| Author | Giovanetti, Marta | |
| Author | Pinotti, Francesco | |
| Author | Zanluca, Camila | |
| Author | Fonseca, Vagner | |
| Author | Nakase, Taishi | |
| Author | Koishi, Andrea Cristine | |
| Author | Tscha, Marcel | |
| Author | Soares, Guilherme | |
| Author | Dorl, Gisiane Gruber | |
| Author | Marques, Antônio Ernesto M. L. | |
| Author | Sousa, Renato | |
| Author | Adelino, Talita Emile Ribeiro | |
| Author | Xavier, Joilson | |
| Author | Oliveira, Carla de | |
| Author | Patroca, Sandro | |
| Author | Guimaraes, Natalia Rocha | |
| Author | Fritsch, Hegger | |
| Author | Mares-Guia, Maria Angélica | |
| Author | Levy, Flavia | |
| Author | Passos, Pedro Henrique | |
| Author | Silva, Vinicius Leme da | |
| Author | Pereira, Luiz Augusto | |
| Author | Mendonça, Ana Flávia | |
| Author | Macêdo, Isabel Luana de | |
| Author | Sousa, Davi Emanuel Ribeiro de | |
| Author | Costa, Gabriela Rodrigues de Toledo | |
| Author | Castro, Marcio Botelho de | |
| Author | Andrade, Miguel de Souza | |
| Author | Abreu, Filipe Vieira Santos de | |
| Author | Campos, Fabrício Souza | |
| Author | Iani, Felipe Campos de Melo | |
| Author | Pereira, Maira Alves | |
| Author | Cavalcante, Karina Ribeiro Leite Jardim | |
| Author | Freitas, Andre Ricardo Ribas de | |
| Author | Albuquerque, Carlos Frederico Campelo de | |
| Author | Macário, Eduardo Marques | |
| Author | Anjos, Marlei Pickler Debiasi dos | |
| Author | Ramos, Rosane Campanher | |
| Author | Campos, Aline Alves Scarpellini | |
| Author | Pinter, Adriano | |
| Author | Chame, Marcia | |
| Author | Abdalla, Livia | |
| Author | Riediger, Irina Nastassja | |
| Author | Ribeiro, Sérvio Pontes | |
| Author | Bento, Ana I. | |
| Author | Oliveira, Tulio de | |
| Author | Freitas, Carla | |
| Author | Moura, Noely Fabiana Oliveira de | |
| Author | Fabri, Allison | |
| Author | Rodrigues, Cintia Damasceno dos Santos | |
| Author | Santos, Carolina Cardoso dos | |
| Author | Almeida, Marco Antonio Barreto de | |
| Author | Santos, Edmilson dos | |
| Author | Cardoso, Jader | |
| Author | Augusto, Douglas Adriano | |
| Author | Krempser, Eduardo | |
| Author | Mucci, Luís Filipe | |
| Author | Gatti, Renata Rispoli | |
| Author | Cardoso, Sabrina Fernandes | |
| Author | Fuck, João Augusto Brancher | |
| Author | Lopes, Maria Goretti David | |
| Author | Belmonte, Ivana Lucia | |
| Author | Silva, Gabriela Mayoral Pedroso da | |
| Author | Soares, Maiane Regina Ferreira | |
| Author | Castilhos, Marilia de Melo Santos de | |
| Author | Silva, Joseana Cardoso de Souza e | |
| Author | Bisetto Junior, Alceu | |
| Author | Pouzato, Emanuelle Gemin | |
| Author | Tanabe, Laurina Setsuko | |
| Author | Arita, Daniele Akemi | |
| Author | Matsuo, Ricardo | |
| Author | Raymundo, Josiane dos Santos | |
| Author | Silva, Paula Cristina Linder | |
| Author | Silva, Ana Santana Araújo Ferreira | |
| Author | Samila, Sandra | |
| Author | Carvalho, Glauco | |
| Author | Stabeli, Rodrigo | |
| Author | Navegantes, Wildo | |
| Author | Moreira, Luciano Andrade | |
| Author | Ferreira, Alvaro Gil A. | |
| Author | Pinheiro, Guilherme Garcia | |
| Author | Nunes, Bruno Tardelli Diniz | |
| Author | Medeiros, Daniele Barbosa de Almeida | |
| Author | Cruz, Ana Cecília Ribeiro | |
| Author | Cunha, Rivaldo Venâncio da | |
| Author | Voorhis, Wes Van | |
| Author | Filippis, Ana Maria Bispo de | |
| Author | Almiron, Maria | |
| Author | Holmes, Edward C. | |
| Author | Ramos, Daniel Garkauskas | |
| Author | Romano, Alessandro | |
| Author | Lourenço, José | |
| Author | Alcantara, Luiz Carlos Junior | |
| Author | Santos, Claudia Nunes Duarte dos | |
| Access date | 2023-10-17T16:05:40Z | |
| Available date | 2023-10-17T16:05:40Z | |
| Document date | 2023 | |
| Citation | GIOVANETTI, Marta et al. Genomic epidemiology unveils the dynamics and spatial corridor behind the Yellow Fever virus outbreak in Southern Brazil. Science Advances, v. 9, n. 35, p. 1-12, Sep. 2023. | en_US |
| ISSN | 2375-2548 | en_US |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60822 | |
| Sponsorship | This work was supported in part through National Institutes of Health USA grant U01 AI151698 for the United World Arbovirus Research Network (UWARN) and the Brazilian Ministry of Health (SCON2021-00180). MG is funded by PON “Ricerca e Innovazione” 2014-2020. J.L. is funded by BioISI (Biosystems and Integrative Sciences Institute), Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa (UIDP/4046/2020). F.P. is funded by the One Health Poultry Hub, a Global Challenges Research Fund (GCRF), and United Kingdom Research and Innovation (UKRI) initiative. E.C.H. is funded by an Australian Research Council Australian Laureate Fellowship (FL170100022). C.N.D.S. was funded by CNPq (307176-2018-5). The authors additionally thank Fiocruz/CVSLR for the logistic support. | |
| Language | eng | en_US |
| Publisher | American Association for the Advancement of Science | en_US |
| Rights | open access | |
| Title | Genomic epidemiology unveils the dynamics and spatial corridor behind the Yellow Fever virus outbreak in Southern Brazil | en_US |
| Type | Article | |
| DOI | 10.1126/sciadv.adg9204 | |
| Abstract | Despite the considerable morbidity and mortality of yellow fever virus (YFV) infections in Brazil, our understanding of disease outbreaks is hampered by limited viral genomic data. Here, through a combination of phylogenetic and epidemiological models, we reconstructed the recent transmission history of YFV within different epidemic seasons in Brazil. A suitability index based on the highly domesticated Aedes aegypti was able to capture the seasonality of reported human infections. Spatial modeling revealed spatial hotspots with both past reporting and low vaccination coverage, which coincided with many of the largest urban centers in the Southeast. Phylodynamic analysis unraveled the circulation of three distinct lineages and provided proof of the directionality of a known spatial corridor that connects the endemic North with the extra-Amazonian basin. This study illustrates that genomics linked with eco-epidemiology can provide new insights into the landscape of YFV transmission, augmenting traditional approaches to infectious disease surveillance and control. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavívirus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil / Department of Science and Technology for Humans and the Environment. Università of Campus Bio-Medico di Roma. Italy. | en_US |
| Affilliation | Department of Zoology. University of Oxford. Oxford, UK. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde. Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Nuffield Department of Medicine. University of Oxford. Oxford, United Kingdom. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade Federal do Paraná. Hospital Veterinário. Laboratório de Patologia Veterinária. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavívirus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Instituto Evandro Chagas. Pará, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Universidade Federal de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavívirus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavívirus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral das Arboviroses. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública Dr Giovanni Cysneiros. Goiânia, Goiás, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública Dr Giovanni Cysneiros. Goiânia, Goiás, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública Dr Giovanni Cysneiros. Goiânia, Goiás, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade de Brasília. Campus Darcy Ribeiro. Laboratório de Patologia Veterinária. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade de Brasília. Campus Darcy Ribeiro. Laboratório de Patologia Veterinária. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria do Estado de Governo do Distrito Federal. Diretoria de Vigilância Ambiental em Saúde. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade de Brasília. Campus Darcy Ribeiro. Laboratório de Patologia Veterinária. Brasília, DF, Brasil / Universidade de Brasília. Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária. Programa de Pós-Graduação em Ciências Animais. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade de Brasília. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Biologia Celular. Laboratório Baculovírus. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Instituto Federal do Norte de Minas Gerais. Laboratório de Comportamento de Insetos. Montes Claros, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade Federal do Rio Grande do Sul. Instituto de Ciências Básicas da Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral das Arboviroses. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Faculdade de Medicina São Leopoldo Mandic. Campinas, SP, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde. Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde de Santa Catarina. Superintendência de Vigilância em Saúde. Florianópolis, SC, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde de Santa Catarina. Superintendência de Vigilância em Saúde. Laboratório central de Saude Publica de Santa Catarina. Florianópolis, SC, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria Estadual da Saúde do Rio Grande do Sul. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio Grande do Sul. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Departamento de Medicina Veterinária Preventiva e Saúde Animal. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Plataforma Institucional Biodiversidade e Saúde Silvestre, Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Plataforma Institucional Biodiversidade e Saúde Silvestre, Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Laboratório de Saúde Pública do Estado do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade Federal de Ouro Preto. Laboratório de Ecologia do Adoecimento & Florestas. Ouro Preto, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Pandemic Prevention Initiative. The Rockefeller Foundation. Washington DC, USA. | en_US |
| Affilliation | School of Data Science and Computational Thinking. Faculty of Science and Faculty of Medicine and Health Sciences. Stellenbosch University. Stellenbosch, South Africa. | en_US |
| Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Brasília. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavívirus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavívirus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavívirus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria Estadual de Saúde do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Porto Alegre, RS, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Plataforma Institucional Biodiversidade e Saúde Silvestre. Centro de Informação em Saúde Silvestre. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Plataforma Institucional Biodiversidade e Saúde Silvestre. Centro de Informação em Saúde Silvestre. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado de Saúde de São Paulo. São Paulo, SP, Brasil / Secretaria de Estado de Saúde de São Paulo. Coordenadoria de Controle de Doenças. São Paulo, SP, Brasil / Instituto Pasteur. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde de Santa Catarina. Florianópolis, SC, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde de Santa Catarina. Florianópolis, SC, Brasil / Universidade Federal de Santa Catarina. Departamento de Biologia Celular, Embriologia e Genética. Florianópolis, SC, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde de Santa Catarina. Diretoria de Vigilância Epidemiológica. Florianópolis, SC, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Secretaria de Estado da Saúde do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde. Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde. Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Grupo Mosquitos Vetores: Endossimbiontes e Interação Patógeno-Vetor. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Grupo Mosquitos Vetores: Endossimbiontes e Interação Patógeno-Vetor. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Instituto Evandro Chagas. Belém, PA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Instituto Evandro Chagas. Belém, PA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Instituto Evandro Chagas. Belém, PA, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos (Bio-Manguinhos). Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases. University of Washington. Seattle, WA, USA. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavívirus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Pan American Health Organization. World Health Organization. Washington, DC, USA. | en_US |
| Affilliation | University of Sydney. School of Life and Environmental Sciences and School of Medical Sciences. Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity. Sydney, NSW, Australia. | en_US |
| Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral das Arboviroses. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral das Arboviroses. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Universidade de Lisboa. Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas. Lisboa, PT, Portugal. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavívirus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
| Affilliation | Department of Science and Technology for Humans and the Environment. Università of Campus Bio-Medico di Roma. Italy. | en_US |
| Subject | Yellow Fever | en_US |
| Subject | Yellow fever virus | en_US |
| Subject | Vaccination Coverage | en_US |
| Subject | Communicable Disease Control | en_US |
| Subject | Molecular Epidemiology | en_US |
| Subject in Spanish | Fiebre Amarilla | en_US |
| Subject in Spanish | Virus de la Fiebre Amarilla | en_US |
| Subject in Spanish | Cobertura de Vacunación | en_US |
| Subject in Spanish | Control de Enfermedades Transmisibles | en_US |
| Subject in Spanish | Epidemiología Molecular | en_US |
| Subject in French | Fièvre jaune | en_US |
| Subject in French | Virus de la fièvre jaune | en_US |
| Subject in French | Couverture vaccinale | en_US |
| Subject in French | Contrôle des maladies transmissibles | en_US |
| Subject in French | Épidémiologie moléculaire | en_US |
| Subject in French | Brésil | en_US |
| DeCS | Febre Amarela | en_US |
| DeCS | Vírus da Febre Amarela | en_US |
| DeCS | Cobertura Vacinal | en_US |
| DeCS | Controle de Doenças Transmissíveis | en_US |
| DeCS | Epidemiologia Molecular | en_US |
| e-ISSN | 2375-2548 | |
| xmlui.metadata.dc.subject.ods | 03 Saúde e Bem-Estar | |
