Author | Clementino, Maysa Beatriz Mandetta | |
Author | Filippis, Ivano de | |
Author | Nascimento, Carlos Roberto Sobrinho do | |
Author | Branquinho, Maria Regina | |
Author | Rocha, Carmem Lucia | |
Author | Martins, Orlando Bonifácio | |
Access date | 2015-07-13T17:56:02Z | |
Available date | 2015-07-13T17:56:02Z | |
Document date | 2001 | |
Citation | CLEMENTINO, M. B. M. et al. PCR analyses of tRNA intergenic spacer, 16S-23S internal transcribed spacer, and randomly amplified polymorphic DNA reveal inter- and intraspecific relationships of Enterobacter cloacae strains. J. Clin. Microbiol., Washington DC, v. 39, n. 11, p. 3865-3870, 2001. | pt_BR |
ISSN | 0095-1137 | |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/11284 | |
Language | eng | pt_BR |
Publisher | American Society for Microbiology | pt_BR |
Rights | open access | pt_BR |
Subject in Portuguese | DNA Intergênico | pt_BR |
Subject in Portuguese | DNA Espaçador Ribossômico | pt_BR |
Subject in Portuguese | Enterobacter cloacae | pt_BR |
Subject in Portuguese | Infecções por Enterobacteriaceae | pt_BR |
Subject in Portuguese | Filogenia | pt_BR |
Subject in Portuguese | Reação em Cadeia da Polimerase | pt_BR |
Subject in Portuguese | Técnica de Amplificação ao Acaso de DNA Polimórfico | pt_BR |
Title | PCR analyses of tRNA intergenic spacer, 16S-23S internal transcribed spacer, and randomly amplified polymorphic DNA reveal inter- and intraspecific relationships of Enterobacter cloacae strains | en |
Type | Article | pt_BR |
DOI | http://dx.doi.org/10.1128/jcm.39.11.3865-3870.2001 | |
Abstract | PCR analysis of tRNA intergenic spacer (tDNA-PCR) and of the 16S-23S internal transcribed spacer (ITS-PCR) and random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis were evaluated for their usefulness in characterization of Enterobacter cloacae strains isolated from both clinical origins and vaccine microbial contamination. tDNA-PCR presented specific and reproducible patterns for Enterobacter sakazakii ATCC 29004, Enterobacter aerogenes ATCC 13048, and Enterobacter cloacae ATCC 13047 and 23355 that presented the same profile for all 16 E. cloacae isolates, offering an alternative tool for species-level identification. ITS-PCR and RAPD analysis yielded completely different banding patterns for the 20 strains studied, except for E. cloacae strains isolated from different batches of vaccine that exhibited a unique pattern, suggesting contamination by the same strain. The combined use of tDNA-PCR and ITS-PCR in a one-step protocol allows accurate identification and typing of E. cloacae strains a few hours after the colony has been isolated. | en |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Departamento de Microbiologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Departamento de Microbiologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Departamento de Microbiologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Departamento de Microbiologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Departamento de Microbiologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Ciências Biomédicas. Centro de Ciência da Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Subject | DNA, Intergenic | en |
Subject | DNA, Ribosomal Spacer | en |
Subject | Enterobacter cloacae | en |
Subject | Enterobacteriaceae Infections | en |
Subject | Phylogeny | en |
Subject | Polymerase Chain Reaction | en |
Subject | Random Amplified Polymorphic DNA Technique | en |
DeCS | DNA Intergênico | pt_BR |
DeCS | DNA Espaçador Ribossômico | pt_BR |
DeCS | Enterobacter cloacae | pt_BR |
DeCS | Infecções por Enterobacteriaceae | pt_BR |
DeCS | Filogenia | pt_BR |
DeCS | Reação em Cadeia da Polimerase | pt_BR |
DeCS | Técnica de Amplificação ao Acaso de DNA Polimórfico | pt_BR |