Please use this identifier to cite or link to this item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/69732
HRM ACCURACY AND LIMITATIONS AS A SPECIES TYPING TOOL FOR LEISHMANIA PARASITES
Author
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Leishmanioses. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular e Doenças Endêmicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Leishmanioses. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Epidemiologia Genética. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Epidemiologia Genética. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Epidemiologia Genética. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Leishmanioses. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia e Parasitologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular e Doenças Endêmicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Leishmanioses. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular e Doenças Endêmicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Leishmanioses. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Epidemiologia Genética. Porto Velho, RO, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Epidemiologia Genética. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Epidemiologia Genética. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Leishmanioses. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Epidemiologia da Amazônia Ocidental. Porto Velho, RO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia e Parasitologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular e Doenças Endêmicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa em Leishmanioses. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
High Resolution Melting Analysis (HRM) has been pointed out as a suitable alternative method to detect and identify Leishmania species. Herein, we aimed to evaluate the sensitivity, specificity, accuracy, and limitations of a HSP70-HRM protocol both as a diagnostic scheme applied in clinical samples and as a species typing tool for laboratory research and reference services. Our data reveal the pronounced species-typing potential of the HSP70-HRM in DNA from cultured parasites. For clinical samples, however, we advise caution due to parasite load-dependent accuracy. In light of these findings and considering the importance of parasite load determination for clinical and research purposes, we recommend the integration of the presented typing scheme and the previously published Leishmania quantifying approach as combined tools for clinicians, surveillance, and research.
Share