| Author | Resende, Paola Cristina | |
| Author | Gräf, Tiago | |
| Author | Paixão, Anna Carolina Dias da | |
| Author | Appolinario, Luciana Reis | |
| Author | Lopes, Renata Serrano | |
| Author | Mendonça, Ana Carolina da Fonseca | |
| Author | Rocha, Alice Sampaio Barreto da | |
| Author | Motta, Fernando do Couto | |
| Author | Lima Neto, Lidio Gonçalves | |
| Author | Cunha, Antonio Ricardo Khouri | |
| Author | Oliveira, Camila Indiani de | |
| Author | Reis, Pedro Santos Muccillo | |
| Author | Bezerra, João Felipe | |
| Author | Teixeira, Dalane Loudal Florentino | |
| Author | Riediger, Irina Nastassja | |
| Author | Debur, Maria do Carmo | |
| Author | Rodrigues, Rodrigo Ribeiro | |
| Author | Leite, Anderson Brandão | |
| Author | Santos, Cliomar Alves do | |
| Author | Gregianini, Tatiana Schäffer | |
| Author | Fernandes, Sandra Bianchini | |
| Author | Bernardes, André Felipe Leal | |
| Author | Cavalcanti, Andrea Cony | |
| Author | Miyajima, Fábio | |
| Author | Sacchi, Claudio Tavares | |
| Author | Mattos, Tirza Peixoto | |
| Author | Costa, Cristiano Fernandes da | |
| Author | Delatorre, Edson | |
| Author | Wallau, Gabriel da Luz | |
| Author | Naveca, Felipe Gomes | |
| Author | Bello, Gonzalo | |
| Author | Siqueira, Marilda Agudo Mendonça Teixeira de | |
| Access date | 2021-05-10T15:37:19Z | |
| Available date | 2021-05-10T15:37:19Z | |
| Document date | 2021 | |
| Citation | RESENDE, Paola Cristina et al. A potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the Spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazil. bioRxiv, p. 1-9, 13 Mar. 2021. | |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/47114 | |
| Description | A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/ | pt_BR |
| Sponsorship | FAPEAM (PCTI-EmergeSaude/AM call 005/2020 and Rede Genômica de Vigilância em Saúde - REGESAM) | |
| Sponsorship | Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (grant 403276/2020-9) | |
| Sponsorship | Inova Fiocruz/Fundação Oswaldo Cruz (Grant VPPCB-007-FIO-18-2-30 - Geração de conhecimento) | |
| Language | eng | en_US |
| Publisher | bioRxiv | |
| Later version | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/52621 | |
| Rights | open access | |
| Subject in Portuguese | SARS-CoV-2 | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Betacoronavirus | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Epidemias | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Mutação | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Brasil | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Rede Genômica Fiocruz | pt_BR |
| Subject in Portuguese | GENOMAHCOV | pt_BR |
| Title | A potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the Spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazil (preprint) | en_US |
| Type | Preprint | |
| DOI | 10.1101/2021.03.12.434969 | |
| Abstract | The SARS-CoV-2 epidemic in Brazil was dominated by two lineages designated as B.1.1.28 and B.1.1.33. Two SARS-CoV-2 variants harboring mutations at the receptor-binding domain of the Spike (S) protein, designated as lineages P.1 and P.2, evolved within lineage B.1.1.28 and are rapidly spreading in Brazil. Lineage P.1 is considered a Variant of Concern (VOC) because of the presence of multiple mutations in the S protein (including K417T, E484K, N501Y), while lineage P.2 only harbors mutation S:E484K and is considered a Variant of Interest (VOI). Here we report the identification of a new SARS-CoV-2 VOI within lineage B.1.1.33 that also harbors mutation S:E484K and was detected in Brazil between November 2020 and February 2021. This VOI displayed four non-synonymous lineage-defining mutations (NSP3:A1711V, NSP6:F36L, S:E484K, and NS7b:E33A) and was designated as lineage N.9. The VOI N.9 probably emerged in August 2020 and has spread across different Brazilian states from the Southeast, South, North and Northeast regions. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Maranhão. São Luís, MA, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Enfermidades Infecciosas Transmitidas por Vetores. Salvador, BA, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Enfermidades Infecciosas Transmitidas por Vetores. Salvador, BA, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Patologia e Biologia Molecular. Salvador, BA, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal da Paraíba. João Pessoa, PB, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Paraiba. João Pessoa, PB, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Espírito Santo. Vitória, ES, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Alagoas. Maceió, AL, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Sergipe. Aracajú, SE, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio Grande do Sul. Porto Alegre, RS, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Santa Catarina. Florianópolis, SC, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Ceará. Eusébio, CE, Brasil. | |
| Affilliation | Instituto Adolfo Lutz. São Paulo, SP, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Espírito Santo. Centro de Ciências Exatas, Naturais e da Saúde. Departamento de Biologia. Alegre, ES, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratório e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Subject | SARS-CoV-2 | en_US |
| Subject | Betacoronavirus | en_US |
| Subject | Epidemics | en_US |
| Subject | Mutation | en_US |
| Subject | Brazil | en_US |
| Peer reviewed | Não | |
| Publication status | Publicado | |
| xmlui.metadata.dc.subject.ods | 03 Saúde e Bem-Estar | |
