Reposicionamento de fármacos e busca por substâncias bioativas voltados à terapêutica da Covid-19

Abstract

A Covid-19 é um quadro clínico de síndrome respiratória aguda, causado pelo vírus SARS-CoV-2, cuja pandemia foi declarada no início de 2020. Entre dezembro de 2019 e outubro de 2022, cerca de 620 milhões de pessoas já foram infectadas em todo o mundo, e, 6,5 milhões foram a óbito. Atualmente, há vacinas importantes no controle da evolução a casos graves da doença. Contudo, os fármacos aprovados por agências reguladoras ainda apresentam certa vulnerabilidade quanto ao tratamento, uma vez que podem apresentar toxicidade significativa e devem ser administrados em fases específicas da doença. O patógeno, pertencente à família Coronaviridae, possui RNA positivo de fita simples, responsável pela produção de duas poliproteínas principais. O material proteico, por sua vez, é clivado por proteases, dando origem às proteínas virais maduras responsáveis pela montagem de novos vírus. A maior parte dos pontos de cisão é realizada pela enzima 3CLpro, tornando-a, assim, um alvo promissor para o desenvolvimento de fármacos que possam atuar como seus inibidores no tratamento da Covid-19. Este trabalho propõe a busca por fármacos aprovados e produtos naturais - incluindo aqueles pertencentes à flora brasileira, que apresentem potencial inibitório contra a 3CLpro do SARS-CoV-2, através de abordagens computacionais. As metodologias empregadas foram divididas em três etapas principais: (I) preparação do alvo e obtenção de parâmetros para ancoramento molecular, (II) avaliação da interação de flavonoides oriundos de espécies de Siparuna cristata com a 3CLpro (PDBid 6XQT), utilizando o programa AutoDock Vina; e, (III) análise de interação desta mesma protease com produtos naturais e fármacos, por meio da triagem virtual com AutoDock Vina e GOLD Suite (Função de pontuação: ChemPLP e GoldScore) Como resultado da triagem, foram classificados vinte produtos naturais e oito fármacos como possíveis inibidores da 3CLpro de SARS-CoV2. Além desses, foram mapeados seis outros produtos naturais como prováveis inibidores alostéricos da 3CLpro de SARS-CoV-2