| Author | Morgado, Mariza Gonçalves | |
| Author | Guimarães, Monick Lindenmeyer | |
| Author | Gripp, Carmen B. G. | |
| Author | Costa, Catia Ines | |
| Author | Neves Junior, Ivan | |
| Author | Veloso, Valdiléa G. | |
| Author | Carvalho, Maria Inês Linhares de | |
| Author | Castello-Branco, Luis Roberto Ribeiro | |
| Author | Bastos, Francisco Inácio Pinkusfeld Monteiro | |
| Author | Kuiken, Carla | |
| Author | Castilho, Euclides Ayres de | |
| Author | Castro Filho, Bernardo Galvão | |
| Author | Bongertz, Vera | |
| Access date | 2014-08-12T17:52:20Z | |
| Available date | 2014-08-12T17:52:20Z | |
| Document date | 1998 | |
| Citation | MORGADO, Mariza Gonçalves et al. Molecular epidemiology of HIV-1 in Brazil: high prevalence of HIV-1 subtype B and identification of an HIV-1 subtype D infection in the city of Rio de Janeiro, Brazil. Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes and Human Retrovirology, v. 18, n. 5, p. 488-494, 1998. | en_US |
| ISSN | 1077-9450 | |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/8192 | |
| Language | eng | en_US |
| Publisher | Lippincott-Raven Publishers, Philadelphia | en_US |
| Rights | open access | en_US |
| Title | Molecular epidemiology of HIV-1 in Brazil: high prevalence of HIV-1 subtype B and identification of an HIV-1 subtype D infection in the city of Rio de Janeiro, Brazil | en_US |
| Type | Article | en_US |
| DOI | 10.1097/00042560-199808150-00011 | |
| Abstract | HIV-1-positive individuals were recruited from January 1993 to December 1996 from several cohorts receiving follow-up in the city of Rio de Janeiro, Brazil, to evaluate HIV-1 genetic variability and the potential association with modes of transmission. HIV-1 subtyping was carried out using the heteroduplex mobility assay (HMA), and those samples corresponding to the typical Brazilian subtype B variant were further identified based on the Fok I restriction fragment length polymorphism (RFLP). DNA sequencing was performed to evaluate one case of subtype D infection. From the 131 HIV-1-positive individuals analyzed, 106 (80.9%) could be identified as infected by subtype B and 20 (15.3%) by subtype F. One of the samples (0.8%) was classified as subtype D. DNA samples from 4 patients (3.0%) did not yield polymerase chain reaction (PCR)-amplified products to be typed. Based on the Fok I RFLP, 39 of the 106 subtype B samples (37%) were identified as corresponding to the typical Brazilian subtype B variant containing the GWGR motif at the tip of the V3 loop. No statistically significant association could be detected between HIV-I subtypes and modes of transmission, exposure categories, or gender. This is the first reported case of HIV-1 subtype D infection in Brazil | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Hospital Evandro Chagas. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Hospital Evandro Chagas. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Hospital Evandro Chagas. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Hospital Evandro Chagas. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Hospital Evandro Chagas. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Hospital Evandro Chagas. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Hospital Evandro Chagas. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Hospital Evandro Chagas. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Tecnologia da Informação e Comunicação em Saúde. Department of Health Information. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Los Alamos National Laboratories. Los Alamos, New Mexico, USA. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Tecnologia da Informação e Comunicação em Saúde Department of Health Information. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Brazilian Ministry of Health. National Coordination of STD/AIDS. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Laboratório Avançado de Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Hospital Evandro Chagas. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Hospital Evandro Chagas. Departamento de Imunologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Subject | HIV-1 subtypes in Brazil | en_US |
| Subject | Heteroduplex mobility assay | en_US |
| Subject | HIV-1 subtype D infection | en_US |
| DeCS | Infecções por HIV/epidemiologia | en_US |
| DeCS | HIV-1/classificação | en_US |
| DeCS | Sequência de Aminoácidos | en_US |
| DeCS | Brasil/epidemiologia | en_US |
| DeCS | Estudos de Coortes | en_US |
| DeCS | Sequência Consenso | en_US |
| DeCS | DNA Viral/química | en_US |
| DeCS | Feminino | en_US |
| DeCS | Produtos do Gene env/química | en_US |
| DeCS | Variação Genética | en_US |
| DeCS | Infecções por HIV/transmissão | en_US |
| DeCS | HIV-1/genética | en_US |
| DeCS | Humanos | en_US |
| DeCS | Masculino | en_US |
| DeCS | Epidemiologia Molecular | en_US |
| DeCS | Dados de Sequência Molecular | en_US |
| DeCS | Ácidos Nucleicos Heteroduplexes | en_US |
| DeCS | Filogenia | en_US |
| DeCS | Reação em Cadeia da Polimerase | en_US |
| DeCS | Polimorfismo de Fragmento de Restrição | en_US |
| DeCS | Prevalência | en_US |
| DeCS | Alinhamento de Sequência | en_US |
| DeCS | Distribuição por Sexo | en_US |
| DeCS | População Urbana | en_US |
