephaly in Brazil has been decreasing, although the numbers continue to be higher when compared to the pre-epidemic period prevalences, highlighting the need for more comprehensive approaches to the investigation and surveillance of these and other congenital anomalies. In recent decades, Web-based GIS platforms (Web-GIS) have been widely used to communicate georeferenced epidemiological data, facilitating the monitoring of health situations via the Internet. However, the integration of spatial statistical analysis capabilities into Web-GIS platforms is still limited. Consequently, most Web-GIS dedicated to health surveillance rarely produce information derived from advanced spatio-temporal analyses, such as the detection of disease clusters. Objective: This thesis aimed to (1) review and characterize Web-GIS platforms developed globally to support health surveillance; (2) propose a Web-GIS platform prototype to detect and visualize spatial and spatio-temporal clusters of congenital anomalies and (3) demonstrate the usefulness of the proposed prototype through the analysis of clusters of congenital microcephaly cases in Brazil. Methods: To identify Web-GIS platforms developed for health surveillance around the world, a systematized literature review was carried out. Using the URLs extracted from the reviewed publications, all Web-GIS platforms (15 in total) were accessed and subsequently analyzed through direct exploration, according to six evaluation criteria specially developed for the review. Subsequently, addressing some of the gaps identified in the Web-GIS platforms review, a Web-GIS prototype called WebMAppScan was developed. R and OpenCPU were employed to incorporate the spatial and spatio-temporal scanning algorithms of the SatScan™ software into the system, while the user interface was developed in HTML and JavaScript. Finally, through the implementation of WebMAppScan, the usefulness of the proposed prototype was demonstrated through an analysis of clusters of congenital microcephaly cases reported in Brazil, between the years 2010 and 2021. Results: The Web-GIS platforms review underscore important operational and functional weaknesses, particularly regarding the integration of advanced analytical tools to detect disease clusters. Additionally, there was found a low availability of open-source Web-GIS architectures that can be reproduced and easily reused it. Thanks to its integration with SatScan™ and its innovative modular and open source architecture based on R packages, WebMAppScan filled important gaps in the development and implementation of Web-GIS platforms for health surveillance. Finally, the implementation of WebMAppScan allowed the identification of statistically significant historical clusters of congenital microcephaly cases in Brazil, both, during and after the ZIKV epidemic, as well as potential geographic risk zones, underlining the potential of this prototype as an important tool in research and surveillance of this and other health conditions. Conclusion: This thesis not only identified important gaps regarding Web-GIS platforms development to support health surveillance activities, but also presents a viable solution with potential applications in the field of health surveillance.
Keywords in Portuguese
Anomalias congênitasMicrocefalia congênita
Aglomerados espaço-temporais
Sistemas de informação geográfica
Visualização de dados
Web
Internet
Keywords
Congenital anomaliesCongenital microcephaly
Spatiotemporal clusters
Geographic information systems
Data visualization
Web
Internet
DeCS
Anormalidades CongênitasMicrocefalia
Hotspot de Doença
Sistemas de Informação Geográfica
Visualização de Dados
Redes de Comunicação de Computadores
Epidemiologia
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