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Title: Molecular epidemiology of HIV-1 in Santa Catarina State confirms increases of subtype C in Southern Brazil.
Authors: Locateli, Dayse
Stoco, Patrícia Hermes
Queiroz, Artur Trancoso Lopo de
Alcantara, Luiz Carlos Júnior
Ferreira, Luiz G. E
Zanetti, Carlos Roberto
Rodrigues, Rosângela
Grisard, Edmundo Carlos
Pinto, Aguinaldo R
Affilliation: UFSC. Laboratório de Imunologia Aplicada. Departamento de Microbiologia e Parasitologia. Florianópolis, SC, Brasil
UFSC. Laboratórios de Protozoologia e de Bioinformática. Departamento de Microbiologia e Parasitologia. Florianópolis, SC, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Laboratório Avançado de Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil / Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. FBDC. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Laboratório Avançado de Saúde Pública. Salvador, BA, Brasil / Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. FBDC. Salvador, BA, Brasil
Hospital Regional Homero de Miranda Gomes. São José, SC, Brasil
UFSC. Laboratório de Imunologia Aplicada. Departamento de Microbiologia e Parasitologia. Florianópolis, SC, Brasil
Instituto Adolfo Lutz. Laboratório de Retrovírus. São Paulo, SP, Brasil
UFSC. Laboratórios de Protozoologia e de Bioinformática. Departamento de Microbiologia e Parasitologia. Florianópolis, SC, Brasil
UFSC. Laboratório de Imunologia Aplicada. Departamento de Microbiologia e Parasitologia. Florianópolis, SC, Brasil
Abstract: Recent studies have demonstrated an increased prevalence of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) subtype C in southern Brazil. Although Santa Catarina State (SC) is located in this area and presents one of the country's highest incidences of HIV/AIDS, knowledge on the molecular epidemiology of HIV-1 in such State is lacking. The aim of this study was to investigate the HIV-1 molecular diversity and epidemiological profile of HIV-1-infected patients from SC. DNA samples were PCR amplified and HIV-1 subtypes were determined using both env and gag genes by direct sequencing. Phylogenetic analyses revealed that 48% were subtype C and 23% were subtype B. Possible recombinant forms were observed for both B/C (23%) and B/F (6%) subtypes. Our results, for the first time, identifies HIV-1 subtype C as a major clade circulating in SC and contributes to the understanding of HIV epidemics in the country by confirming the epidemic spread of the HIV-1 subtype C in southern Brazil.
Keywords: AIDS
HIV
Subtypes
Brazil
DeCS: Infecções por HIV/epidemiologia
HIV-1/genética
Epidemiologia Molecular
Adulto
Brasil/epidemiologia
Feminino
Genes env/genética
Variação Genética
HIV-1/classificação
Masculino
Humanos
Filogenia
Recombinação Genética
Issue Date: 2007
Publisher: Wiley-Liss, INC
Citation: LOCATELI, D. et al. Molecular epidemiology of HIV-1 in Santa Catarina State confirms increases of subtype C in Southern Brazil. Journal of Medical Virology, v. 79, n. 10, p. 1455-1463, 2007
DOI: 10.1002/jmv.20955
ISSN: 0146-6615
Copyright: open access
Appears in Collections:BA - IGM - Artigos de Periódicos

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