Please use this identifier to cite or link to this item: https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/8149
Title: HIV-1 diversity in Brazil: genetic, biologic, and immunologic characterization of HIV-1 strains in three potential HIV vaccine evaluation sites. Brazilian Network for HIV Isolation and Characterization
Authors: Bongertz, Vera
Bou-Habib, Dumith Chequer
Brígido, Luís Fernando de Macedo
Caseiro, Marcos Montani
Chequer, P. J. N
Fernandez, José Carlos Couto
Ferreira, P. C. P
Castro Filho, Bernardo Galvão
Greco, D
Guimarães, Monick Lindenmeyer
Carvalho, Maria Inês Linhares de
Morgado, Mariza Gonçalves
Oliveira, C. A
Osmanov, S
Ramos, C. A
Rossini, Marília Almeida Antunes
Sabino, Ester Cerdeira
Tanuri, Amilcar
Ueda, M
Affilliation: Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório e AIDS Imunologia Molecular. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Laboratório de Avançado de Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil
Instituto Adolfo Lutz. Laboratório de Retrovírus. São Paulo, SP, Brasil
Secretaria Municipal de Saúde. Centro de Referência de Aids. Santos, SP, Brasil
Ministério da Saúde. Coordenação Nacional de DST/AIDS. Brasília, DF, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Laboratório de Avançado de Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil
Universidade Federal de Minas Gerais. Departamento de Microbiologia e Imunologia. Belo Horizonte, MG, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Laboratório de Avançado de Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil
Universidade Federal de Minas Gerais. Faculdade de Medicina. Serviço de Imunodeficiências, Doenças Infecciosas e Parasitárias. Belo Horizonte, MG, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório e AIDS Imunologia Molecular. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Arquidiocese do Rio de Janeiro. Ambulatório do Banco da Providência. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório e AIDS Imunologia Molecular. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Instituto Adolfo Lutz. Seção de Sorologia. São Paulo, SP, Brasil
Joint United Nations' Progamme on HIV/AIDS, UNAIDS. Geneva, Switzerland
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Laboratório de Virologia Molecular. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Instituto Adolfo Lutz. Laboratório de Retrovírus. São Paulo, SP, Brasil
Fundação Pro-Sangue/Hemocentro de São Paulo. São Paulo, SP, Brasil / Instituto Adolfo Lutz. Serviço de Microbiologia. São Paulo, SP, Brasil
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Laboratório de Virologia Molecular. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Instituto Adolfo Lutz. Seção de Sorologia. São Paulo, SP, Brasil
Abstract: The Brazilian Network for HIV Isolation and Characterization was established for the surveillance of HIV variability in Brazil. Here, we report characterization of HIV strains and virus-specific immune responses from 35 clinical samples collected from three potential HIV vaccine sites. Three genetic subtypes of HIV-1 were identified by heteroduplex mobility assay (HMA) B (in 82.9% of the samples), F (14.3%), and C (2.9%). Phylogenetic analysis based on the C2V3/env DNA sequence from all 25 specimens examined was 100% concordant with HMA results. Four variants of subtype B with different tetrapeptides at the tip of the V3 loop were found: the GPGR motif (North American), GWGR motif (Brazilian B"), and two minor variants, GFGR and GPGS, as previously detected. No significant association was found between HIV-1 subtypes and the mode of transmission or biologic properties of HIV-1 isolates (derived from 88.6% of the specimens). Only 5 of 16 isolates studied were neutralized by the autologous sera. Consistent with previous results, no relation between viral subtype and peptide enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) seroreactivity or neutralization was evident. This study also demonstrated the effectiveness of the collaborative approach followed by Brazilian scientists when addressing a complex subject such as HIV variability.
Keywords: HIV-1
Polymorphism
Molecular epidemiology
Brazil
DeCS: Vacinas contra a AIDS
Infecções por HIV/epidemiologia
HIV-1/classificação
Adolescente
Adulto
Sequência de Aminoácidos
Brasil/epidemiologia
Feminino
Proteína gp120 do Envelope de HIV/análise
Infecções por HIV/virologia
HIV-1/genética
Humanos
Masculino
Meia-Idade
Dados de Sequência Molecular
Fragmentos de Peptídeos/análise
Filogenia
Fatores de Risco
Análise de Sequência
Issue Date: 2000
Publisher: Lippincott Williams & Wilkins
Citation: BONGERTZ, V. et al. HIV-1 diversity in Brazil: genetic, biologic, and immunologic characterization of HIV-1 strains in three potential HIV vaccine evaluation sites. Brazilian Network for HIV Isolation and Characterization. Journal of Acquired Immune Deficience Syndromes, v. 23, n. 2, p. 184-193, 2000.
ISSN: 1525-4135
Copyright: open access
Appears in Collections:BA - IGM - Artigos de Periódicos

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Bongertz V HIV -1 diversity....pdf7.17 MBAdobe PDFView/Open


FacebookTwitterDeliciousLinkedInGoogle BookmarksBibTex Format mendeley Endnote DiggMySpace

Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.