Caracterização taxonômica de fungos da seção fumigati, preservados na coleção de culturas de fungos filamentosos CCFF-FIOCRUZ

Abstract

As infecções relacionadas à assistência à saúde (IRAS), como a aspergilose, são um grave problema de saúde pública, que comprometem a segurança do paciente e a qualidade dos serviços de saúde. Causada por várias espécies de Aspergillus, especialmente o A. fumigatus, a aspergilose é uma condição iatrogênica com manifestações clínicas variadas, que afeta principalmente indivíduos imunocomprometidos. Considerando que o A. fumigatus é um patógeno fúngico prioritário e que existem espécies que são facilmente confundidas com ele ou que apresentam morfologia atípica, recomenda-se a identificação criteriosa das espécies da seção Fumigati. Por viabilizar a aquisição de culturas dessa seção, biobancos e coleções microbiológicas possibilitam pesquisas com cepas relevantes à saúde pública, mas entre os principais desafios que enfrentam está a manutenção de culturas viáveis, estáveis, puras e corretamente identificadas. Nesse contexto cepas de Aspergillus da seção Fumigati, preservadas na CCFF, provenientes de diversos substratos, incluindo ambientes hospitalares, tiveram sua viabilidade, estabilidade, pureza, características morfológicas e moleculares (taxonômica polifásica) avaliadas. Foram estudadas 57 cepas da seção Fumigati, preservadas na CCFF por até 62 anos, totalizando 133 subculturas: 85,71% (114) sob óleo mineral, 13,53% (18) liofilizadas e 0,75% (1) pelo método de Castellani. Entre as liofilizadas, 83,33% (15) permaneceram viáveis e estáveis, para um período de 4 a 18 anos, enquanto 16,67% (3) estavam não-viáveis após 19 anos. A única cepa avaliada pelo método de Castellani estava viável e estável. Das subculturas preservadas sob óleo mineral foi constatado que 48,25% (55) estavam viáveis e 51,75% (59) não-viáveis, para um período máximo de 50 anos e 62 anos, respectivamente. Dentre as subculturas viáveis, 11 subculturas preservadas sob óleo mineral apresentaram alterações morfológicas, que foram revertidas em 3 delas. Quanto à pureza obteve-se 68 subculturas puras de Aspergillus da seção Fumigati, preservadas de 1 a 50 anos. Após a caracterização taxonômica polifásica, todas as cepas foram identificadas como A. fumigatus, com exceção da IOC 4260, identificada como A. udagawae, e da IOC 4278, que ficou entre A. spinosus e A. laciniosus. Duas das principais chaves de identificação disponíveis para Aspergillius não foram suficientes na identificação das cepas IOC 4260 e a IOC 4278, já o marcador molecular β-tubulina não foi capaz de distinguir entre A. spinosus e A. laciniosus. A preservação através da liofilização e sob óleo mineral mostrou-se uma alternativa viável para conservação de fungos da seção Fumigati