Please use this identifier to cite or link to this item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/36619
Type
ArticleCopyright
Open access
Collections
- IOC - Artigos de Periódicos [12968]
Metadata
Show full item record
DETECTION OF CALICIVIRUS FROM FECAL SAMPLES FROM CHILDREN WITH ACUTE GASTROENTERITIS IN THE WEST CENTRAL REGION OF BRAZIL
Gastroenterite aguda
Reação em cadeia da transcriptase-polimerase reversa
Brasil
Author
Affilliation
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil.
Instituto de Saúde do Distrito Federal. Brasília, DF, Brasil.
Universidade Federal de Goiás. Faculdade de Medicina. Goiânia, GO, Brasil.
Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil.
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil.
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil.
Instituto de Saúde do Distrito Federal. Brasília, DF, Brasil.
Universidade Federal de Goiás. Faculdade de Medicina. Goiânia, GO, Brasil.
Universidade de Brasília. Departamento de Biologia Celular. Brasília, DF, Brasil.
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil.
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil.
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Virologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de Goiás. Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública. Laboratório de Virologia. Goiânia, GO, Brasil.
Abstract
The objective of this study was to describe the circulation of caliciviruses in the West Central region of Brazil and
its correlation with children s gender and age, as well as with the year and months of the sample collection. Reverse
transcriptase-polymerase chain reaction was performed to detect the human calicivirus genome in 1006 fecal
samples that were collected in Goiânia (n = 696) and Brasília (n = 310). Viral RNA was detected in 8.6% of the
samples. No significant difference in viral prevalence was found regarding gender, age or year of the sample.
However, it was observed that in Goiânia, there is a higher incidence of caliciviruses from September to March. The
analysis employing three primer pairs demonstrated that the Ni/E3 or JV12/13 primer pairs, which detect norovirus
(NoV), detected 41 positive samples while the 289/290 primer pair, which detects NoV or sapovirus, detected the
remaining 46 samples. Calicivirus circulates in the West Central region of Brazil and for better detection of this
virus it is important to use more than one primer pair. Also, we conclude that the seasonality presented by this virus
is related to higher humidity in the period.
Keywords in Portuguese
CalicivirusGastroenterite aguda
Reação em cadeia da transcriptase-polimerase reversa
Brasil
Share