Diversidade taxonômica e funcional do microbioma intestinal de indivíduos Yanomami

Abstract

A composição e funcionalidade do microbioma intestinal humano é influenciada por fatores endógenos e exógenos do hospedeiro, como dieta, estilo de vida e o ambiente. Portanto, estudos focados em grupos que ainda mantêm modos tradicionais de subsistência fundamentam a compreensão da evolução do microbioma intestinal humano e sua associação com a saúde e doença humana. No presente estudo, geramos e analisamos metagenomas do microbioma intestinal de um grupo semi-isolado da Amazônia brasileira, os Yanomami. Para comparação, analisamos dados metagenômicos de estudos anteriores com grupos tradicionais (os Yanomami da Amazônia venezuelana, os Matses da Amazônia peruana e os Tunapuco dos Andes) e um grupo urbano (indivíduos de uma região urbano-industrializada dos Estados Unidos). No geral, os microbiomas dos Yanomami do Brasil e dos outros grupos tradicionais da América do Sul apresentam características taxonômicas e funcionais que os tornam mais semelhantes entre si do que quando comparados ao grupo urbano. No entanto, tanto taxonomicamente quanto funcionalmente, foram observadas características únicas em cada grupo estudado. Maior abundância do filo Proteobacteria, do gênero Ralstonia e de famílias gênicas associadas com regulação/sinalização celular, motilidade/quimiotaxia e virulência são características únicas dos Yanomami do Brasil. Dentre os fatores de virulência identificados nos Yanomami do Brasil estão enterotoxinas que parecem estar associadas a cepas de Escherichia coli. Considerando genes de resistência a antibióticos, os Yanomami do Brasil apresentaram genes clinicamente relevantes em sociedades ocidentalizadas, com uma alta abundância de genes associados à resistência a fluoroquinolonas Interessantemente, alguns desses genes estão sendo carreados por plasmídeos globalmente identificados e que estão presentes tanto nos Yanomami do Brasil como em outros grupos tradicionais da América do Sul e África