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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/65912
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DissertationCopyright
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2025-05-06
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AVALIAÇÃO DE POLIMORFISMOS DE ÚNICO NUCLEOTÍDEO E EXPRESSÃO DO GENE SOCS5 EM PACIENTES COM CARCINOMA HEPATOCELULAR (CHC)
Expressão Gênica
Regulação Neoplásica da Expressão Gênica
Fatores genéticos
Proteínas Supressoras da Sinalização de Citocina
Polimorfismo de Nucleotídeo Único
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
Biomarcadores Tumorais
Leucócitos Mononucleares
Neoplasias Hepáticas
Cirrose Hepática
Técnicas de Genotipagem
Técnicas de Genotipagem
Diagnóstico Precoce
Análise Multivariada
Modelos Logísticos
Estudos transversais
Estudos de Casos e Controles
Expressão Gênica
Regulação Neoplásica da Expressão Gênica
Fatores genéticos
Proteínas Supressoras da Sinalização de Citocina
Polimorfismo de Nucleotídeo Único
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
metodos
Biomarcadores Tumorais
Perfil de Saúde
Neoplasias Hepáticas
Cirrose Hepática
Técnicas de Genotipagem
Diagnóstico Precoce
Taxa de Sobrevida
Análise Multivariada
Modelos Logísticos
Estudos transversais
Estudos de Casos e Controles
Acioli, Maria Eduarda Azevêdo. | Date Issued:
2024
Co-advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Abstract in Portuguese
O Carcinoma Hepatocelular (CHC) é a forma mais comum de câncer primário do fígado, caracterizado por um diagnóstico geralmente tardio. Assim, estudos que identifiquem biomarcadores que auxiliem no diagnóstico precoce de tumores são necessários, como os que destacam a relação do gene SOCS5 na tumorigênese do CHC. Desse modo, o objetivo do estudo foi avaliar os polimorfismos de único nucleotídeo e expressão gênica do gene SOCS5 em pacientes com Carcinoma Hepatocelular (CHC). Este estudo transversal foi realizado com a comparação dos grupos CHC e cirrótico, ambos com diagnóstico confirmado. O DNA analisado foi extraído de amostras de sangue periférico, já o RNA total foi extraído a partir de células mononucleares do sangue periférico (PBMC), sendo o material genético submetido às metodologias de RT-PCR, sequenciamento de Sanger e qPCR para análise de polimorfismos presentes no gene e diferenças da expressão gênica relativa, respectivamente. Para as análises do sequenciamento foram utilizadas as ferramentas BioEdit e Geneious, foram executados ensaios de genotipagem e expressão gênica, sendo realizadas análises de correlação, sobrevida e regressão logística, admitindo para todas análises o nível de significância fixado em p≤ 0,05. Foram encontrados quatro polimorfismos na região gênica do SOCS5, com destaque para o rs6738426, que se apresentou de forma semelhantes entre os grupos analisados. Em relação à expressão do gene, foi observado que pacientes cirróticos com classificação Child-Pugh A apresentaram maiores níveis de SOCS5, indicando que, possivelmente nesse grupo, o gene apresenta um papel supressor de tumor, provavelmente por meio do feedback negativo das vias JAK/STAT. Já nos pacientes com CHC, foi verificada uma menor sobrevida naqueles com níveis elevados de expressão de SOCS5, indicando um papel tumorigênico, provavelmente devido ao feedback positivo da via PI3K/Akt/mTOR. Na análise multivariada, a susceptibilidade ao CHC foi associada à idade [p= 0,003 OR 0,924 IC (0,877-0,9740)] e aos níveis de HDL [(p= 0,043 OR 1,032 IC (1,001 – 1,065)], sendo o aumento da idade e a diminuição do HDL considerados fatores de risco. Deste modo, propõe-se que o gene SOCS5 pode desempenhar um importante papel no processo tumorigênico, podendo atuar de forma oncogênica ou antitumorigênica. No entanto, estudos com coorte maior de amostras são indicados para validar os resultados aqui encontrados, assim como a análise do impacto do SOCS5 dentro das vias JAK/STAT e PI3K/Akt/ mTOR, por meio de ensaios de silenciamento e superexpressão do gene.
Abstract
Hepatocellular Carcinoma (HCC) is the most common type of primary liver cancer, characterized by a typically late diagnosis. Therefore, studies identifying biomarkers that may help in early diagnosis of tumors are necessary, such as those highlighting the relationship of the SOCS5 gene in HCC tumorigenesis. Thus, the aim of the study was to evaluate single nucleotide polymorphisms and gene expression of the SOCS5 gene in patients with HCC. This cross-sectional study was conducted by comparing HCC and cirrhotic groups, both with confirmed diagnoses. The analyzed DNA was extracted from peripheral blood samples, while total RNA was extracted from peripheral blood mononuclear cells (PBMC), and the genetic material was subjected to RT-PCR, Sanger sequencing, and qPCR methodologies for the analysis of gene polymorphisms and relative gene expression differences, respectively. For sequencing analyses, the BioEdit and Geneious tools were used, genotyping and gene expression assays were performed, and correlation, survival and logistic regression analyzes were carried out, allowing for all analyzes the level of significance set at p≤ 0.05. Four polymorphisms were found in the SOCS5 gene region, with emphasis on rs6738426, which showed similar occurrences between the analyzed groups. Regarding gene expression, it was observed that cirrhotic patients with Child-Pugh A classification exhibited higher levels of SOCS5, indicating that in this group, the gene may play a tumor-suppressive role, possibly through negative feedback of the JAK/STAT pathways. In HCC patients, a lower survival rate was observed in those with elevated levels of SOCS5 expression, suggesting a tumorigenic role, likely due to positive feedback from the PI3K/Akt/mTOR pathway. In multivariate analysis, susceptibility to HCC was associated with age [p= 0.003, OR 0.924, CI (0.877-0.9740)] and HDL levels [p= 0.043, OR 1.032, CI (1.001 – 1.065)], with increased age and decreased HDL considered risk factors. Thus, it is proposed that the SOCS5 gene may play a significant role in the tumorigenic process, potentially acting in an oncogenic or antitumorigenic manner. However, larger cohort studies are recommended to validate the results found here, as well as the analysis of the impact of SOCS5 within the JAK/STAT and PI3K/Akt/mTOR pathways through gene silencing and overexpression assays.
Keywords in Portuguese
Carcinoma HepatocelularExpressão Gênica
Regulação Neoplásica da Expressão Gênica
Fatores genéticos
Proteínas Supressoras da Sinalização de Citocina
Polimorfismo de Nucleotídeo Único
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
Biomarcadores Tumorais
Leucócitos Mononucleares
Neoplasias Hepáticas
Cirrose Hepática
Técnicas de Genotipagem
Técnicas de Genotipagem
Diagnóstico Precoce
Análise Multivariada
Modelos Logísticos
Estudos transversais
Estudos de Casos e Controles
DeCS
Carcinoma HepatocelularExpressão Gênica
Regulação Neoplásica da Expressão Gênica
Fatores genéticos
Proteínas Supressoras da Sinalização de Citocina
Polimorfismo de Nucleotídeo Único
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa
metodos
Biomarcadores Tumorais
Perfil de Saúde
Neoplasias Hepáticas
Cirrose Hepática
Técnicas de Genotipagem
Diagnóstico Precoce
Taxa de Sobrevida
Análise Multivariada
Modelos Logísticos
Estudos transversais
Estudos de Casos e Controles
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