IOC - PGBCS - Teses de Doutorado: Recent submissions
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Identificação in silico de potenciais inibidores da ribose 5-fosfato isomerase de Trypanosoma cruzi
| Date Issued: 2017A doença de Chagas, causada pelo protozoário Trypanosoma cruzi, afeta aproximadamente sete milhões de pessoas, principalmente na América Latina, e causa 7000 mortes ao ano. Os tratamentos disponíveis são insatisfatórios e ... -
O impacto de pequenas deleções genômicas em domínios protéicos identificadas a partir de dados de rna-seq de amostras de pacientes de adenocarcinoma de pulmão
| Date Issued: 2017Inserções e deleções (INDELs) são exemplos de alterações na sequência de DNA. As alterações causadas por deleções genômicas podem modificar nucleotídeos da região codificadora de proteínas com potencial para alterar os ... -
Utilização de RNAs não codificadores pequenos na distinção de amostras humanas de câncer de pulmão e de células do sangue
| Date Issued: 2017Os RNAs não codificadores pequenos, como piRNAs, snoRNAs e miRNAs, atuam em diversas etapas do metabolismo celular, participando de processos como controle da expressão gênica, metilação e pseudouridilação de rRNAs e ... -
Estudo de metaloproteases de Leishmania (Viannia) braziliensis pertencentes ao cromossomo 10 da família M8
| Date Issued: 2017O genoma de Leishmania (Viannia) braziliensis possui um número significante de genes de metaloproteases. Entretanto, não se sabe por que esse parasito apresenta uma grande quantidade de genes em um determinado cromossomo. ... -
Melhoramento de docking-based virtual screening usando abordagem de deep learning
| Date Issued: 2017Funções de pontuação são um dos grandes problemas na metodologia de Docking- Based Virtual Screening - DBVS, pois elas não são capazes de classificar de forma confiável ligantes docados. Nesse trabalho propomos um novo ... -
Caracterização fenotípica e genotípica de Mycobacterium tuberculosis da família Beijing do tipo ancestral e moderno
| Date Issued: 2016A tuberculose ainda é um problema de saúde pública global, principalmente em países em desenvolvimento, onde a doença é negligenciada e associada à pobreza, co-infecção com HIV e resistência aos antibióticos. A infecção é ... -
Análise de variantes de splicing em homem e camundongo por uma abordagem de proteogenômica
| Date Issued: 2016Os avanços obtidos no estudo do transcriptoma pelo uso de sequenciadores de alta vazão e na proteômica por meio da espectrometria de massas, resultaram num grande volume de dados que passou a ser integrado em diversos ... -
Exploração da diversidade genômica, taxonômica e funcional dos gêneros Wolbachia e Klebsiella
| Date Issued: 2016Abordagens filogenômicas, funcionais e taxonômicas in silico têm sido utilizadas na exploração da diversidade de espécies de microrganismos, na solução de relações filogenéticas e evolutivas, utilizando a informação genômica ... -
Planejamento racional de fármacos aplicado à busca e otimização de inibidores do HIV-1 e doença de Chagas
| Date Issued: 2016O sucesso no planejamento de fármacos de novas moléculas bioativas está relacionado com o entendimento do alvo molecular e seu valor para com a doença que deseja ser combatida. Entender as interações importantes serve como ... -
Análise da Dissociação entre as Proteínas H-2 de Classe I e Epítopos da Extensão COOH-Terminal da CPB de Leishmania (L.) amazonensis
| Date Issued: 2015Novas estratégias para controlar a infecção por Leishmania spp demandam um grande conhecimento a respeito de vários aspectos da doença e um entendimento dos eventos que ocorrem em escala molecular durante esta infecção. ... -
Genômica comparativa de protozoários
| Date Issued: 2013Os protozoários são definidos como organismos eucariotos unicelulares, e apresentam grande diversidade e variedade. Cerca de 200 mil espécies são descritas e quase 10.000 são parasitas. As espécies patogênicas causam doenças ... -
Mineração de textos científicos visando à identificação de componentes bioativos com potencial terapêutico para o tratamento de dengue, malária e doença de Chagas
| Date Issued: 2013As doenças negligenciadas, como a dengue, malária e doença de Chagas, entre outras, que prevalecem em países menos desenvolvidos e em ambientes cercados por condições de pobreza, afetam um sexto da população mundial, matando ... -
Identificação in silico de potenciais alvos terapêuticos em protozoários: enzimas isofuncionais não homólogas
| Date Issued: 2014Protozoários são organismos unicelulares que causam várias doenças que atingem tanto humanos como animais. Essas doenças causam ônus econômicos principalmente em regiões tropicais e subtropicais. Atualmente, não existem ... -
Mineração de dados metagenômicos visando a análise da diversidade de serina Beta-Lactamases em diferentes ambientes
| Date Issued: 2013O uso inadequado de antibióticos tem causado um grande impacto na saúde pública devido à seleção e aumento de bactérias patogênicas multirresistentes e de difícil tratamento. Dentre os antibióticos administrados na área ... -
Genômica comparativa em ambiente computacional distribuídoaplicabilidade e potencial no estudo de homologia entre protozoários
| Date Issued: 2015A inferência de homologia entre organismos é uma atividade da genômica comparativa que possibilita compreender melhor a relação entre os mesmos e, por conseguinte, sua distância evolutiva. Especificamente, a identificação ... -
Modelagem conceitual do sistema de banco de dados ProteinWorldDB
| Date Issued: 2012Esta tese descreve o projeto conceitual do sistema de banco de dados ProteinWorldDB (PWDB). Um ponto importante da proposta do PWDB é permitir a construção de consultas e procedimentos no domínio da genômica comparativa ... -
Diversidade de Trypanosoma cruzi TcI e TcII nos biomas brasileiros
| Date Issued: 2014A Tripanossomíase por Trypanosoma cruzi (Kinetoplastida, Trypanosomatidae) é uma antiga zoonose amplamente distribuída do Sul dos Estados Unidos ao Sul da Argentina. O Brasil dispõe de seis biomas ecologicamente distintos: ... -
Especiação em triatomíneosuma abordagem filogenética, biogeográfica e comportamental dos vetores de Chagas Rhodnius prolixus e R. robustus s.l. (Hemiptera: Reduviidae)
| Date Issued: 2013As dificuldades para a interrupção definitiva da transmissão vetorial do Trypanosoma cruzi decorrem primariamente de eventos de reinfestação por populações silvestres de triatomíneos das casas previamente tratadas com ... -
Caracterização da diversidade microbiana da Praia dos Anjos - Arraial do Cabo - RJ através de metagenômica
| Date Issued: 2014Os ambientes marinhos cobrem cerca de 70% da superfície do planeta. Esses habitats apresentam uma grande variabilidade de temperatura, pressão e salinidade, abrigando uma vasta biodiversidade microbiana, pertencentes aos ... -
Determinantes e forças seletivas na evolução das proteínas
| Date Issued: 2014A análise de grandes quantidades de dados aproveitando o poder computacional de ferramentas \2015open source\2016 que estão disponíveis na internet é o que veio a conhecer-se como quarto paradigma da investigação científica. ...