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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/68923
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ThesisCopyright
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Sustainable Development Goals
03 Saúde e Bem-Estar09 Indústria, inovação e infraestrutura
17 Parcerias e meios de implementação
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BIOMARCADORES DE PROGNÓSTICO DA HAM/TSP E O PAPEL DO LÍQUIDO CEFALORRAQUIDIANO NA MODULAÇÃO DO TRANSCRIPTOMA DE CÉLULAS NEURAIS NA INFECÇÃO POR HTLV-1
Paraparesia Espástica Tropical
Biomarcadores
Proteômica
Perfilação da Expressão Gênica
Gomes, Yago Côrtes Pinheiro | Date Issued:
2024
Alternative title
Prognostic biomarkers for HAM/TSP and the role of the cerebrospinal fluid in modulating the transcriptome of neural cells in HTLV-1 infectionAuthor
Advisor
Co-advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Programa de Pós-Graduação em Biologia Computacional e Sistemas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
O vírus linfotrópico para células T humanas do tipo 1 (HTLV-1) é um retrovírus associado ao desenvolvimento da mielopatia associada ao HTLV-1/paraparesia espástica tropical (HAM/TSP). A HAM/TSP resulta de uma resposta inflamatória de células T citotóxicas contra células T CD4⁺ infectadas no sistema nervoso central (SNC). Os mecanismos de patogênese dessa doença ainda não são totalmente compreendidos e biomarcadores de prognóstico necessitam de definição. Este estudo teve como objetivo identificar biomarcadores para a HAM/TSP e avaliar o papel do líquido cefalorraquidiano (LCR) em sua patogênese. Amostras de LCR de portadores assintomáticos de HTLV-1 (n=13) e de pacientes com HAM/TSP de progressão rápida (n=6), típica/lenta (n=9) e muito lenta (n=6) foram analisadas por espectrometria de massas. Os resultados foram validados pelo ensaio imunoabsorção enzimática (ELISA) em amostras pareadas de LCR e soro, e em amostras de indivíduos soronegativos (n=9). A modulação do transcriptoma de células neurais pelo LCR foi avaliada por RNA-Seq de células de glioblastoma (linhagem U87) após 6h e 24h de incubação, e as alterações confirmadas por microscopia de fluorescência. Na análise proteômica, processos de ativação de células/leucócitos, de resposta imune e de vias de neurodegeneração estavam enriquecidos no LCR de pacientes com progressão rápida. Em pacientes com HAM/TSP, a proteína chitotriosidase 1 (CHIT1) se mostrou aumentada no LCR, particularmente na HAM/TSP rápida. Os níveis dessa proteína correlacionaram com a pontuação do índice de progressão da doença, e com fatores inflamatórios e de morte neuronal no LCR. Corroborando esses resultados, a incubação de células por 24h com o LCR dos indivíduos com HAM/TSP rápida reduziu a transcrição do genoma mitocondrial. Processos e vias relacionados à fosforilação oxidativa e à cadeia transportadora de elétrons estavam enriquecidos entre os transcritos negativamente regulados. Por microscopia confocal, foi observado que a rede mitocondrial dessas células também apresentava alterações morfológicas após a incubação com o LCR de pacientes com HAM/TSP rápida. A associação dos níveis de CHIT1 no LCR com HAM/TSP rápida e sua correlação com biomarcadores de neuroinflamação e degeneração neuronal sugerem essa proteína como um potencial biomarcador de pior prognóstico de doença. Além disso, o LCR de pacientes com HAM/TSP rápida foi capaz de induzir alterações morfológicas e transcricionais em mitocôndrias de células da glia, provavelmente em resposta ao seu perfil inflamatório. Desta forma, é possível que o LCR desempenhe um papel na patogênese de HAM/TSP através da disseminação de respostas oxidativas que promovem a quebra da homeostase do SNC.
Abstract
Human T-cell lymphotropic virus type 1 (HTLV-1) is a retrovirus associated with the development of HTLV-1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis (HAM/TSP). HAM/TSP results from an inflammatory response of cytotoxic T cells against infected CD4⁺ T cells in the central nervous system (CNS). The mechanisms of pathogenesis of this disease are still not fully understood and prognostic biomarkers still need to be defined. This study aimed to identify biomarkers for HAM/TSP, and to evaluate the role of cerebrospinal fluid (CSF) in its pathogenesis. CSF samples from asymptomatic HTLV-1 carriers (n=13) and HAM/TSP patients with rapid (n=6), typical/slow (n=9) and very slow (n=6) progression were analyzed by mass spectrometry. The results were validated by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) on paired CSF and serum samples, and on samples from seronegative individuals (n=9). The modulation of the transcriptome of neural cells by the CSF was assessed by RNA-Seq of glioblastoma cells (U87 strain) after 6h and 24h of incubation. Alterations were confirmed by fluorescence microscopy. Biological processes of cell/leukocyte activation, immune response and neurodegeneration pathways were enriched in rapid HAM/TSP. In HAM/TSP patients, chitotriosidase 1 protein (CHIT1) was increased in the CSF, particularly in rapid HAM/TSP. CHIT1 levels in HAM/TSP patients correlated with the rate of disease progression, and with factors of inflammation and neuronal death in the CSF. Corroborating these results, cell incubation for 24h with the CSF from individuals with rapid HAM/TSP induced a downregulation of mitochondrial gene transcription. In proteomic analysis, processes and pathways related to oxidative phosphorylation and the electron transport chain were enriched among the downregulated transcripts. By confocal microscopy, it was observed that the mitochondrial network of these cells also showed morphological changes when incubated with the CSF from rapid HAM/TSP. The association of CSF CHIT1 levels with rapid HAM/TSP and its correlation with biomarkers of neuroinflammation and neuronal degeneration suggest this protein as a potential biomarker of worse disease prognosis. In addition, the CSF of patients with rapid HAM/TSP was able to induce morphological and transcriptional changes in mitochondria of glial cells, likely in response to their inflammatory profile. However, factors and pathways associated with this oxidative stress need further investigation. Thus, it is possible that the CSF plays a role in HAM/TSP pathogenesis through the dissemination of oxidative responses that promote CNS homeostasis breakdown.
Keywords in Portuguese
Vírus Linfotrópico T Tipo 1 HumanoParaparesia Espástica Tropical
Biomarcadores
Proteômica
Perfilação da Expressão Gênica
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