Avaliação de poluição biológica no Complexo de Manguinhos usando marcadores moleculares e filogenia molecular

Abstract

Indicares de poluição tais como Escherichia coli e coliformes totais são universalmente utilizados para avaliar a qualidade da água. No entanto, vem sendo descrito na literatura, uma série de marcadores moleculares de poluição que forneceriam uma avaliação mais precisa e abrangente de poluição em corpos hídricos. Foi avaliada a poluição biológica em três rios que percorrem o Complexo de Maguinhos (rios Faria-Timbó, Jacaré e Canal do Cunha), através do teste por PCR (Reação da polimerase em cadeia) com os marcadores moleculares 16S rRNA, uidA, nifH, HadV, T-antigen, COWP e beta-giardin para bactérias, vírus e protozoários que vem sendo utilizados como marcadores de poluição biológica, por serem microrganismos associados à humanos. Foi avaliado também o relacionamento filogenético dos marcadores de poluição através de ferramentas de filogenia molecular no MEGA versão 6, com o método de construção Neighbor-joining e matriz de distância -p, além de análises in silico para avaliar a detecção dos marcadores no metagenoma da Baía de Guanabara Todos os PCRs com os marcadores moleculares apresentaram-se positivos com exceção de Cryptosporidium spp. O resultado do sequenciamento seguido de análises in silico como BLASTN contra o banco de dados REFSEQ do NCBI (Centro Nacional para informação Biotecnológica) demonstram similaridade entre as sequências obtidas e as sequências de nucleotídeos disponíveis nas bases de dados. A filogenia mostrou pouca variabilidade entre as sequencias o que dificultou ter uma boa avaliação do relacionamento filogenético entre os marcadores. Pelo uso dos marcadores moleculares no presente estudo, fomos capazes de detectar poluição antrópica e mostrar a biodiversidade da poluição microbiológica que pode ser encontrado em águas contaminadas por esgoto