Browsing Programa de Pós-Graduação em Biologia Computacional e Sistemas (PGBCS) by Title
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Estudo de reposicionamento de fármacos para doenças negligenciadas causadas por protozoários através da integração de bases de dados biológicas usando Web Semântica
| Date Issued: 2013A pesquisa e desenvolvimento de novos fármacos constituem um processo lento e oneroso. Novas técnicas têm sido propostas para agilizar esse processo. Uma dessas técnicas é chamada de reposicionamento de fármacos, cujo ... -
Estudo in silico da diversidade entre enzimas responsáveis pela resistência bacteriana a diferentes classes de antimicrobianos com foco principal em beta-lactamases
| Date Issued: 2018Bactérias podem se tornar resistentes à ação dos antibióticos por diferentes mecanismos, mas a produção de enzimas inativadoras é considerada o mecanismo mais eficiente e capaz de se disseminar com maior facilidade. Dentre ... -
Estudos in silico do comportamento dinâmico do receptor P2x7 humano
| Date Issued: 2015O receptor P2X7, contido na família de receptores P2, é um receptor inotrópico purinérgico, cátion seletivo, ativado por nucleotídeos (ATP). Esses receptores são expressos em células do sistema nervoso central, periférico ... -
Estudos moleculares da interação entre o Mycobacterium leprae e a célula de Schwann: uma abordagem de expressão gênica global
| Date Issued: 2011A hanseníase é uma doença infecciosa crônica causada pelo Mycobacterium leprae, onde tanto fatores do hospedeiro quanto ambientais têm papel no desfecho da doença. A hanseníase é uma das causas predominantes de incapacidade ... -
Exploração da diversidade genômica, taxonômica e funcional dos gêneros Wolbachia e Klebsiella
| Date Issued: 2016Abordagens filogenômicas, funcionais e taxonômicas in silico têm sido utilizadas na exploração da diversidade de espécies de microrganismos, na solução de relações filogenéticas e evolutivas, utilizando a informação genômica ... -
Filodinâmica das variantes não-pandêmicas do Vírus da Imunodeficiência Humana Tipo 1 Subtipo B no Brasil
| Date Issued: 2017No Brasil, estima-se que aproximadamente 830.000 pessoas estejam infectadas com o vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1), agente causador da síndrome da imunodeficiência adquirida (aids). O HIV-1 exibe um ... -
Filodinâmica de Elementos Transponíveis e seu uso no controle genético de vetores de doenças infecciosas
| Date Issued: 2012As doenças transmitidas por mosquitos têm grande custo de vidas e socio-econômico, especialmente em países tropicais em desenvolvimento, e por isso é uma prioridade para a Organização Mundial da Saúde. Novas propostas para ... -
Filogenômica do metabolismo de carboidratos em protozoa
| Date Issued: 2013As vias centrais do metabolismo são responsáveis tanto pela geração e armazenamento de energia, quanto pela formação dos precursores metabólicos que servem como ponto de partida para a biossíntese dos elementos fundamentais, ... -
Genoma de Rhodnius prolixus: predição gênica, conciliação com versões anteriores e disponibilização em navegador web
| Date Issued: 2022A doença de Chagas é uma doença tropical negligenciada que somente possui tratamento paliativo, logo, deve ser contida por medidas de urbanização e controle vetorial. O protozoário Trypanosoma cruzi, causador da doença, é ... -
GenoMycDB 2.0atualização de tecnologia e ampliação de escopo
| Date Issued: 2015Esta dissertação trata do desenvolvimento de uma nova versão do sistema GenoMycDB, desde a aquisição dos dados brutos até sua construção e análise dos resultados. Esta versão contempla a análise comparativa dos genomas de ... -
Genômica comparativa de protozoários
| Date Issued: 2013Os protozoários são definidos como organismos eucariotos unicelulares, e apresentam grande diversidade e variedade. Cerca de 200 mil espécies são descritas e quase 10.000 são parasitas. As espécies patogênicas causam doenças ... -
Genômica comparativa em ambiente computacional distribuídoaplicabilidade e potencial no estudo de homologia entre protozoários
| Date Issued: 2015A inferência de homologia entre organismos é uma atividade da genômica comparativa que possibilita compreender melhor a relação entre os mesmos e, por conseguinte, sua distância evolutiva. Especificamente, a identificação ... -
Identificação de alvos terapêuticos para a bactéria multirresistente P. aeruginosa CCBH4851 através da análise de redes metabólicas
| Date Issued: 2018Infecções relacionadas à assistência à saúde (IRAS) é um grave problema de saúde pública. Elas podem estar associadas à morbidade e mortalidade e são responsáveis pelos aumentos da hospitalização de pacientes. Neste contexto, ... -
Identificação in silico de potenciais alvos terapêuticos em protozoários: enzimas isofuncionais não homólogas
| Date Issued: 2014Protozoários são organismos unicelulares que causam várias doenças que atingem tanto humanos como animais. Essas doenças causam ônus econômicos principalmente em regiões tropicais e subtropicais. Atualmente, não existem ... -
Identificação in silico de potenciais inibidores da ribose 5-fosfato isomerase de Trypanosoma cruzi
| Date Issued: 2017A doença de Chagas, causada pelo protozoário Trypanosoma cruzi, afeta aproximadamente sete milhões de pessoas, principalmente na América Latina, e causa 7000 mortes ao ano. Os tratamentos disponíveis são insatisfatórios e ... -
O impacto de pequenas deleções genômicas em domínios protéicos identificadas a partir de dados de rna-seq de amostras de pacientes de adenocarcinoma de pulmão
| Date Issued: 2017Inserções e deleções (INDELs) são exemplos de alterações na sequência de DNA. As alterações causadas por deleções genômicas podem modificar nucleotídeos da região codificadora de proteínas com potencial para alterar os ... -
Integração de dados de expressão gênica global em tuberculose
| Date Issued: 2011A tuberculose (TB) continua sendo uma das principais doenças associadas à morbidade e mortalidade no mundo, correspondendo a 1,7 milhões de mortes somente em 2009. Cerca de um terço da população mundial está infectada com ... -
LASZLO @ GALAXY - Um protótipo de serviço de montagem de genomas a partir de dados de sequenciamento de próxima geração (NGS)
| Date Issued: 2012As tecnologias NGS (Next-Generation Sequencing), desenvolvidas para reduzir o custo e o tempo do processo de sequenciamento, geram uma grande massa de dados, a um custo relativamente baixo e com grande acurácia. No entanto, ... -
Melhoramento de docking-based virtual screening usando abordagem de deep learning
| Date Issued: 2017Funções de pontuação são um dos grandes problemas na metodologia de Docking- Based Virtual Screening - DBVS, pois elas não são capazes de classificar de forma confiável ligantes docados. Nesse trabalho propomos um novo ... -
Metagenômica na investigação de agentes infecciosos em amostras clínicas humanas
| Date Issued: 2016O vírus dengue infecta um número estimado de 50-100 milhões de pessoas 100 milhões de pessoas anualmente em todo o mundo e no Brasil, dengue foi relatada pela primeira vez em 1981, desde então, a infecção tornou-se ...