Browsing Programa de Pós-Graduação em Biologia Computacional e Sistemas (PGBCS) by Title
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LASZLO @ GALAXY - Um protótipo de serviço de montagem de genomas a partir de dados de sequenciamento de próxima geração (NGS)
| Date Issued: 2012As tecnologias NGS (Next-Generation Sequencing), desenvolvidas para reduzir o custo e o tempo do processo de sequenciamento, geram uma grande massa de dados, a um custo relativamente baixo e com grande acurácia. No entanto, ... -
Melhoramento de docking-based virtual screening usando abordagem de deep learning
| Date Issued: 2017Funções de pontuação são um dos grandes problemas na metodologia de Docking- Based Virtual Screening - DBVS, pois elas não são capazes de classificar de forma confiável ligantes docados. Nesse trabalho propomos um novo ... -
Metagenômica na investigação de agentes infecciosos em amostras clínicas humanas
| Date Issued: 2016O vírus dengue infecta um número estimado de 50-100 milhões de pessoas 100 milhões de pessoas anualmente em todo o mundo e no Brasil, dengue foi relatada pela primeira vez em 1981, desde então, a infecção tornou-se ... -
Metodologia de desenvolvimento de data marts para apoio à decisão baseado no uso de ontologias e estudo de caso para a priorização de alvos de fármacos em tripanossomatídeos
| Date Issued: 2018A anotação de texto semântico permite a associação de conceitos presentes em uma ontologia a expressões textuais (termos), que são legíveis por agentes de software. No cenário científico, isso é particularmente útil, porque ... -
Mineração de dados metagenômicos visando a análise da diversidade de serina Beta-Lactamases em diferentes ambientes
| Date Issued: 2013O uso inadequado de antibióticos tem causado um grande impacto na saúde pública devido à seleção e aumento de bactérias patogênicas multirresistentes e de difícil tratamento. Dentre os antibióticos administrados na área ... -
Mineração de textos científicos visando à identificação de componentes bioativos com potencial terapêutico para o tratamento de dengue, malária e doença de Chagas
| Date Issued: 2013As doenças negligenciadas, como a dengue, malária e doença de Chagas, entre outras, que prevalecem em países menos desenvolvidos e em ambientes cercados por condições de pobreza, afetam um sexto da população mundial, matando ... -
Mineração in silico de enzimas análogas essenciais nos genomas de patógenos bacterianos e fúngicos de Glycine max, Zea mays e Solanum lycopersicum
| Date Issued: 2018Os últimos vinte anos foram de intenso crescimento na agricultura brasileira, com base na produtividade e expansão das fronteiras agrícolas. Diversas medidas de manejo das lavouras são empregadas, a exemplo da rotativdade ... -
Minerador de eventos adversos maláricos no Twitter O caso da Doxiciclina
| Date Issued: 2016Durante o período de pós-comercialização, quando medicamentos são usados por grandes populações e por períodos de tempo maiores, eventos adversos inesperados podem ocorrer, o que altera a relação risco-benefício dos ... -
Modelagem conceitual do sistema de banco de dados ProteinWorldDB
| Date Issued: 2012Esta tese descreve o projeto conceitual do sistema de banco de dados ProteinWorldDB (PWDB). Um ponto importante da proposta do PWDB é permitir a construção de consultas e procedimentos no domínio da genômica comparativa ... -
Modelagem estatística do fenômeno de troca hidrogênio/deutério em proteínas através de propriedades estruturais e dinâmicas
| Date Issued: 2016O estudo da estrutura e da dinâmica de proteínas é de suma importância para a compreensão dos mecanismos funcionais das mesmas. Dentre os métodos experimentais disponíveis para realizar esse tipo de estudo, está a utilização ... -
Modelagem molecular de inibidores de aspartil proteasepotenciais novos compostos antimalariais
| Date Issued: 2012Uma família de enzimas do tipo aspartil proteases, conhecida como Plasmepsinas, tem sido descrita como alvo atrativo para pesquisa e desenvolvimento de novos compostos terapêuticos para o tratamento da malária. Isto se ... -
Organização e evolução da família gênica carboxilesterase em artrópodes
| Date Issued: 2013A família gênica das carboxilesterases (CCEs) é muito diversa e, em insetos, está dividida em três principais classes. Duas classes, Detoxificantes e Processamento de hormônios e feromônios, contêm genes majoritariamente ... -
Otimização in silico de fragmentos ligados a Tiorredoxina Glutationa Redutase de S. mansoni (SmTGR) para a proposta de novas moléculas com atividade esquistossomicida
| Date Issued: 2021A esquistossomose é uma doença tropical negligenciada parasitária causada por trematódeos do gênero Schistosoma. O tratamento está baseado na quimioterapia com o praziquantel (PZQ), o qual apresenta muito sucesso. Entretanto, ... -
O papel biológico das enzimas iso-funcionais não homólogas em linhagens de Escherichia coli
| Date Issued: 2014Enzimas são proteínas que catalisam reações bioquímicas, funcionando como catalisadores biológicos naturais. Cada enzima tem um nome recomendado e número atribuído por uma comissão especializada, a "Enzyme Comission", um ... -
Planejamento racional de fármacos aplicado à busca e otimização de inibidores do HIV-1 e doença de Chagas
| Date Issued: 2016O sucesso no planejamento de fármacos de novas moléculas bioativas está relacionado com o entendimento do alvo molecular e seu valor para com a doença que deseja ser combatida. Entender as interações importantes serve como ... -
Predição computacional das interações proteína-proteína em espécies do gênero Cryptococcus spp
| Date Issued: 2016A biologia de sistemas procura modelar sistemas complexos, usufruindo de conteúdos interdisciplinares e possibilitando a integração da informação biológica disponível sobre determinado organismo. Nesse contexto, uma das ... -
Proposição de modelos tridimensionais da extensão COOH-terminal da cisteíno-protease B de Leishmania (Leishmania) amazonensis
| Date Issued: 2014A Leishmania (Leishmania) amazonensis é um importante agente etiológico da leishmaniose tegumentar em humanos no Brasil. Este parasito apresenta mecanismos de adaptação que podem ser guiados por suas proteases onde se ... -
Prospecção computacional de alvos para o desenvolvimento de uma vacina contra Leishmania spp
| Date Issued: 2021A vacinação é uma das iniciativas de saúde pública mais bem-sucedidas. Apesar do sucesso, vacinas para muitas doenças ainda não foram desenvolvidas e diversas estratégias foram elaboradas para identificar candidatos vacinais ... -
O que Dados Transcriptômicos Revelam sobre a Biodiversidade e Evolução de Loricarioidei (Siluriformes)
| Date Issued: 2018A biodiversidade é uma entidade multidimensional, que se refere a diferentes elementos e níveis de variabilidade da vida na Terra. As tecnologias de sequenciamento de ácidos nucleicos de alto desempenho, aliadas à biologia ... -
Reconstrução da Rede Metabólica da Pseudomonas aeruginosa CCBH4851
| Date Issued: 2018As altas taxas de mortalidade e morbidade associadas a infecções nosocomiais (adquiridas em ambientes hospitalares) causadas por bactérias multi-resistentes a antibióticos constituem um problema de saúde pública no Brasil. ...