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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/31802
IDENTIFICAÇÃO DE ESPÉCIES DE MICOBACTÉRIAS DE INTERESSE MÉDICO ATRAVÉS DE UM SISTEMA DA PCR MULTIPLEX
Diagnóstico Laboratorial
Mycobacterium tuberculosis
Reação em Cadeia da Polimerase
Mycobacterium tuberculosis
Polymerase Chain Reaction
Laboratory Diagnosis
Caldas, Paulo Cesar de Souza | Date Issued:
2016
Alternative title
Identification of species of Mycobacteria of medical interest through a multiplex PCR systemAuthor
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Escola Nacional de Saúde Pública Sergio Arouca. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
O Complexo Mycobacterium tuberculosis e outras espécies denominadas micobactérias
não causadoras de tuberculose (MNT), além do M. leprae constituem o gênero
Mycobacterium. As espécies de MNT mais isoladas no Brasil são as do Complexo M. avium
(44,4%), M. kansasii (13,7%), M. fortuitum (10,8%) e M. abscessus (9,5%). A identificação
das MNT é realizada através de métodos baseados na avaliação de características das culturas
e na realização de testes bioquímicos simples, porém demorados, além de alguns testes
moleculares, que são na sua maioria caros. Este trabalho teve como objetivo avaliar uma PCR
Multiplex em amostras de MNT isoladas no Laboratório de Referência Nacional em
Tuberculose e Outras Micobacterioses do Centro de Referência Professor Hélio
Fraga/ENSP/Fiocruz no período de 2014 e 2015 e diferencia-las do Complexo M.
tuberculosis. Todas as amostras foram previamente identificadas através da metodologia do
PRA-hsp65 (PCR com Análise de Enzima de Restrição). Para avaliar a concordância entre os
diferentes testes foi utilizada a medida Kappa, que apresentou um excelente grau de
concordância da PCR multiplex de 100% (Kappa = 1), para todas as espécies que foram
utilizadas.A PCR Multiplex, mostrou ser uma ferramenta fácil de executar, rápida, e que
possibilitou a amplificação simultânea de mais de uma sequência de DNA alvo em uma única
reação, resultando em economia de tempo e de reagentes, na identificação das espécies
utilizadas. A PCR multiplex pode representar uma ferramenta alternativa de diagnóstico útil
para a identificação laboratorial das micobactérias de interesse médico mais frequentemente
isoladas.
Abstract
The Mycobacterium tuberculosis complex and other species named non tuberculous
mycobacteria (NTM), and M. leprae constitutes the genus Mycobacterium. The most isolated
NTM species in Brazil are the complex M. avium (44.4%), M. kansasii (13.7%), M. fortuitum
(10.8%) and M. abscessus (9.5%). The identification of NTM is carried out by methods based
on evaluation of characteristics of the cultures and carrying out biochemical tests, simple but
time consuming. This study aimed to evaluate a Multiplex PCR in isolated MNT samples at
the National Reference Laboratory for Tuberculosis and Other Mycobacteriosis of Centro
Referência Professor Hélio Fraga / ENSP / Fiocruz in 2014 and 2015 period and differentiates
them from complex M. tuberculosis. All samples were identified previously by the hsp65 PRA
methodology (PCR Restriction Enzyme Analysis). To evaluate the correlation between the
different tests we used the Kappa measure, which presented an excellent degree of
concordance of multiplex PCR of 100% (Kappa = 1), for all studied species that were the
used. The Multiplex PCR has proved to be an easy tool to perform, quickly, and which
enabled the simultaneous amplification of more than one target DNA sequence in a single
reaction, resulting in time and economic reagents, identification of the species used. The
multiplex PCR may represent a useful diagnostic alternative tool for laboratory identification
of medical interest of mycobacteria more frequently isolated.
Keywords in Portuguese
Micobactérias não causadoras de TuberculoseDiagnóstico Laboratorial
Mycobacterium tuberculosis
Reação em Cadeia da Polimerase
Keywords
Mycobacteria NontuberculousMycobacterium tuberculosis
Polymerase Chain Reaction
Laboratory Diagnosis
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