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Title: Aplicabilidade de uma metodologia in-house de diagnóstico e caracterização molecular em uma população de indivíduos com sorologia positiva para HIV no estado do Amapá
Advisor: Betancor, Gonzalo José Bello
Members of the board: Santos, Flávia Barreto dos
Oliveira, Jaqueline Mendes de
Mascarenhas, Joana D’Arc Pereira
Betancor, Gonzalo José Bello
Filippis, Ivano de
Authors: Silva, Lindomar dos Anjos
Coadvisor: Filippis, Ivano de
Affilliation: Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract: A epidemia de HIV-1 no Brasil constitui um fenômeno dinâmico e complexo composto por um mosaico de sub-epidemias regionais com um padrão heterogêneo de prevalência de distintas formas genéticas do vírus assim como de mutações de resistência transmitida aos antirretrovirais (TDRM). Há pouca informação disponível sobre o perfil epidemiológico molecular do HIV-1 no Norte do Brasil. Neste trabalho foi analisada a aplicabilidade de uma metodologia “in-house” para diagnóstico e caracterização molecular do DNA do HIV-1 associado à células de sangue periférico. Foram analisados 113 indivíduos virgens de tratamento, e com sorologia positiva para o HIV provenientes de diferentes municípios do Estado do Amapá. Foi possível amplificar e sequenciar os genes que codificam para a protease e para a transcriptase reversa viral em 97 (86%) dos 113 indivíduos analisados. A determinação do subtipo viral revelou que o clado mais prevalente do HIV-1 no Amapá foi o B (74%), seguido pelo subtipo F1 (14%), recombinantes BF1 (8%), subtipo C (1%), CRF31_BC (1%) e CRF02_AG (1 %). Apenas uma TDRM (K103N) foi detectada em um único paciente da nossa população de estudo. Concluiu-se que a metodologia in-house utilizada neste trabalho pode ser aplicada com sucesso na vigilância epidemiológica molecular da epidemia de HIV-1 no estado do Amapá. Este estudo revelou ainda que, a epidemia de HIV-1 no Amapá se caracteriza por um alto nível de diversidade genética, comparável ao observado nas principais cidades brasileiras, e uma baixa prevalência de TDRM (1%). Consequentemente, segundo as diretrizes da ONUSIDA não se faz necessário a implementação do teste de genotipagem de mutações de resistência antes da introdução da terapia antirretroviral na população de indivíduos infectados pelo HIV-1 no Amapá.
Abstract: The Brazilian HIV-1 epidemic in is a dynamic and complex phenomenon composed of a mosaic of regional sub-epidemics with a heterogeneous pattern of prevalence of distinct genetic forms of the virus as well as of transmitted drug resistance mutations (TDRM) to antiretrovirais. There is little information available on the molecular epidemiology of HIV-1 in northern Brazil. This work examined the applicability of an “in-house” methodology for diagnosis and molecular characterization of HIV-1 DNA associated to peripheral blood cells. We analyzed 113 drug-naïve HIV-1-infected individuals from different municipalities in the state of Amapá. We amplified and determined the sequence of the genes that encode the viral protease and reverse transcriptase in 97 (86%) out of 113 subjects analyzed. The determination of viral subtype revealed that the most prevalent HIV-1 clade in Amapá was B (74%), followed by subtype F1 (14%), recombinant BF1 (8%), subtype C (1%), CRF31_BC (1%) and CRF02_AG (1%). Only one TDRM (K103N) was detected in one patient from our study population. In conclusion, the in-house methodology used in this work could be successfully applied for the molecular epidemiological surveillance of the HIV-1 epidemic in the state of Amapá. This study also revealed that the HIV-1 epidemic in Amapá is characterized by a high level of genetic diversity, comparable to that observed in major Brazilian cities, and a low prevalence of TDRM (1%). Thus, the implementation of resistance genotyping tests before the introduction of antiretroviral therapy is not necessary for the population of HIV-1-infected individuals in Amapá according to the UNAIDS guidelines.
Keywords: HIV
Molecular Epidemiology
Resistance to Antiretroviral Agents
Epidemiological Monitoring
keywords: HIV-1
Epidemiologia Molecular
Resistência aos Antirretrovirais
Monitoramento Epidemiológico
DeCS: HIV-1
Epidemiologia Molecular
Antirretrovirais
Vigilância Epidemiológica
Issue Date: 2015
Citation: SILVA, L. A. Aplicabilidade de uma metodologia in-house de diagnóstico e caracterização molecular em uma população de indivíduos com sorologia positiva para HIV no estado do Amapá. 2015. 67 f. Dissertação (Mestrado Profissional em Vigilância Sanitária)-Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde, Fundação Oswaldo Cruz, Macapá, 2015.
Date of defense: 2015
Place of defense: Macapá/AP
Department: Coordenação de Pós-Graduação
Defense institution: Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde
Program: Programa de Pós-Graduação em Vigilância Sanitária
Copyright: open access
Appears in Collections:INCQS - Dissertações de Mestrado
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