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| Autor | Berber, Gilcele de Campos Martin | |
| Autor | Sarges, Kevin Matheus Lima de | |
| Autor | Cruz, Thais Campos Dias da | |
| Autor | Roma, Eric Henrique | |
| Autor | Miyajima, Fábio | |
| Autor | Almeida, Jorge Reis | |
| Autor | Souza, Cíntia Fernandes de | |
| Autor | Silva, Andrea Alice da | |
| Autor | Vallinoto, Izaura Maria Vieira Cayres | |
| Autor | Vallinoto, Antônio Carlos Rosário | |
| Autor | Queiroz, Maria Alice Freitas | |
| Autor | Baccin, Tatiana Gasperin | |
| Autor | Castro, Andréa Cauduro de | |
| Autor | Vieira, Angélica Thomaz | |
| Autor | Azevedo, Francisco Kennedy Scoffoni de | |
| Autor | Pereira, Alexandre da Costa | |
| Autor | Falcão, Luiz Fábio Magno | |
| Autor | Quaresma, Juarez Antônio Simões | |
| Autor | Kehdy, Fernanda | |
| Autor | Santos, Eduardo Tarazona | |
| Autor | Siqueira, Marilda Mendonça | |
| Autor | Garcia, Cristiana Couto | |
| Autor | Santos, Eduardo José Melo dos | |
| Autor | Slhessarenko, Renata Dezengrini | |
| Fecha de acceso | 2025-04-23T01:21:09Z | |
| Fecha de disponibilización | 2025-04-23T01:21:09Z | |
| Fecha de publicación | 2025 | |
| Referencia | BERBER, Gilcele de Campos Martin et al. Polymorphisms in HLA genes among Brazilian patients hospitalized with COVID-19: Insights from a multicentric study. Microbial Pathogenesis, v. 24, p. 1-9, Apr. 2025. | en_US |
| ISSN | 0882-4010 | en_US |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/69799 | |
| Promoción | This study was funded by the grant “Inova COVID-19 Geração de Conhecimento” to CCG by Fiocruz (process number VPPCB-005-FIO-20-2-21) and partially supported by the National Council for Scientific and Technological Development (CNPq grant # 401235/2020-3). GCMB and TCDC receive Doctoral scholarships (CAPES code 001). KMLS received a Master’s scholarship (CAPES) and is currently receiving a Doctoral scholarship (CNPq code GD). ACRV receive a PQ1 grant (#302935/2021-5), RDS, MAFQ, IMVCV receive PQ2 grants (#309750/2020-2, #304835/2022-6 and #303837/2023-3) from CNPq. ETS is funded by CNPq and FAPEMIG. All the COVID-19 reference centers, and their multidisciplinary teams contributed to this study, as did laboratory technicians from Fiocruz, for sample processing. | en_US |
| Idioma | eng | en_US |
| Editor | Elsevier | en_US |
| Versión posterior | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/69566 | en_US |
| Derechos de autor | restricted access | en_US |
| Título | Polymorphisms in HLA genes among Brazilian patients hospitalized with COVID-19: Insights from a multicentric study | en_US |
| Tipo del documento | Article | en_US |
| DOI | 10.1016/j.micpath.2025.107542 | |
| Resumen en Inglés | Immunogenetic factors such as human leukocyte antigen (HLA) alleles, have yielded contrasting associations with protection or increased chances of hospitalization due to COVID-19 worldwide. This case-control study included 834 patients with confirmed COVID-19 diagnosis from five Brazilian states: Ceará (n = 110), Mato Grosso (n = 192), Pará (n = 209), Rio de Janeiro (n = 211) and Rio Grande do Sul (n = 112). Genotyping was performed using the Axiom™ Human Genotyping SARS-CoV-2 array, targeting single nucleotide polymorphisms in HLA class I and II genes; HLA alleles were imputed for eight loci. Among the 15 preselected candidate alleles, only DQA1∗05:01 (p = 0.015) in the state of Ceará remained significantly associated with hospitalization. The meta-analysis of the most frequent alleles in all states revealed that HLA-DPA1∗01:03 (p = 0.0229, OR = 0.76, 95 % CI = 0.60-0.96) and HLA-DPB1∗04:01 (p = 0.0474, OR = 0.78, 95 % CI = 0.611.00) were associated with protection against hospitalization, whereas HLA-DPA1∗02:01 (p = 0.0259, OR = 1.37, 95 % CI = 1.04-1.80), HLA-DQA1∗05:01 (p = 0.0133, OR = 1.40, 95 % CI = 1.07-1.82), and HLA-DRB1∗03:01 (p = 0.0276, OR: 1.59, 95 % CI: 1.05-2.40) associated with increased risk of hospitalization. HLA evolutionary divergence (HED) scores were significantly higher among the non-hospitalized group for the HLA-A locus, which has been shown to be a protective factor for the most severe forms and consequently hospitalization due to COVID-19. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal de Mato Grosso. Faculdade de Medicina. Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde. Cuiabá, MT, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal de Mato Grosso. Faculdade de Medicina. Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde. Cuiabá, MT, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Laboratório de Imunologia e Imunogenética em Doenças Infecciosas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Ceará. Rede de Vigilância Genômica da Fiocruz. Laboratório de Epidemiologia Molecular por Competência Analítica. Eusébio, CE, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal Fluminense. Laboratório Multiusuário de Apoio à Pesquisa em Nefrologia e Ciências Médicas. Niterói, RJ, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal Fluminense. Laboratório Multiusuário de Apoio à Pesquisa em Nefrologia e Ciências Médicas. Niterói, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios, Exantemáticos, Entéricos e Emergências Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal Fluminense. Laboratório Multiusuário de Apoio à Pesquisa em Nefrologia e Ciências Médicas. Niterói, RJ, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brasil / Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Virologia. Belém, PA, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brasil / Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Virologia. Belém, PA, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brasil / Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Virologia. Belém, PA, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Grupo Hospitalar Conceição. Departamento de Análises Clínicas. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Grupo Hospitalar Conceição. Departamento de Análises Clínicas. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Bioquímica e Imunologia. Laboratório de Microbiota e Imunomodulação. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal de Mato Grosso. Faculdade de Medicina. Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde. Cuiabá, MT, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Hospital das Clínicas. InCor. Laboratório de Genética Molecular e Cardiologia. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade do Estado do Pará. Centro de Ciências Biológicas da Saúde. Belém, PA, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade do Estado do Pará. Centro de Ciências Biológicas da Saúde. Belém, PA, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Hanseníase. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Laboratório de Diversidade Genética Humana. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios, Exantemáticos, Entéricos e Emergências Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios, Exantemáticos, Entéricos e Emergências Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Grupo Integrado de Pesquisa em Biomarcadores. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal do Pará. Programa de Pós-Graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brasil. | en_US |
| Afiliación | Universidade Federal de Mato Grosso. Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde. Faculdade de Medicina. Cuiabá, MT, Brasil. | en_US |
| Palavras clave en Inglês | HLA evolutionary divergence | en_US |
| Palavras clave en Inglês | SARS-CoV-2 | en_US |
| Palavras clave en Inglês | Human leukocyte antigen | en_US |
| e-ISSN | 1096-1208 | |
| Fecha de embargo | 2030-12-31 |
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