RSS 1.0Programa de Pós-Graduação em Biologia Computacional e Sistemas (PGBCS)
O Programa de Pós-Graduação Stricto Sensu de Biologia Computacional e Sistemas do Instituto Oswaldo Cruz (PGBCS/IOC/FIOCRUZ) teve seus cursos de mestrado e doutorado credenciados pela Capes em 2007.
Saiba mais sobre o PGBCS em: http://pgbcs.ioc.fiocruz.br/Collections in this community
Recent Submissions
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Análises de fenótipos através de bacias de atração do modelo booleano da rede de regulação gênica da Pseudomonas aeruginosa CCBH4851
| Date Issued: 2023A Pseudomonas aeruginosa é uma das principais bactérias multirresistentes responsáveis por infecções nosocomiais mundialmente, incluindo a cepa CCBH4851, isolada no Brasil. Uma maneira de analisar seu comportamento celular ... -
Detecção síncrona de patógenos humanos em metatranscriptomas de amostras ambientais
| Date Issued: 2024A vigilância e descoberta de patógenos é um desafio devido à própria diversidade de patógenos e de espécies hospedeiras. As tecnologias de sequenciamento de alto desempenho têm se mostrado promissoras para o desenvolvimento ... -
Biomarcadores de prognóstico da HAM/TSP e o papel do líquido cefalorraquidiano na modulação do transcriptoma de células neurais na infecção por HTLV-1
| Date Issued: 2024O vírus linfotrópico para células T humanas do tipo 1 (HTLV-1) é um retrovírus associado ao desenvolvimento da mielopatia associada ao HTLV-1/paraparesia espástica tropical (HAM/TSP). A HAM/TSP resulta de uma resposta ... -
Metodologia in silico para investigação da presença de atratores de câncer: um estudo de caso para glioblastoma multiforme
| Date Issued: 2024Apesar dos avanços na compreensão e tratamento, o câncer continua sendo uma das principais causas de mortalidade globalmente. Estudos utilizando dados de sequenciamento de RNA de célula única (scRNA-seq) demonstram a relação ... -
Ab-SELDON: uma rotina de modificação de CDRs para uso em desenho computacional de anticorpos
| Date Issued: 2024Com o crescente interesse no desenvolvimento de biofármacos, o uso de ferramentas de bioinformática tem se tornado cada vez mais comum nesta área. O uso dessas ferramentas reduz os custos e acelera o desenvolvimento dessas ... -
Prospecção de inibidores da enoil-ACP redutase de Plasmodium falciparum a partir de abordagens in silico e in vitro
| Date Issued: 2024A malária, é uma doença parasitária causada por protozoários do gênero Plasmodium. O Plasmodium falciparum é a espécie mais virulenta e responsável por formas graves da doença. Apesar da disponibilidade de medicamentos ... -
Desenvolvimento de um anticorpo não-competitivo para a proteína de morte celular programada 1 de Homo sapiens (HsPD-1) por meio de métodos computacionais
| Date Issued: 2024A via da Proteína de Morte Celular Programada 1 (PD-1) e seu Ligante 1 (PD-L1) tem sido identificada como um alvo terapêutico significativo, uma vez que a sua inibição, principalmente por meio de anticorpos monoclonais, ... -
Reposicionamento de fármacos e busca por substâncias bioativas voltados à terapêutica da Covid-19
| Date Issued: 2022A Covid-19 é um quadro clínico de síndrome respiratória aguda, causado pelo vírus SARS-CoV-2, cuja pandemia foi declarada no início de 2020. Entre dezembro de 2019 e outubro de 2022, cerca de 620 milhões de pessoas já foram ... -
Uso da proteogenômica como abordagem metodológica para investigação de novos genes e variantes moleculares em modelos biológicos de importância médica
| Date Issued: 2022A transcriptômica tem o sequenciamento em larga escala de moléculas de RNA (RNA-Seq) como o método mais utilizado atualmente para o estudo qualitativo e quantitativo dessa classe de moléculas. A proteômica tem a espectrometria ... -
Diversidade taxonômica e funcional do microbioma intestinal de indivíduos Yanomami
| Date Issued: 2020A composição e funcionalidade do microbioma intestinal humano é influenciada por fatores endógenos e exógenos do hospedeiro, como dieta, estilo de vida e o ambiente. Portanto, estudos focados em grupos que ainda mantêm ... -
Reconstruction of the Molecular Signatures and Dissemination Dynamics of Non-pandemic and Pandemic Variants of the Human Immunodeficiency Viruses Type 1 Subtype B in the Americas
| Date Issued: 2022O subtipo B do HIV-1 é o subtipo do grupo M mais disseminado no mundo. Sua história foi marcada por dois eventos de fundação, o primeiro na Ilha de Hispaniola, o segundo na cidade de Nova York, nos EUA. Ambos levaram a ... -
Genoma de Rhodnius prolixus: predição gênica, conciliação com versões anteriores e disponibilização em navegador web
| Date Issued: 2022A doença de Chagas é uma doença tropical negligenciada que somente possui tratamento paliativo, logo, deve ser contida por medidas de urbanização e controle vetorial. O protozoário Trypanosoma cruzi, causador da doença, é ... -
Otimização in silico de fragmentos ligados a Tiorredoxina Glutationa Redutase de S. mansoni (SmTGR) para a proposta de novas moléculas com atividade esquistossomicida
| Date Issued: 2021A esquistossomose é uma doença tropical negligenciada parasitária causada por trematódeos do gênero Schistosoma. O tratamento está baseado na quimioterapia com o praziquantel (PZQ), o qual apresenta muito sucesso. Entretanto, ... -
Weather-driven mathematical models of dengue transmission dynamics in twelve Brazilian sites
| Date Issued: 2021Esta tese investiga modelos matemáticos para avaliar o papel das flutuações climáticas na dinâmica da dengue (DENV) de 2010 a 2019. Os modelos de transmissão propostos foram baseados em um modelo SEIR, que incorpora a ... -
Análise do perfil filogenético de enzimas isofuncionais não homólogas entre cepas patogênicas de Escherichia Coli
| Date Issued: 2020Escherichia coli é uma bactéria Gram-negativa e em sua variedade possui cepas não patogênicas e patogênicas. Cepas não patogênicas pertencem naturalmente a nossa microbiota intestinal, desempenhando funções benéficas ao ... -
Prospecção computacional de alvos para o desenvolvimento de uma vacina contra Leishmania spp
| Date Issued: 2021A vacinação é uma das iniciativas de saúde pública mais bem-sucedidas. Apesar do sucesso, vacinas para muitas doenças ainda não foram desenvolvidas e diversas estratégias foram elaboradas para identificar candidatos vacinais ... -
A Cartografia como ferramenta para identificação de potenciais áreas de expansão da infecção por Trypanosoma cruzi em Didelphis aurita na Mata Atlântica
| Date Issued: 2021Embora a Modelagem de Nicho Ecológico seja muito utilizada para modelar a distribuição potencial de animais no espaço ambiental e projetar no espaço geográfico, raramente é direcionada ao estudo de seus parasitas. O ... -
Analogia funcional no metabolismo humano: enzimas com distintos papéis biológicos ou redundância funcional?
| Date Issued: 2017Uma vez que as enzimas catalisam quase todas as reações químicas que ocorrem nos organismos vivos, é crucial que os genes que codificam essas atividades sejam corretamente identificados e funcionalmente caracterizados. ... -
Avaliação in silico da interação entre o receptor GABAA e metalocompostos derivados de benzodiazepínicos
| Date Issued: 2019O receptor do ácido \03B3-aminobutírico do tipo A (GABAA) é o receptor de ação rápida mais amplamente distribuído no sistema nervoso central (SNC) dos mamíferos. Os receptores GABAA são canais iônicos pentaméricos ... -
Caracterização de mecanismos de regulação transcricional dos genes do sistema de secreção do tipo VI em Klebsiella pneumoniae
| Date Issued: 2019Klebsiella pneumoniae é um patógeno oportunista que causa principalmente infecções respiratórias e do trato urinário. A ocorrência frequente de isolados virulentos resistentes a múltiplas drogas levou a inclusão dessa ...