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- IOC - Artigos de Periódicos [12973]
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LAMININ DATABASE: A TOOL TO RETRIEVE HIGH-THROUGHPUT AND CURATED DATA FOR STUDIES ON LAMININS
Alta produtividade
Ferramenta
Estudos sobre lamininas
Author
Affilliation
Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa sobre o Timo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa sobre o Timo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa sobre o Timo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil.
Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa sobre o Timo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa sobre o Timo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa sobre o Timo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil.
Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Pesquisa sobre o Timo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratório Nacional de Computação Científica. Laboratório de Bioinformática. Petrópolis, RJ, Brasil.
Abstract
The Laminin(LM)-database, hosted at http://www.lm.lncc.br, is the first database focusing a noncollagenous extracellular matrix protein family, the LMs. Part of the knowledge available in this website is automatically retrieved, whereas a significant amount of information is curated and annotated, thus placing LM-database beyond a simple repository of data. In its home page, an overview of the rationale for the database is seen and readers can access a tutorial to facilitate navigation in the website, which in turn is presented with tabs subdivided into LMs, receptors, extracellular binding and other related proteins. Each tab opens into a given LM or LM-related molecule, where the reader finds a series of further tabs for ‘protein’, ‘gene structure’, ‘gene expression’ and ‘tissue distribution’ and ‘therapy’. Data are separated as a function of species, comprising Homo sapiens, Mus musculus and Rattus novergicus. Furthermore, there is specific tab displaying the LM nomenclatures. In another tab, a direct link to PubMed, which can be then consulted in a specific way, in terms of the biological functions of each molecule, knockout animals and genetic diseases, immune response and lymphomas/leukemias. LM-database will hopefully be a relevant tool for retrieving information concerning LMs in health and disease, particularly regarding the hemopoietic system.
Keywords in Portuguese
Banco de dados de lamininasAlta produtividade
Ferramenta
Estudos sobre lamininas
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