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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/70244
ANÁLISE DE EXOMA EM CRIANÇAS COM SÍNDROME INFLAMATÓRIA MULTISSISTÊMICA PEDIÁTRICA (SIM-P) ASSOCIADA À COVID19
Souza, Roberta dos Santos | Date Issued:
2022
Author
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Abstract in Portuguese
A Síndrome Inflamatória Multissistêmica Pediátrica (SIM-P) é uma síndrome rara que ocorre geralmente após a infecção por SARS-CoV-2 e manifesta-se como uma resposta inflamatória grave e descontrolada que afeta múltiplos órgãos. Os mecanismos subjacentes à síndrome ainda não estão estabelecidos, neste estudo, buscamos encontrar variantes genéticas raras que pudessem ser indicados como fatores predisponentes a esta síndrome, para isto, coletamos 21 amostras de sangue e swab nasal de pacientes com diagóstico confirmado para SARS-CoV-2 que foram identificados com SIM-P e encaminhados hospitais de referência para o tratamento da Covid19 em Pernambuco (N=11) e na Bahia (N=10), as amostras passaram pela extração do DNA genômico e foram encaminhadas para o sequenciamento total do exoma para a identificação e das variantes que foram prioritizadas através e análises in sílico. A nossa análise revelou uma população marjoritariamente masculina (62%) com a prevalência de pacientes da cor parda (67%)(AU). Os parâmetros laboratoriais PCR, D-DIM e ferritina encontraram-se elevados. As análises in sílico, identificaram variantes nas seguintes vias do sistema imune: sistema imune inato (TLR10 (rs149212123), SLC44A2 (rs142741358), BPIFB2 (rs149889663), ATP6V0A4 (rs150777839), C6 (rs142896559), C9 (rs34882957), LTF (rs144149027), PELI3 (rs145732233), RNASET2 (rs41269593), CLEC10A (rs78714016)); via alternativa do sistema complemento (C6 (rs142896559), C9 (rs34882957)); via clássica do sistema complemento (C6 (rs142896559), C9 (rs34882957)); via da lectina do sistema complemento (C6 (rs142896559), C9 (rs34882957)); e via terminal do sistema complemento (C6 (rs142896559), C9 (rs34882957)). Nossos resultados evidenciam o papel do sistema imune inato na SIM-P, com destaque para o sistema complemento, sugerindo que a presença destas variantes afete o funcionamento desse sistema, levando a um processo hiperinflamatório após a infecção pelo SARS-Cov-2. No entanto, são necessários mais estudos sobre este tópico para esclarecer os efeitos funcionais destas moléculas sobre a SIM-P(AU).
Abstract
Pediatric Multisystemic Inflammatory Syndrome (MIS-C) is a rare syndrome that usually occurs after SARS-CoV-2 infection and manifests as a severe, uncontrolled inflammatory response affecting multiple organs. The mechanisms underlying the syndrome are not yet established, in this study, we sought to find rare genetic variants that could be indicated as predisposing factors for this syndrome. We collected 21 blood and nasal swab samples from patients with confirmed diagnosis for SARS-CoV2 who were identified with SIM-P and referred to Covid19 reference hospitals in Pernambuco (N=11) and Bahia (N=10). Our analysis revealed a predominantly male population (62%) with a prevalence of brown patients (67%). . Laboratory parameters PCR, D-DIM and ferritin were elevated. In silico analyses identified variants in the following pathways of the immune system: innate immune system (TLR10 (rs149212123), SLC44A2 (rs142741358), BPIFB2 (rs149889663), ATP6V0A4 (rs150777839), C6 (rs142896559), C9 (rs34882957), LTF (rs144149027), PELI3 (rs145732233), RNASET2 (rs41269593), CLEC10A (rs78714016)); alternative pathway of the complement system (C6 (rs142896559), C9 (rs34882957)); classical pathway of the complement system (C6 (rs142896559), C9 (rs34882957)); lectin pathway of the complement system (C6 (rs142896559), C9 (rs34882957)); and terminal pathway of the complement system (C6 (rs142896559), C9 (rs34882957)). Our results highlight the role of the innate immune system in SIM-P, with emphasis on the complement system, suggesting that the presence of these variants affects the function of this system, leading to a hyperinflammatory process after SARS-Cov-2 infection. However, further studies on this topic are needed to clarify the functional effects of these molecules on SIM-P.
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