| Author | Naveca, Felipe Gomes | |
| Author | Almeida, Tatiana Amaral Pires de | |
| Author | Souza, Victor Costa de | |
| Author | Nascimento, Valdinete Alves do | |
| Author | Silva, Dejanane Silva e | |
| Author | Nascimento, Fernanda Oliveira do | |
| Author | Contreras Mejía, Matilde Del Carmen | |
| Author | Oliveira, Yasmin Silva de | |
| Author | Rocha, Luisa | |
| Author | Xavier, Natana Ferreira de Oliveira | |
| Author | Lopes, Janis | |
| Author | Maito, Rodrigo Melo | |
| Author | Meneses, Cátia Alexandra Ribeiro | |
| Author | Ramos, Tatyana Costa Amorim | |
| Author | Gonçalves, Luciana Mara Fé | |
| Author | Camelo, Fernanda Sindeaux | |
| Author | Silva, Samyly Coutinho de Aguiar | |
| Author | Melo, Alexsandro Xavier de | |
| Author | Fernandes, Leíse Gomes | |
| Author | Oliveira, Marco Aurélio Almeida de | |
| Author | Arcanjo, Ana Ruth Lima | |
| Author | Araújo, Guilherme Alfredo Novelino | |
| Author | André Júnior, Walter | |
| Author | Carvalho, Renata Lia Coragem de | |
| Author | Rodrigues, Rosiane | |
| Author | Albuquerque, Stella | |
| Author | Mattos, Cristiane | |
| Author | Silva, Ciciléia | |
| Author | Linhares, Aline | |
| Author | Rodrigues, Taynã | |
| Author | Mariscal, Francy Anny Ribeiro Montero | |
| Author | Morais, Márcia Andréa | |
| Author | Presibella, Mayra Marinho | |
| Author | Marques, Nelson Fernando Quallio | |
| Author | Paiva, Anne | |
| Author | Ribeiro, Karina | |
| Author | Dallacqua, Deusilene Souza Vieira | |
| Author | Queiroz, Jackson Alves da Silva | |
| Author | Silva, Ana Maísa Passos da | |
| Author | Abdalla, Lígia Fernandes | |
| Author | Santos, João Hugo Abdalla | |
| Author | Figueiredo, Regina Maria Pinto de | |
| Author | Cruz, Ana Cecília Ribeiro | |
| Author | Casseb, Livia Medeiros Neves | |
| Author | Chiang, Jannifer Oliveira | |
| Author | Frutuoso, Livia Carla Vinhal | |
| Author | Rossi, Ágata Pereira | |
| Author | Freitas, Lucas Araujo | |
| Author | Campos, Túlio de Lima | |
| Author | Wallau, Gabriel da Luz | |
| Author | Moreira, Emerson | |
| Author | Lins Neto, Roberto Dias | |
| Author | Alexander, Laura W. | |
| Author | Sun, Yining | |
| Author | Filippis, Ana Maria Bispo de | |
| Author | Gräf, Tiago | |
| Author | Gomes, Ighor Leonardo Arantes | |
| Author | Bento, Ana I. | |
| Author | Delatorre, Edson Oliveira | |
| Author | Bello Bentancor, Gonzalo José | |
| Access date | 2024-09-25T14:24:03Z | |
| Available date | 2024-09-25T14:24:03Z | |
| Document date | 2024 | |
| Citation | NAVECA, Felipe Gomes et al. Human outbreaks of a novel reassortant Oropouche virus in the brazilian Amazon region. Nature Medicine, p. 1-52, 18 Sept. 2024. | |
| ISSN | 1078-8956 | |
| URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/66090 | |
| Description | Produção científica do Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. | pt_BR |
| Language | eng | en_US |
| Publisher | Nature Research | |
| Rights | restricted access | |
| Subject in Portuguese | Epidemiologia viral | pt_BR |
| Subject in Portuguese | Infecção viral | pt_BR |
| Title | Human outbreaks of a novel reassortant Oropouche virus in the brazilian Amazon region | en_US |
| Type | Preprint | |
| DOI | 10.1038/s41591-024-03300-3 | |
| Abstract | The Brazilian western Amazon is experiencing its largest laboratory-confirmed Oropouche virus (OROV) outbreak, with more than 6,300 reported cases between 2022 and 2024. Here, we sequenced and analyzed 382 OROV genomes from human samples collected in Amazonas, Acre, Rondônia, and Roraima states, between August 2022 and February 2024, to uncover the origin and genetic evolution of OROV in the current outbreak. Genomic analyses revealed that the upsurge of OROV cases in the Brazilian Amazon coincides with spread of a novel reassortant lineage containing the M segment of viruses detected in the eastern Amazon region (2009-2018) and the L and S segments of viruses detected in Peru, Colombia, and Ecuador (2008-2021). The novel reassortant likely emerged in the Amazonas state between 2010 and 2014 and spread through long-range dispersion events during the second half of the 2010s. Phylodynamics reconstructions showed that the current OROV spread was mainly driven by short-range (< 2 km) movements consistent with the flight range of vectors. Nevertheless, a substantial proportion (22%) of long-range (> 10 km) OROV migrations were also detected, consistent with viral dispersion by humans. Our data provides a view of the unprecedented spread and evolution of OROV in Brazilian western Amazon region. | en_US |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Núcleo de Vigilância de Vírus Emergentes, Reemergentes ou Negligenciados. Manaus, AM, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Núcleo de Vigilância de Vírus Emergentes, Reemergentes ou Negligenciados. Manaus, AM, Brasil / Governo do Estado Amazonas. Fundação Centro de Controle de Oncologia do Estado do Amazonas. Diretoria de Ensino e Pesquisa. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Núcleo de Vigilância de Vírus Emergentes, Reemergentes ou Negligenciados. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Núcleo de Vigilância de Vírus Emergentes, Reemergentes ou Negligenciados. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Núcleo de Vigilância de Vírus Emergentes, Reemergentes ou Negligenciados. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Núcleo de Vigilância de Vírus Emergentes, Reemergentes ou Negligenciados. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Núcleo de Vigilância de Vírus Emergentes, Reemergentes ou Negligenciados. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Núcleo de Vigilância de Vírus Emergentes, Reemergentes ou Negligenciados. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Roraima. Boa Vista, RR, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Roraima. Boa Vista, RR, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Roraima. Boa Vista, RR, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Roraima. Boa Vista, RR, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Roraima. Boa Vista, RR, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas - Dra. Rosemary Costa Pinto. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas - Dra. Rosemary Costa Pinto. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas - Dra. Rosemary Costa Pinto. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas - Dra. Rosemary Costa Pinto. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas - Dra. Rosemary Costa Pinto. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas - Dra. Rosemary Costa Pinto. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Rondônia. Porto Velho, RO, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Acre. Rio Branco, AC, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Acre. Rio Branco, AC, Brasil. | |
| Affilliation | Governo do Acre. Secretaria de Estado da Saúde. Núcleo de Doenças de Transmissão Vetorial. Rio Branco, AC, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | |
| Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | |
| Affilliation | Ministério da Saúde. Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil. | |
| Affilliation | Ministério da Saúde. Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Rondônia. Laboratório de Virologia Molecular. Porto Velho, RO, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade do Estado do Amazonas. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Amazonas. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação de Medicina Tropical Dr. Heitor Vieira Dourado. Gerência de Virologia. Manaus, AM, Brasil. | |
| Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Seção de Arbovirologia e Febres Hemorrágicas. Ananindeua, PA, Brasil. | |
| Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Seção de Arbovirologia e Febres Hemorrágicas. Ananindeua, PA, Brasil. | |
| Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Seção de Arbovirologia e Febres Hemorrágicas. Ananindeua, PA, Brasil. | |
| Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde e Ambiente. Departamento de Doenças Transmissíveis. Coordenação-Geral de Vigilância de Arboviroses. Brasília, DF, Brasil. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Espírito Santo. Centro de Ciências da Saúde. Departamento de Patologia. Laboratório de Genômica e Ecologia Viral. Vitória, ES, Brasil. | |
| Affilliation | Global Data Science Initiative. Munich, Germany. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil / National Reference Center for Tropical Infectious Diseases. WHO Collaborating Center for Arbovirus and Hemorrhagic Fever Reference and Research. Bernhard Nocht Institute for Tropical Medicine. Department of Arbovirology. Bernhard-Nocht-Straße, Hamburg, Germany. | |
| Affilliation | Universidade Federal de Pernambuco. Recife, PE, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil. | |
| Affilliation | University of California. Department of Integrative Biology. Berkeley, CA, USA. | |
| Affilliation | Cornell University. College of Veterinary Medicine. Department of Public and Ecosystem Health. Ithaca, NY, USA. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Laboratório de Virologia Molecular. Curitiba, PR, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Affilliation | Cornell University. College of Veterinary Medicine. Department of Public and Ecosystem Health. Ithaca, NY, USA. | |
| Affilliation | Universidade Federal do Espírito Santo. Centro de Ciências da Saúde. Departamento de Patologia. Laboratório de Genômica e Ecologia Viral. Vitória, ES, Brasil. | |
| Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Arbovírus e Vírus Hemorrágicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | |
| Subject | Viral epidemiology | en_US |
| Subject | Viral infection | en_US |
| e-ISSN | 1546-170X | |
| Peer reviewed | Sim | |
| Publication status | Não Publicado | |
